Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
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91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 559 total aligned reads displayed.
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|
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ATCTCAATCAGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATC > SRR13214404.1003723/1‑150 (MQ=60)
ATCTCAATCAGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATC < SRR13214404.3419174/150‑1 (MQ=60)
TCTCAATCAGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCA < SRR13214404.1621810/150‑1 (MQ=60)
AATCAGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGC > SRR13214404.2031203/1‑150 (MQ=60)
ATCAGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCT < SRR13214404.3249792/150‑1 (MQ=60)
TCAGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTG < SRR13214404.3574317/150‑1 (MQ=60)
TCAGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTG < SRR13214404.1748090/150‑1 (MQ=60)
AGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGC < SRR13214404.1818769/150‑1 (MQ=60)
AGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGC > SRR13214404.4401308/1‑150 (MQ=60)
GGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCT < SRR13214404.2997718/150‑1 (MQ=60)
TGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTA > SRR13214404.2256179/1‑150 (MQ=60)
GACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTAC < SRR13214404.2125548/150‑1 (MQ=60)
GACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTACCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTAC < SRR13214404.3714149/150‑1 (MQ=60)
CCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGG < SRR13214404.4176636/150‑1 (MQ=60)
CAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGC > SRR13214404.1477045/1‑150 (MQ=60)
AATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCT < SRR13214404.3803612/150‑1 (MQ=60)
cgatctATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTT < SRR13214404.550419/144‑1 (MQ=60)
ATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTT > SRR13214404.781961/1‑150 (MQ=60)
ATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTC > SRR13214404.3738505/1‑150 (MQ=60)
CAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTT < SRR13214404.2453748/150‑1 (MQ=60)
CAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTT < SRR13214404.1440725/150‑1 (MQ=60)
CAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTT > SRR13214404.1484125/1‑150 (MQ=60)
ACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTA < SRR13214404.1404108/150‑1 (MQ=60)
ACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTA > SRR13214404.819661/1‑150 (MQ=60)
ACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTA > SRR13214404.794865/1‑150 (MQ=60)
CATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAA > SRR13214404.2057246/1‑150 (MQ=60)
ATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAAT > SRR13214404.3901441/1‑150 (MQ=60)
ATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAAT > SRR13214404.1666249/1‑150 (MQ=60)
ATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAAT > SRR13214404.1092960/1‑150 (MQ=60)
ATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAAT > SRR13214404.2071977/1‑150 (MQ=60)
TAATTACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATT > SRR13214404.1280026/1‑150 (MQ=60)
AATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTC < SRR13214404.1371649/150‑1 (MQ=60)
GACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACC > SRR13214404.2107979/1‑150 (MQ=60)
GACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACC > SRR13214404.1577890/1‑150 (MQ=60)
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ATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTT < SRR13214404.1274210/150‑1 (MQ=60)
TAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGC > SRR13214404.361395/1‑150 (MQ=60)
AAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCT < SRR13214404.2487289/150‑1 (MQ=60)
AGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCC < SRR13214404.1656330/150‑1 (MQ=60)
AGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCC < SRR13214404.1846015/150‑1 (MQ=60)
GTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATgattgtggcgtaaacagaataagcataggcaacggtaattcccattgta < SRR13214404.4422592/150‑50 (MQ=60)
GTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCG < SRR13214404.1702788/150‑1 (MQ=60)
GTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCG > SRR13214404.3182396/1‑150 (MQ=60)
TTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGC > SRR13214404.3212510/1‑150 (MQ=60)
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TTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAA < SRR13214404.3005708/150‑1 (MQ=60)
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ATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAG < SRR13214404.1685361/150‑1 (MQ=60)
TATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGA > SRR13214404.632797/1‑150 (MQ=60)
TATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGA < SRR13214404.2607076/150‑1 (MQ=60)
TATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGA < SRR13214404.446503/150‑1 (MQ=60)
TATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGA < SRR13214404.3118532/150‑1 (MQ=60)
TATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGA > SRR13214404.1895401/1‑150 (MQ=60)
ATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGAT > SRR13214404.447944/1‑150 (MQ=60)
ATGTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGAT < SRR13214404.512423/150‑1 (MQ=60)
GTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAA < SRR13214404.3934786/150‑1 (MQ=60)
GTCCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAA < SRR13214404.1133047/150‑1 (MQ=60)
TCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAAT < SRR13214404.4447035/150‑1 (MQ=60)
CCGTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATT > SRR13214404.2287748/1‑150 (MQ=60)
GTTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGT > SRR13214404.1053281/1‑150 (MQ=60)
GTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGT > SRR13214404.2571190/1‑150 (MQ=60)
GTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGT > SRR13214404.4731504/1‑150 (MQ=60)
TTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTA > SRR13214404.3177885/1‑150 (MQ=60)
TTAAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTA < SRR13214404.4143883/150‑1 (MQ=60)
TTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTA > SRR13214404.4360606/1‑150 (MQ=60)
TAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTAC > SRR13214404.1947422/1‑150 (MQ=60)
AAGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACC > SRR13214404.973410/1‑150 (MQ=60)
AAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACC < SRR13214404.4598663/150‑1 (MQ=60)
AAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACC > SRR13214404.4455031/1‑150 (MQ=60)
AGACTCATGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCA < SRR13214404.746478/150‑1 (MQ=60)
GACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCAA > SRR13214404.2221759/1‑150 (MQ=60)
ACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCAAG < SRR13214404.4276351/150‑1 (MQ=60)
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CATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCAAGTAT < SRR13214404.1955875/150‑1 (MQ=60)
ATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCAAGTATA < SRR13214404.3031864/150‑1 (MQ=60)
TGATTGTGGCGTAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCAAGgagaa > SRR13214404.4548306/1‑145 (MQ=60)
AATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCAAGTATAAG > SRR13214404.3454002/1‑150 (MQ=60)
AATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCAAGTATAAG < SRR13214404.1558400/150‑1 (MQ=60)
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TTTTTGGGAACAAGGCTTGCTAAATCTTTCAATGCATCGCCAGCACCCATGATTGCTTTCATCTCAATCAGGTGACCAATCAACATAATGACAATTAAAGTTGCCAGTTCAAACCAGAAGTTCATGCCCATATGTCCGTTAAGACTCATAATTGTGGCATAAACAGAATAAGCATAGGCAACGGTAATTCCCATTGTAATCAGCATCATCATGGCTGGCTTACGGCTTTTTAATTCACCTTTTGCTCCGCTAAAAAAAGGAGTCCCAGAGTAAAAGAAGATAATTGTACCAAGTATAAG > CP043523/480918‑481216
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
