Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
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Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
|
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148.0 |
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N/A
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BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 591 total aligned reads displayed.
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|
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TCTCATGGTTTTCGTGCTCCATATCCATTATTTCATGATTATGATGATGCTCAGACATCATTTCATCGTGCTTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGATTTCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAAT > SRR13214404.1435397/1‑150 (MQ=60)
TCATGATTTTCGTGCTTCATATCCACCATTTCATGATTGTGATGATGCTCAGACATCATTTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTG > SRR13214404.2076895/1‑150 (MQ=60)
CATGGTTTTCGTGCTCCATATCCATTATTTCATGATTATGATGATGCTCAGACATCATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGT < SRR13214404.1020283/150‑1 (MQ=60)
GGTTTTCGTGCTCCATATCCATTATTTCATGATTATGATGATGCTCAGACATCATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAA < SRR13214404.1039852/150‑1 (MQ=60)
TTTTCGTGCTCCATATCCATTATTTCATGATTATGATGATGCTCAGACATCATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAACTGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACT > SRR13214404.4278662/1‑150 (MQ=60)
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CTTCATATCCACCATTTCATGATTGTGATGATGCTCAGACATCATTTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGT > SRR13214404.2108795/1‑150 (MQ=60)
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CATATCCACCATTTCATGATTGTGATGATGCTCAGACATCATTTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAA > SRR13214404.2879223/1‑150 (MQ=60)
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ACATCATTTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATA < SRR13214404.1107046/150‑1 (MQ=60)
ACATCATTTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATA < SRR13214404.4571522/150‑1 (MQ=60)
ACATCATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATA < SRR13214404.2394650/150‑1 (MQ=60)
CATCATTTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAA < SRR13214404.2920088/150‑1 (MQ=60)
ATCATTTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAAT > SRR13214404.1999182/1‑150 (MQ=60)
CATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA < SRR13214404.2702533/150‑1 (MQ=60)
ATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑C < SRR13214404.18573/150‑1 (MQ=60)
ATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑C < SRR13214404.4339365/150‑1 (MQ=60)
ATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑C < SRR13214404.1416381/150‑1 (MQ=60)
TTTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtc < SRR13214404.828429/150‑3 (MQ=60)
TTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtct < SRR13214404.882050/150‑4 (MQ=60)
TTCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtct > SRR13214404.348921/1‑147 (MQ=60)
TCTTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAATCTA < SRR13214404.4070269/150‑1 (MQ=60)
TTCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctata < SRR13214404.4389833/150‑7 (MQ=60)
ATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAA < SRR13214404.3736364/150‑1 (MQ=60)
TCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctatag < SRR13214404.1774800/150‑8 (MQ=60)
CGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctatagg < SRR13214404.2786677/150‑9 (MQ=60)
CGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGG > SRR13214404.687200/1‑150 (MQ=60)
GTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATTCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctataggt > SRR13214404.4261525/1‑141 (MQ=60)
GTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctataggt < SRR13214404.2351564/150‑10 (MQ=60)
TGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctataggtt > SRR13214404.1059741/1‑140 (MQ=60)
GATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctataggttt > SRR13214404.3567077/1‑139 (MQ=60)
GATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTCACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTT > SRR13214404.1384847/1‑150 (MQ=60)
ATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctataggtttc < SRR13214404.4018815/150‑13 (MQ=60)
ATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTC > SRR13214404.4052255/1‑150 (MQ=60)
ATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACGACCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTC > SRR13214404.3109532/1‑150 (MQ=60)
TTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctataggtttct > SRR13214404.655584/1‑137 (MQ=60)
TAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTT < SRR13214404.478184/150‑1 (MQ=60)
ACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTG < SRR13214404.3821600/150‑1 (MQ=60)
CGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGT > SRR13214404.4289846/1‑150 (MQ=60)
CGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGT < SRR13214404.442136/150‑1 (MQ=60)
GAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAAtctataggtttcttttgta > SRR13214404.397681/1‑131 (MQ=60)
ATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGAC < SRR13214404.3347925/150‑1 (MQ=60)
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TTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAA < SRR13214404.152753/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAA < SRR13214404.156060/150‑1 (MQ=60)
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TTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAAT < SRR13214404.4457875/150‑1 (MQ=60)
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AAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCAT > SRR13214404.2684405/1‑150 (MQ=60)
AATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcata < SRR13214404.4271790/150‑18 (MQ=60)
ATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAG < SRR13214404.167474/150‑1 (MQ=60)
ATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAG > SRR13214404.1355919/1‑150 (MQ=60)
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TGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagt > SRR13214404.340519/1‑131 (MQ=60)
TGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagt < SRR13214404.846691/150‑20 (MQ=60)
GAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtc > SRR13214404.355538/1‑130 (MQ=60)
GAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcatgattaataatcatagat > SRR13214404.940534/1‑130 (MQ=60)
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GCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATAC < SRR13214404.2662233/150‑1 (MQ=60)
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TGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAAT < SRR13214404.1337015/150‑1 (MQ=60)
AATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaata < SRR13214404.887520/150‑32 (MQ=60)
AATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAA < SRR13214404.3240788/150‑1 (MQ=60)
ATTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataa > SRR13214404.4012228/1‑118 (MQ=60)
ATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAA < SRR13214404.1113146/150‑1 (MQ=60)
TTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataat > SRR13214404.4613328/1‑117 (MQ=60)
TTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataat > SRR13214404.1432082/1‑117 (MQ=60)
TTTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataat < SRR13214404.2409292/150‑34 (MQ=60)
TTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAA > SRR13214404.98846/1‑150 (MQ=60)
TTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAA < SRR13214404.3004301/150‑1 (MQ=60)
TTCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatc < SRR13214404.737754/150‑35 (MQ=60)
TTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAA < SRR13214404.406108/150‑1 (MQ=60)
TCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatca < SRR13214404.2339719/150‑36 (MQ=60)
TCTATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatca < SRR13214404.2440173/150‑36 (MQ=60)
CTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGT < SRR13214404.2994405/150‑1 (MQ=60)
CTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGT > SRR13214404.2537364/1‑150 (MQ=60)
TATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaac > SRR13214404.3601754/1‑113 (MQ=60)
TATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTA < SRR13214404.2952009/150‑1 (MQ=60)
ATCTATATATAGTTTACATTTGTACACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaact < SRR13214404.3444446/150‑39 (MQ=60)
ATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaact < SRR13214404.646941/150‑39 (MQ=60)
ATCTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaact > SRR13214404.3791455/1‑112 (MQ=60)
CTATATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactag > SRR13214404.3383883/1‑110 (MQ=60)
TATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGG > SRR13214404.3369530/1‑150 (MQ=60)
TATATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaa > SRR13214404.1098774/1‑107 (MQ=60)
ATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAA > SRR13214404.296715/1‑150 (MQ=60)
TATAGTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaatt < SRR13214404.3570796/150‑46 (MQ=60)
TAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAAGGA < SRR13214404.890703/150‑1 (MQ=60)
AGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAAGGAG < SRR13214404.3984922/150‑1 (MQ=60)
GTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaattcggg > SRR13214404.791197/1‑101 (MQ=54)
GTTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaattcggg > SRR13214404.4358764/1‑101 (MQ=54)
TTTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaattcgggt > SRR13214404.1309094/1‑100 (MQ=52)
TTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAAGGAGAG > SRR13214404.1005200/1‑150 (MQ=60)
TTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaattcgggtt > SRR13214404.2499040/1‑99 (MQ=50)
TTACATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaattcgggtt > SRR13214404.1030083/1‑99 (MQ=50)
ACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAAGGAGAGAAT < SRR13214404.3859513/150‑1 (MQ=60)
CAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAAGGAGAGAATA < SRR13214404.388748/150‑1 (MQ=60)
CAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAAGGAGAGAATA < SRR13214404.4044446/150‑1 (MQ=60)
CAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaattcgggtttaa < SRR13214404.2782423/150‑55 (MQ=60)
ATTTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAATTGTATTCTATAAATGTTACGAAATAATAA‑TCTATAGGTTTCTTTTGTAACTTAAATGTGATATcgcgatatataatcatagtcatggctaaataatcaactagcaattcgggtttaat < SRR13214404.4668824/150‑56 (MQ=50)
AATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAAGGAGAGAATAA < SRR13214404.1448119/150‑1 (MQ=60)
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ATCTCATGGTTTTCGTGCTCCATATCCATTATTTCATGATTATGATGATGCTCAGACATCATTTCATCGTGATTAGACGAATGAGTTTTATTTGACATATTTTCCTCCTAAATGAATGCTTTGAAATTTCTATCTATATATAGTTTACAATTGTAAACTATCAAAGTCAAGGAAAAAAGCTGTATTCTATAAATATTACAAAATAATAA‑CTAAAAGGTTTCTTTTGTGACTTAAATGTGATATTATAATATATATTCATAGCGATACCAATAAAAAAGTATCGGCAAGGAGAGAATAA > CP043523/481413‑481710
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |