Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 464 total aligned reads displayed.
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|
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CTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTT > SRR13214404.2596521/1‑150 (MQ=60)
TTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTT > SRR13214404.3732475/1‑150 (MQ=60)
TTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCCGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTC < SRR13214404.1405469/150‑1 (MQ=60)
TTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCA < SRR13214404.3205875/150‑1 (MQ=60)
ATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATA > SRR13214404.3406014/1‑150 (MQ=60)
ATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATA > SRR13214404.778914/1‑150 (MQ=60)
ATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATA > SRR13214404.4280334/1‑150 (MQ=60)
ATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATA < SRR13214404.2544527/150‑1 (MQ=60)
TTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAA < SRR13214404.903487/150‑1 (MQ=60)
TCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAAT < SRR13214404.552107/150‑1 (MQ=60)
TCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAAT < SRR13214404.549678/150‑1 (MQ=60)
TCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAAT < SRR13214404.1629186/150‑1 (MQ=60)
CAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATA > SRR13214404.395065/1‑150 (MQ=60)
CAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATA < SRR13214404.3661996/150‑1 (MQ=60)
AAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAT < SRR13214404.3212681/150‑1 (MQ=60)
AAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAG > SRR13214404.3674953/1‑150 (MQ=60)
AAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATA < SRR13214404.1879042/150‑1 (MQ=60)
AAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGA > SRR13214404.3312022/1‑150 (MQ=60)
AATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAG < SRR13214404.3353102/150‑1 (MQ=60)
AATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAG < SRR13214404.3373407/150‑1 (MQ=60)
ATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGA < SRR13214404.4646927/150‑1 (MQ=60)
ATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGA > SRR13214404.4491313/1‑150 (MQ=60)
ATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGA > SRR13214404.4687801/1‑150 (MQ=60)
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AATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATT > SRR13214404.1068023/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTA < SRR13214404.2757665/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAA > SRR13214404.3877345/1‑150 (MQ=60)
TTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAAT < SRR13214404.2485268/150‑1 (MQ=60)
TTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATA > SRR13214404.8179/1‑150 (MQ=60)
TTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATAT < SRR13214404.1333113/150‑1 (MQ=60)
TATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATT > SRR13214404.1194235/1‑150 (MQ=60)
ATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTGTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTC > SRR13214404.4229024/1‑150 (MQ=60)
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TCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTG < SRR13214404.1982104/150‑1 (MQ=60)
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CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTT < SRR13214404.2132825/150‑1 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTT > SRR13214404.1101160/1‑150 (MQ=60)
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TTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTA < SRR13214404.3758130/150‑1 (MQ=60)
TATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAA > SRR13214404.3478284/1‑150 (MQ=60)
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TTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAAT < SRR13214404.2800757/150‑1 (MQ=60)
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TAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATT > SRR13214404.3073172/1‑150 (MQ=60)
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TTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAG < SRR13214404.2580306/150‑1 (MQ=60)
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CTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAG < SRR13214404.3933276/150‑1 (MQ=60)
tagctttaaggcagtatatcctccccgTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGG < SRR13214404.1988823/123‑1 (MQ=60)
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CATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTT < SRR13214404.3130399/150‑1 (MQ=60)
CATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTT < SRR13214404.2341225/150‑1 (MQ=60)
ATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTC < SRR13214404.652524/150‑1 (MQ=60)
ATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTC > SRR13214404.1039137/1‑150 (MQ=60)
ATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTC > SRR13214404.1851161/1‑150 (MQ=60)
TTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCA < SRR13214404.1537185/150‑1 (MQ=60)
TCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCAT < SRR13214404.4577589/150‑1 (MQ=60)
CATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATC > SRR13214404.2348055/1‑150 (MQ=60)
CATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATC < SRR13214404.2868984/150‑1 (MQ=60)
ATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCA < SRR13214404.1873457/150‑1 (MQ=60)
ATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCA < SRR13214404.559307/150‑1 (MQ=60)
ATATCCTTATTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCA < SRR13214404.498149/150‑1 (MQ=60)
TCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCA > SRR13214404.1969399/1‑150 (MQ=60)
TCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCA > SRR13214404.4305568/1‑150 (MQ=60)
CTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAA > SRR13214404.2979142/1‑150 (MQ=60)
CTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAA < SRR13214404.2092958/150‑1 (MQ=60)
TTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAA > SRR13214404.3822886/1‑150 (MQ=60)
CTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAAC > SRR13214404.4504104/1‑150 (MQ=60)
CTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAAC > SRR13214404.4405170/1‑150 (MQ=60)
CTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAAC > SRR13214404.3251224/1‑150 (MQ=60)
CTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAAC > SRR13214404.2172402/1‑150 (MQ=60)
CTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTC > SRR13214404.798885/1‑150 (MQ=60)
CTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTC < SRR13214404.13190/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAG > SRR13214404.4420656/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAG > SRR13214404.2632083/1‑150 (MQ=60)
TTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGTGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGT > SRR13214404.1180310/1‑150 (MQ=60)
TTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGT < SRR13214404.1920432/150‑1 (MQ=60)
TTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGT < SRR13214404.710822/150‑1 (MQ=60)
TTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTA < SRR13214404.4661077/150‑1 (MQ=60)
TCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGT > SRR13214404.2264939/1‑150 (MQ=60)
TCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGT < SRR13214404.2458469/150‑1 (MQ=60)
ATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTC > SRR13214404.13821/1‑150 (MQ=60)
ATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTC > SRR13214404.4599695/1‑150 (MQ=60)
TAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACC < SRR13214404.2330983/150‑1 (MQ=60)
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GTCAAATCCCAAGTTAATTTTTCAGTAATTTCATTTCTATTCTTAGCCATGAAGCTCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCC > CP043523/1318893‑1319191
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
