Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
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90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 451 total aligned reads displayed.
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|
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GCTCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATT < SRR13214403.83307/150‑1 (MQ=60)
GCTCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATT < SRR13214403.81228/150‑1 (MQ=60)
GCTCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATT < SRR13214403.2545939/150‑1 (MQ=60)
TCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAA > SRR13214403.2699180/1‑150 (MQ=60)
CACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAA > SRR13214403.1425729/1‑150 (MQ=60)
ACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAA < SRR13214403.364349/150‑1 (MQ=60)
TCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAG < SRR13214403.2017126/150‑1 (MQ=60)
CCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGT < SRR13214403.42342/150‑1 (MQ=60)
CCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGT > SRR13214403.2695030/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTTAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTGCATTATAGCATAAAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTT < SRR13214403.1814177/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTT < SRR13214403.2218978/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTT < SRR13214403.3248561/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTT < SRR13214403.3165271/150‑1 (MQ=60)
TTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCA > SRR13214403.3040354/1‑150 (MQ=60)
TTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCA > SRR13214403.3327582/1‑150 (MQ=60)
TTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCA > SRR13214403.1875753/1‑150 (MQ=60)
TTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCA < SRR13214403.3859788/150‑1 (MQ=60)
TTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCA > SRR13214403.2955971/1‑150 (MQ=60)
TTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCA < SRR13214403.2003745/150‑1 (MQ=60)
TTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCA < SRR13214403.3859696/150‑1 (MQ=60)
TATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCAT < SRR13214403.657174/150‑1 (MQ=60)
TATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCAT < SRR13214403.1704771/150‑1 (MQ=60)
ATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATA > SRR13214403.4294630/1‑150 (MQ=60)
ATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATA < SRR13214403.2190593/150‑1 (MQ=60)
TTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGGTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAA > SRR13214403.4077999/1‑150 (MQ=60)
TCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAAT > SRR13214403.3620969/1‑150 (MQ=60)
TCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAAT < SRR13214403.3025904/150‑1 (MQ=60)
CAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATA < SRR13214403.1952895/150‑1 (MQ=60)
AAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAT > SRR13214403.3903213/1‑150 (MQ=60)
AAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATA < SRR13214403.1495533/150‑1 (MQ=60)
AAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGA < SRR13214403.2034613/150‑1 (MQ=60)
AATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAG < SRR13214403.2316040/150‑1 (MQ=60)
AATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAGATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAG > SRR13214403.3596301/1‑150 (MQ=60)
TAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCAGAATAGAGAT < SRR13214403.107795/150‑1 (MQ=60)
AATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATT > SRR13214403.2303368/1‑150 (MQ=60)
AATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATT > SRR13214403.1481518/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTA > SRR13214403.1163341/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTA < SRR13214403.857507/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAA < SRR13214403.2378974/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAAT < SRR13214403.3128023/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAAT > SRR13214403.3433196/1‑150 (MQ=60)
TTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATA > SRR13214403.109130/1‑150 (MQ=60)
TTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATAT < SRR13214403.97542/150‑1 (MQ=60)
TATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATT < SRR13214403.1444641/150‑1 (MQ=60)
ATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTC < SRR13214403.402171/150‑1 (MQ=60)
TCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTG > SRR13214403.2633934/1‑150 (MQ=60)
ACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTACATAATAGAGATTAATATTCTGCT > SRR13214403.3964253/1‑150 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTT < SRR13214403.2643779/150‑1 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTT > SRR13214403.1829637/1‑150 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTT > SRR13214403.3217577/1‑150 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTT < SRR13214403.4223798/150‑1 (MQ=60)
CATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTT < SRR13214403.3265863/150‑1 (MQ=60)
cgatctTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTCTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATT < SRR13214403.3609136/144‑1 (MQ=60)
AAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTCCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGACTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATCAAAAAGTTTTCATAATAGATATTAATATTCTGCTTAATT > SRR13214403.2408210/1‑150 (MQ=60)
AAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTT < SRR13214403.3003087/150‑1 (MQ=60)
AAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTG > SRR13214403.2766199/1‑150 (MQ=60)
ACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAG > SRR13214403.1982668/1‑150 (MQ=60)
CTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGT > SRR13214403.2865777/1‑150 (MQ=60)
CTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGT < SRR13214403.47641/150‑1 (MQ=60)
cggtggtcgccatcatTTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAA > SRR13214403.3114907/17‑150 (MQ=60)
TATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAA < SRR13214403.1258271/150‑1 (MQ=60)
ATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAA < SRR13214403.4422063/150‑1 (MQ=60)
TTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAAT < SRR13214403.413468/150‑1 (MQ=60)
TTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATGTGAGTAAAT > SRR13214403.3680119/1‑150 (MQ=60)
TAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATCTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATT < SRR13214403.3024805/150‑1 (MQ=60)
TAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATT < SRR13214403.1565986/150‑1 (MQ=60)
GCAGAATTTCATTCATTCATATCGTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTA < SRR13214403.4474377/150‑1 (MQ=60)
CAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTAT > SRR13214403.2292890/1‑150 (MQ=60)
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AGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATG < SRR13214403.3091960/150‑1 (MQ=60)
AATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTA > SRR13214403.1841410/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAA > SRR13214403.1197921/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAA > SRR13214403.4560672/1‑150 (MQ=60)
TTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAA < SRR13214403.1779795/150‑1 (MQ=60)
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ATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGA > SRR13214403.976606/1‑150 (MQ=60)
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TTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCA > SRR13214403.2760006/1‑150 (MQ=60)
TTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCA < SRR13214403.1358494/150‑1 (MQ=60)
TTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCA < SRR13214403.1910553/150‑1 (MQ=60)
TCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCAT < SRR13214403.356868/150‑1 (MQ=60)
TCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCAT > SRR13214403.751830/1‑150 (MQ=60)
ATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCA > SRR13214403.3864874/1‑150 (MQ=60)
ATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCA > SRR13214403.1602308/1‑150 (MQ=60)
ATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCA < SRR13214403.2365288/150‑1 (MQ=60)
ATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCA > SRR13214403.627097/1‑150 (MQ=60)
TATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCAT < SRR13214403.2477632/150‑1 (MQ=60)
TATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCAT < SRR13214403.1733092/150‑1 (MQ=60)
ATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATC < SRR13214403.1710663/150‑1 (MQ=60)
ATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATC > SRR13214403.479076/1‑150 (MQ=60)
CTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAA > SRR13214403.4495996/1‑150 (MQ=60)
TCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAA > SRR13214403.2257650/1‑150 (MQ=60)
CTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAAC < SRR13214403.2132882/150‑1 (MQ=60)
TCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTT > SRR13214403.4387908/1‑150 (MQ=60)
TCTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGGAAATTAATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTT > SRR13214403.4393009/1‑150 (MQ=60)
CTGCTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTC > SRR13214403.181060/1‑150 (MQ=60)
GCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAA > SRR13214403.1720203/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAG > SRR13214403.3550712/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAG < SRR13214403.4080742/150‑1 (MQ=60)
TTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGT > SRR13214403.3510509/1‑150 (MQ=60)
TTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTA < SRR13214403.4394582/150‑1 (MQ=60)
TTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTA < SRR13214403.346601/150‑1 (MQ=60)
TTCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAG < SRR13214403.4447292/150‑1 (MQ=60)
TCATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTCAAGTTATGTAAAGGGATTTCATGATCAAAGACGTCAAGTAAGT > SRR13214403.4381080/1‑150 (MQ=60)
CATTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTT > SRR13214403.143655/1‑150 (MQ=60)
TTATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCA > SRR13214403.1512557/1‑150 (MQ=60)
ATAGCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATCTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAAT < SRR13214403.3498817/150‑1 (MQ=60)
TAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACC < SRR13214403.4037747/150‑1 (MQ=60)
TAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACC > SRR13214403.3921452/1‑150 (MQ=60)
AACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCC > SRR13214403.2662272/1‑150 (MQ=60)
GCATAGAAACGGGGAGGATATACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATATAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAATCCC < SRR13214403.3752827/150‑1 (MQ=60)
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GTCAAATCCCAAGTTAATTTTTCAGTAATTTCATTTCTATTCTTAGCCATGAAGCTCACTCCTTTTTATTCAAAATAATTTTTATTCACATTAAAAACTTATTAGCAGAATTTCATTCATTCATATCCTTCTTCTGCTTTTTCATTATAACATAGAAACGGGGAGGATAGACTGCCTTAAAGCTATTTTGCTGAAAATTTATTAAAAAGTTTTCATAATAGAGATTAATATTCTGCTTAATTTGAGTAAATTTATGTAAAGGGATTTCATCATCAAAAACTTCAAGTAAGTTCAACCCC > CP043523/1318893‑1319191
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |