Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 571 total aligned reads displayed.
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|
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TTGCTGTTTGAATTGATTTTGGCGAATCTACTTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTT < SRR13214404.4072936/150‑1 (MQ=60)
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TTTGAATTGATTTTGGCGAATCTACTTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGattag > SRR13214404.3808341/1‑145 (MQ=60)
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ATTGATTTTGGCGAATCTACTTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTT > SRR13214404.302553/1‑150 (MQ=60)
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CTACTTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAA > SRR13214404.268972/1‑150 (MQ=60)
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CTTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAA > SRR13214404.3006702/1‑150 (MQ=60)
TTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAG < SRR13214404.3281277/150‑1 (MQ=60)
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AAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAAT > SRR13214404.1208042/1‑150 (MQ=60)
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AACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCA > SRR13214404.730833/1‑150 (MQ=60)
AACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCA < SRR13214404.2394031/150‑1 (MQ=60)
ACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAG > SRR13214404.1907624/1‑150 (MQ=60)
CATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGC > SRR13214404.1234201/1‑150 (MQ=60)
ATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAacg > SRR13214404.4106564/1‑147 (MQ=60)
TTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTC > SRR13214404.1231652/1‑150 (MQ=60)
TTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCA < SRR13214404.1409283/150‑1 (MQ=60)
TTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAA > SRR13214404.4642418/1‑150 (MQ=60)
TTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAA > SRR13214404.46221/1‑150 (MQ=60)
TTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAA < SRR13214404.1858239/150‑1 (MQ=60)
TTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAA > SRR13214404.1992975/1‑150 (MQ=60)
TTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAA < SRR13214404.3662218/150‑1 (MQ=60)
TTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAA > SRR13214404.2440947/1‑150 (MQ=60)
TAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAAT > SRR13214404.443732/1‑150 (MQ=60)
AAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATC > SRR13214404.590661/1‑150 (MQ=60)
AGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCAC > SRR13214404.4092652/1‑150 (MQ=60)
GTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACG > SRR13214404.2764268/1‑150 (MQ=60)
TCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGT < SRR13214404.2916555/150‑1 (MQ=60)
TCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGT > SRR13214404.2418683/1‑150 (MQ=60)
CAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTT > SRR13214404.2481563/1‑150 (MQ=60)
AATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTG > SRR13214404.4368136/1‑150 (MQ=60)
AATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTG > SRR13214404.4611597/1‑150 (MQ=60)
ATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGA > SRR13214404.2747511/1‑150 (MQ=60)
CAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGT > SRR13214404.567563/1‑150 (MQ=60)
CAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGT > SRR13214404.4245209/1‑150 (MQ=60)
AACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTAT < SRR13214404.1782283/150‑1 (MQ=60)
ACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATT > SRR13214404.3978685/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA < SRR13214404.4662098/150‑1 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA < SRR13214404.686512/150‑1 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA > SRR13214404.4547594/1‑150 (MQ=60)
AACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGA < SRR13214404.3624723/150‑1 (MQ=60)
ACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAA < SRR13214404.2380288/150‑1 (MQ=60)
ACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAA > SRR13214404.2865425/1‑150 (MQ=60)
CAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAA < SRR13214404.2770518/150‑1 (MQ=60)
AGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAA < SRR13214404.3053509/150‑1 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCCATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.2792608/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.3896/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.1674874/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC < SRR13214404.3821427/150‑1 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.991166/1‑150 (MQ=60)
GTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAAC > SRR13214404.3332292/1‑150 (MQ=60)
TTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACG < SRR13214404.2213085/150‑1 (MQ=60)
TAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGT > SRR13214404.1371994/1‑150 (MQ=60)
GCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTA < SRR13214404.2895344/150‑1 (MQ=60)
CCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAG < SRR13214404.324763/150‑1 (MQ=60)
CCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAG > SRR13214404.699149/1‑150 (MQ=60)
CATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAACCCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGA < SRR13214404.1339531/150‑1 (MQ=60)
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ATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAG > SRR13214404.4042956/1‑150 (MQ=60)
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TTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAAT < SRR13214404.1102471/150‑1 (MQ=60)
TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTC > SRR13214404.459798/1‑150 (MQ=60)
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TGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATA > SRR13214404.2230030/1‑150 (MQ=60)
GTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCT > SRR13214404.1610540/1‑150 (MQ=60)
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GTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTA < SRR13214404.2605920/150‑1 (MQ=60)
GTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTA < SRR13214404.4509528/150‑1 (MQ=60)
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ACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATT > SRR13214404.1984766/1‑150 (MQ=60)
ATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTC > SRR13214404.1012714/1‑150 (MQ=60)
ATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTC < SRR13214404.710114/150‑1 (MQ=60)
AATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCAT > SRR13214404.1750328/1‑150 (MQ=60)
AATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCAT > SRR13214404.4573856/1‑150 (MQ=60)
TCAAGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTA < SRR13214404.969632/150‑1 (MQ=60)
TCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTA < SRR13214404.446696/150‑1 (MQ=60)
AAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAAC > SRR13214404.2076856/1‑150 (MQ=60)
AAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAAC > SRR13214404.1133948/1‑150 (MQ=60)
AGGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACG < SRR13214404.4728007/150‑1 (MQ=60)
AGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACG < SRR13214404.3380592/150‑1 (MQ=60)
AGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACG > SRR13214404.468909/1‑150 (MQ=60)
GGTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGCGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGA > SRR13214404.2850999/1‑150 (MQ=60)
GTCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGAC > SRR13214404.2865984/1‑150 (MQ=60)
TCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACA < SRR13214404.3754096/150‑1 (MQ=60)
TCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACA > SRR13214404.255878/1‑150 (MQ=60)
TCATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACA < SRR13214404.1633991/150‑1 (MQ=60)
CATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAG < SRR13214404.3520280/150‑1 (MQ=60)
ATGATAATGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGT > SRR13214404.3387263/1‑150 (MQ=60)
NATAATGNATANCACCTTTNTGGNGAGCATTTGCCACTTGTGGNGGAAGAAGNTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACNGCANCAGCNGTCAAATCACGTTGAGTNTTGAAAACGTTANAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTN < SRR13214404.2304541/150‑1 (MQ=60)
GATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTT > SRR13214404.838637/1‑150 (MQ=60)
GATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTT > SRR13214404.4201641/1‑150 (MQ=60)
GATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTT < SRR13214404.2326445/150‑1 (MQ=60)
ATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTG < SRR13214404.3772455/150‑1 (MQ=60)
TAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGACACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGG > SRR13214404.1150224/1‑150 (MQ=60)
TAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGG < SRR13214404.3060714/150‑1 (MQ=60)
AATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCATTGTAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTATCATTTTCATTAACGACAGGTTGGT > SRR13214404.3839590/1‑150 (MQ=60)
ATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTC > SRR13214404.2057461/1‑150 (MQ=60)
ATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTC < SRR13214404.3865656/150‑1 (MQ=60)
TGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCG < SRR13214404.3466492/150‑1 (MQ=60)
TGAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCG > SRR13214404.2365555/1‑150 (MQ=60)
GAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGC > SRR13214404.3421530/1‑150 (MQ=60)
GAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGC > SRR13214404.2834313/1‑150 (MQ=60)
GAATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGC > SRR13214404.1195481/1‑150 (MQ=60)
AATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCG < SRR13214404.1222352/150‑1 (MQ=60)
AATATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCG > SRR13214404.2186246/1‑150 (MQ=60)
TATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGAT < SRR13214404.484412/150‑1 (MQ=60)
ATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATT < SRR13214404.848598/150‑1 (MQ=60)
ATCACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATT < SRR13214404.3744886/150‑1 (MQ=60)
ATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATT < SRR13214404.3485915/150‑1 (MQ=60)
ATCACCCTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATT < SRR13214404.4347312/150‑1 (MQ=60)
CACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAA > SRR13214404.1404566/1‑150 (MQ=60)
ACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT < SRR13214404.2143859/150‑1 (MQ=60)
ACCTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT > SRR13214404.2587748/1‑150 (MQ=60)
ACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAAT < SRR13214404.3683869/150‑1 (MQ=60)
CCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATT > SRR13214404.2799039/1‑150 (MQ=60)
CCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATT > SRR13214404.2636130/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTGGTGAGCATTTGCCACTTGTGGCGGAAGAAGTTTCAATCCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAGTCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTA < SRR13214404.4671487/150‑1 (MQ=60)
CCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTA > SRR13214404.2513860/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA > SRR13214404.609508/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA > SRR13214404.1063436/1‑150 (MQ=60)
|
GCAGTTGCTGTTTGAATTGATTTTGGCGAATCTACTTGCGCATTTCCAAGTTTAAAACCATTTTCAAACATATTTTTAAAGTCAATCAAACAACAGTTAGCCATTGTAGTAAATGGACTATAATCAAGGTCATGATAATGAATATCACCCTTTTGGTGAGCGTTTGCCACATGTGGCGGAAGAAGTTTCAAACCAATTGCTTTGGAAACCGCACCAGCTGTCAAATCACGTTGAGTATTGAAAACGTTAGAATCTTTATTGGCATTTTCATTAACGACAGTTTGGTCGCGATTAATTAA > CP043523/1706961‑1707259
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
