Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F83 I1 R1
|
393 |
530.9 |
9427126 |
91.1% |
8588111 |
148.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 311 total aligned reads displayed.
GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAATTAATAATACCATATACCCGAATTGCTAGTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGG > CP043523/1848460‑1848758
|
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GACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTC < SRR13214404.1802716/150‑1 (MQ=60)
CCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCAT < SRR13214404.174034/150‑1 (MQ=60)
TCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAA < SRR13214404.1917471/150‑1 (MQ=60)
AGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATT < SRR13214404.2259449/150‑1 (MQ=60)
AGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATT > SRR13214404.127613/1‑150 (MQ=60)
AGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATT < SRR13214404.2258848/150‑1 (MQ=60)
GCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTA < SRR13214404.4045038/150‑1 (MQ=60)
GCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTA < SRR13214404.3356535/150‑1 (MQ=60)
AGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCAAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGG > SRR13214404.137246/1‑150 (MQ=60)
GTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGG < SRR13214404.1997959/150‑1 (MQ=60)
GTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGG < SRR13214404.3576804/150‑1 (MQ=60)
GTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGG < SRR13214404.3569749/150‑1 (MQ=60)
TTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGG < SRR13214404.4349620/150‑1 (MQ=60)
TAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGgt < SRR13214404.2154473/150‑3 (MQ=60)
TAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGAAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAtggtc > SRR13214404.1984316/1‑145 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCA > SRR13214404.1587254/1‑150 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCA > SRR13214404.346872/1‑150 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCA < SRR13214404.408997/150‑1 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCA > SRR13214404.3640290/1‑150 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCA > SRR13214404.306613/1‑150 (MQ=60)
ATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAC > SRR13214404.2300726/1‑150 (MQ=60)
ATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAC > SRR13214404.1617110/1‑150 (MQ=60)
ATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCAC > SRR13214404.3625822/1‑150 (MQ=60)
TATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACT > SRR13214404.3771312/1‑150 (MQ=60)
TATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACT > SRR13214404.3771243/1‑150 (MQ=60)
TATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACT > SRR13214404.11779/1‑150 (MQ=60)
ATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATaaggggcagtt > SRR13214404.3191670/1‑139 (MQ=60)
ATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTT > SRR13214404.3107037/1‑150 (MQ=60)
TCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTT > SRR13214404.2859358/1‑150 (MQ=60)
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TCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTT > SRR13214404.541972/1‑150 (MQ=60)
CACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTA < SRR13214404.3076100/150‑1 (MQ=60)
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CAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAT > SRR13214404.1307795/1‑150 (MQ=60)
AAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATA < SRR13214404.2087243/150‑1 (MQ=60)
AAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATA < SRR13214404.3856719/150‑1 (MQ=60)
AAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATA < SRR13214404.1796724/150‑1 (MQ=60)
AAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATA < SRR13214404.2963907/150‑1 (MQ=60)
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GCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGA < SRR13214404.575794/150‑1 (MQ=60)
GCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGA < SRR13214404.3502752/150‑1 (MQ=60)
CATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTGAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAG < SRR13214404.3865227/150‑1 (MQ=60)
CATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGTTATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACACACACTTCCCTTTGCGTAAATTAGGGCCACTCTTTTATAGA < SRR13214404.1092827/150‑1 (MQ=52)
CATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAG < SRR13214404.2350984/150‑1 (MQ=60)
ATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGT < SRR13214404.2616144/150‑1 (MQ=60)
ATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGT < SRR13214404.5697/150‑1 (MQ=60)
ATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGT > SRR13214404.3002503/1‑150 (MQ=60)
TAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTGAATATAGAGTG > SRR13214404.4033694/1‑150 (MQ=60)
AATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGG < SRR13214404.4445256/150‑1 (MQ=60)
AATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGG < SRR13214404.3533535/150‑1 (MQ=60)
AATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGG > SRR13214404.1351859/1‑150 (MQ=60)
ATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGT < SRR13214404.3859622/150‑1 (MQ=60)
TGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTT > SRR13214404.3524920/1‑150 (MQ=60)
TGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTT < SRR13214404.2515132/150‑1 (MQ=60)
TGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTT > SRR13214404.1694640/1‑150 (MQ=60)
GTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTT > SRR13214404.3607911/1‑150 (MQ=60)
GTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGCTTTTTTATATTCAGTTGCAATTAGGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGaggccctttaatatagagcggtttc > SRR13214404.4648309/1‑125 (MQ=60)
TATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTT < SRR13214404.2464649/150‑1 (MQ=60)
TCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTT > SRR13214404.4576783/1‑150 (MQ=60)
TCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTT < SRR13214404.1026206/150‑1 (MQ=60)
CTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTA > SRR13214404.3862764/1‑150 (MQ=60)
CTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTA > SRR13214404.3487698/1‑150 (MQ=60)
TGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCATTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACATCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAA > SRR13214404.4271708/1‑150 (MQ=60)
AAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGT < SRR13214404.529772/150‑1 (MQ=60)
AATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTT < SRR13214404.4451266/150‑1 (MQ=60)
ATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTT > SRR13214404.2952641/1‑150 (MQ=60)
ATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTT < SRR13214404.4129011/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGCGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTA < SRR13214404.1038088/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTA < SRR13214404.4680046/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTA < SRR13214404.4681825/150‑1 (MQ=60)
CGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAT > SRR13214404.3704394/1‑150 (MQ=60)
CGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAT < SRR13214404.2531094/150‑1 (MQ=60)
GTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATT < SRR13214404.907956/150‑1 (MQ=60)
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TGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTA < SRR13214404.4057598/150‑1 (MQ=60)
GCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAA > SRR13214404.3345153/1‑150 (MQ=60)
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AAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATT < SRR13214404.4174146/150‑1 (MQ=60)
AAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATT < SRR13214404.4580200/150‑1 (MQ=60)
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AAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTA < SRR13214404.681666/150‑1 (MQ=60)
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AACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAA < SRR13214404.637263/150‑1 (MQ=60)
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ATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTCGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaccacctatcactgcacataacgattacct > SRR13214404.1426540/1‑106 (MQ=60)
ATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagca < SRR13214404.3673260/150‑45 (MQ=60)
ATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagca < SRR13214404.189042/150‑45 (MQ=60)
ACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagt > SRR13214404.494285/1‑104 (MQ=60)
CTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtt > SRR13214404.3281335/1‑103 (MQ=60)
CTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtt > SRR13214404.2037199/1‑103 (MQ=60)
CTTAGACAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtt < SRR13214404.1774717/150‑48 (MQ=60)
AGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagttttt > SRR13214404.2940247/1‑100 (MQ=60)
AGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagttttt > SRR13214404.2940215/1‑100 (MQ=60)
CAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggt > SRR13214404.299098/1‑97 (MQ=60)
CAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggt > SRR13214404.192914/1‑97 (MQ=60)
CAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgca < SRR13214404.1701703/150‑57 (MQ=60)
CAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgca > SRR13214404.262347/1‑94 (MQ=60)
CAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgca > SRR13214404.2864123/1‑94 (MQ=60)
AAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcat > SRR13214404.2031816/1‑93 (MQ=60)
AGATGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatg > SRR13214404.2972745/1‑92 (MQ=60)
AGAGGAAGCTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGACCCTTTAATATAGAATGGTTTTTTTATTGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatgaacgaacataatgataagcagtttttggtgtctg > SRR13214404.1724246/1‑92 (MQ=60)
AGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatg < SRR13214404.1070818/150‑59 (MQ=60)
AGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatg < SRR13214404.1071390/150‑59 (MQ=60)
GAGGAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgt < SRR13214404.3273427/150‑60 (MQ=60)
GAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttca < SRR13214404.292053/150‑63 (MQ=60)
GAAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttca < SRR13214404.825547/150‑63 (MQ=60)
AAACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcat < SRR13214404.1171620/150‑64 (MQ=60)
AACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcata < SRR13214404.2346593/150‑65 (MQ=60)
ACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatag > SRR13214404.3046497/1‑85 (MQ=60)
ACTCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatag > SRR13214404.3036928/1‑85 (MQ=60)
TCACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagat < SRR13214404.2304353/150‑68 (MQ=60)
ACACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagatta > SRR13214404.4644008/1‑81 (MQ=60)
ACTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaag > SRR13214404.3514714/1‑79 (MQ=60)
CTTCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaaga > SRR13214404.2425371/1‑78 (MQ=60)
TCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaag > SRR13214404.4291472/1‑76 (MQ=60)
TCCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaag < SRR13214404.825341/150‑75 (MQ=60)
CCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagt > SRR13214404.3154283/1‑75 (MQ=60)
CCC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagt < SRR13214404.1000636/150‑76 (MQ=60)
CC‑ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagtt > SRR13214404.1851155/1‑74 (MQ=60)
ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaa > SRR13214404.1665508/1‑72 (MQ=60)
ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaaaaagttaa > SRR13214404.1667767/1‑72 (MQ=60)
TTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaat > SRR13214404.2763227/1‑71 (MQ=60)
TTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaat > SRR13214404.2761973/1‑71 (MQ=60)
TCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaata > SRR13214404.2405338/1‑70 (MQ=60)
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GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCC‑ATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAATTAATAATACCATATACCCGAATTGCTAGTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGG > CP043523/1848460‑1848758
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |