Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 293 total aligned reads displayed.
GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAATTAATAATACCATATACCCGAATTGCTAGTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGG > CP043523/1848460‑1848758
|
GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTGTCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATT > SRR13214403.1011104/1‑150 (MQ=60)
GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATT > SRR13214403.1011324/1‑150 (MQ=60)
GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATT > SRR13214403.1011451/1‑150 (MQ=60)
GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATT < SRR13214403.1989882/150‑1 (MQ=60)
GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATT < SRR13214403.1989842/150‑1 (MQ=60)
GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATT > SRR13214403.3231774/1‑150 (MQ=60)
GACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTC > SRR13214403.2046696/1‑150 (MQ=60)
GACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTC < SRR13214403.441922/150‑1 (MQ=60)
ACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCA > SRR13214403.1703443/1‑150 (MQ=60)
CCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGACAATCGTGCAAACACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAT < SRR13214403.1748814/150‑1 (MQ=60)
CCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAT < SRR13214403.245545/150‑1 (MQ=60)
CCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAT < SRR13214403.1748317/150‑1 (MQ=60)
CCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAT < SRR13214403.3750455/150‑1 (MQ=60)
CCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAAATGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCAT < SRR13214403.224689/150‑1 (MQ=60)
CTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGCCTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTTCCATTCATA > SRR13214403.2199054/1‑150 (MQ=60)
TCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAA < SRR13214403.4139039/150‑1 (MQ=60)
CAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAA > SRR13214403.1116253/1‑150 (MQ=60)
AAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAAT < SRR13214403.88089/150‑1 (MQ=60)
AAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAAT < SRR13214403.80009/150‑1 (MQ=60)
AGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATT > SRR13214403.1099138/1‑150 (MQ=60)
GCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTA < SRR13214403.870311/150‑1 (MQ=60)
GCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTA > SRR13214403.4531861/1‑150 (MQ=60)
GCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTA > SRR13214403.704816/1‑150 (MQ=60)
AGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGG > SRR13214403.3876764/1‑150 (MQ=60)
GTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGG > SRR13214403.6952/1‑150 (MQ=60)
GTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGG < SRR13214403.1244394/150‑1 (MQ=60)
GTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGG > SRR13214403.1882383/1‑150 (MQ=60)
GTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGG < SRR13214403.2402432/150‑1 (MQ=60)
TTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGG < SRR13214403.3307828/150‑1 (MQ=60)
TTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGG > SRR13214403.820210/1‑150 (MQ=60)
TTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGG < SRR13214403.3309750/150‑1 (MQ=60)
TAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGC > SRR13214403.1500762/1‑150 (MQ=60)
TAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGC < SRR13214403.4262777/150‑1 (MQ=60)
TAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGC > SRR13214403.2682500/1‑150 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAATAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCA < SRR13214403.4493791/150‑1 (MQ=60)
AATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCA > SRR13214403.4425287/1‑150 (MQ=60)
ATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTT > SRR13214403.3117399/1‑150 (MQ=60)
ATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTT < SRR13214403.435517/150‑1 (MQ=60)
CACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTA > SRR13214403.3154431/1‑150 (MQ=60)
ACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAA > SRR13214403.1806775/1‑150 (MQ=60)
CAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAAT > SRR13214403.316034/1‑150 (MQ=60)
AAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATA < SRR13214403.4139990/150‑1 (MQ=60)
AAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATA > SRR13214403.3708921/1‑150 (MQ=60)
AAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATA > SRR13214403.2911670/1‑150 (MQ=60)
AAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATAT > SRR13214403.4088851/1‑150 (MQ=60)
AAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATAT < SRR13214403.3384746/150‑1 (MQ=60)
AAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATAT > SRR13214403.356471/1‑150 (MQ=60)
AGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAG < SRR13214403.616655/150‑1 (MQ=60)
GCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGA < SRR13214403.2973317/150‑1 (MQ=60)
GCATAATTCTATCTGAAAATCCTGCATAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGA < SRR13214403.3883538/150‑1 (MQ=60)
CATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAG < SRR13214403.1856663/150‑1 (MQ=60)
ATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAGTTAGGGGCACTTTAATATAGAGT > SRR13214403.4444355/1‑150 (MQ=60)
ATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGT < SRR13214403.1129694/150‑1 (MQ=60)
TAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTG < SRR13214403.4192800/150‑1 (MQ=60)
AATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGG > SRR13214403.129110/1‑150 (MQ=60)
ATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGT > SRR13214403.1952655/1‑150 (MQ=60)
ATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGT < SRR13214403.2117530/150‑1 (MQ=60)
TTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTT > SRR13214403.1084384/1‑150 (MQ=60)
TGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTT > SRR13214403.2768081/1‑150 (MQ=60)
TGTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTT > SRR13214403.1425869/1‑150 (MQ=60)
GTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATGTAGAGTGGTTTT > SRR13214403.3407550/1‑150 (MQ=60)
GTATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTT > SRR13214403.4252128/1‑150 (MQ=60)
TATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCAGACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTT > SRR13214403.3593565/1‑150 (MQ=60)
ATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTT > SRR13214403.2275175/1‑150 (MQ=60)
ATCTGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTT > SRR13214403.2273422/1‑150 (MQ=60)
TGAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAA > SRR13214403.4303039/1‑150 (MQ=60)
GAAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAAT < SRR13214403.244503/150‑1 (MQ=60)
AAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATG < SRR13214403.2227701/150‑1 (MQ=60)
AAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATG < SRR13214403.821070/150‑1 (MQ=60)
AAAATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATG < SRR13214403.3939068/150‑1 (MQ=60)
gcaagggtatagccattgaccgcattattaatcgctatgcctgtgctTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGT < SRR13214403.2946425/103‑1 (MQ=60)
ATCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTT < SRR13214403.727886/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTA < SRR13214403.533626/150‑1 (MQ=60)
CGTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTAT < SRR13214403.2714956/150‑1 (MQ=60)
GTGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATT > SRR13214403.1197086/1‑150 (MQ=60)
TGCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTA < SRR13214403.3203011/150‑1 (MQ=60)
GCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAA < SRR13214403.923519/150‑1 (MQ=60)
GCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAA > SRR13214403.1524746/1‑150 (MQ=60)
GCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAA > SRR13214403.2491063/1‑150 (MQ=60)
GCAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGCCACTCTTTTATAGAGTGGTTTTTaattaaggtagtat > SRR13214403.4375781/1‑136 (MQ=60)
CAAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAAT < SRR13214403.1226958/150‑1 (MQ=60)
NAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATT > SRR13214403.247706/1‑150 (MQ=60)
AAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATGCTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATT < SRR13214403.4011136/150‑1 (MQ=60)
AAAAACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATT < SRR13214403.1381856/150‑1 (MQ=60)
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AACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAA < SRR13214403.2823440/150‑1 (MQ=60)
AACTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATTATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAA > SRR13214403.4463151/1‑150 (MQ=60)
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TATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagc > SRR13214403.2304116/1‑107 (MQ=60)
TATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagc < SRR13214403.3562062/150‑44 (MQ=60)
ATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagca > SRR13214403.4110276/1‑106 (MQ=60)
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CTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtt > SRR13214403.4521650/1‑103 (MQ=60)
AGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagttttt < SRR13214403.4376844/150‑51 (MQ=60)
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AGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtg < SRR13214403.4522486/150‑55 (MQ=60)
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AGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtg > SRR13214403.30130/1‑96 (MQ=60)
CAAGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgca > SRR13214403.1880868/1‑94 (MQ=60)
AGAGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatg > SRR13214403.1841028/1‑92 (MQ=60)
AGGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgtt < SRR13214403.4065864/150‑61 (MQ=60)
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GGAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacaactatcacagaacataatgataagtactatttggtgcatgttc > SRR13214403.3741638/1‑89 (MQ=60)
GAAACTCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttca < SRR13214403.4294300/150‑63 (MQ=60)
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TCACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagat < SRR13214403.1490894/150‑68 (MQ=60)
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ACACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagatta > SRR13214403.3012186/1‑81 (MQ=60)
CACTTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaa < SRR13214403.2073008/150‑71 (MQ=60)
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ACCTCCCATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaag < SRR13214403.1897651/150‑72 (MQ=60)
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ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaa > SRR13214403.3348344/1‑72 (MQ=60)
ATTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaa > SRR13214403.505651/1‑72 (MQ=60)
TTCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaat > SRR13214403.4278943/1‑71 (MQ=60)
TCATAAATTAGGGGCACTTTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAAgatttatataaaaaaacacctatcacagcacataatgataagcagtttttggtgcatgttcatagattaagaagttaata < SRR13214403.1622907/150‑81 (MQ=60)
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GGACCTCAAGCAGTTAATATCACAAAAGCATAATTGTATCTGAAAATCGTGCAAAAGCTGGAGTCATGACTTCAGTTTTTTTATATTCAGTTGCAATGATGAGAGAGTATGATATACTTAGCCAGCAAGAGGAAACTCACACTTCCCATGCATAAATTAGGGCCACTCTAATATAGAGTGGTTTTTTTAATGTTTATTAATTAAAATTAATATTTAAAACATACAAATTAATAATACCATATACCCGAATTGCTAGTTAATTATCAAGTCATGGCTAAATAATCAACTAGCAATTCGGG > CP043523/1848460‑1848758
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
