Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP043523 |
1,891,241 |
C→A |
intergenic (‑11/‑139) |
FTN78_chr1940 ← / → FTN78_chr1941 |
Mobile element protein/Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP043523 | 1,891,241 | 0 | C | A | 99.1%
| 1036.1
/ ‑0.5
| 456 | intergenic (‑11/‑139) | FTN78_chr1940/FTN78_chr1941 | Mobile element protein/Permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (3/1); new base A (213/238); total (216/240) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.50e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 460 total aligned reads displayed.
ATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGGTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAATATAATGATG > CP043523/1891094‑1891335
|
aTAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTgagc > 2:1031966/1‑150 (MQ=17)
tAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCt > 1:339788/1‑150 (MQ=12)
aaCTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCtt > 1:3019348/1‑150 (MQ=12)
aCTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCttt < 2:696443/150‑1 (MQ=17)
aCTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCttt > 1:2519526/1‑150 (MQ=12)
cTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTc < 1:2012248/150‑1 (MQ=12)
tAAGCAATCTGATGTTGCTAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATCGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCt < 2:4228537/150‑1 (MQ=255)
aaTCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGc < 1:193726/150‑1 (MQ=12)
tCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCtt > 1:72840/1‑150 (MQ=17)
cTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTa > 2:1067994/1‑150 (MQ=12)
gATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGAGAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGt > 2:3880743/1‑150 (MQ=12)
tGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTgc < 2:2763465/150‑2 (MQ=12)
ttGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTgctt < 1:4144817/150‑4 (MQ=255)
tGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTgcttt < 1:2560518/150‑5 (MQ=255)
cGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTgctttaa < 2:679109/150‑7 (MQ=255)
gagaTGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCTGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTgcttgaag < 2:3809402/150‑8 (MQ=255)
gagaTGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTgctttaag < 1:2707745/150‑8 (MQ=11)
gACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAgg > 2:787567/1‑150 (MQ=255)
tttCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCAc > 1:4247774/1‑150 (MQ=11)
tttCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCAc < 1:432386/150‑1 (MQ=11)
tCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGa < 1:445355/150‑1 (MQ=255)
cGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGAc < 1:3940536/150‑1 (MQ=11)
gTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACtt > 1:245891/1‑150 (MQ=11)
tttGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACttat < 2:3120447/150‑1 (MQ=11)
tttGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACttat < 2:2038328/150‑1 (MQ=11)
ttGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAGGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGATATTATACGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACttatt < 2:4338490/150‑1 (MQ=11)
aaCCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACttatttat < 2:2300130/150‑1 (MQ=255)
aaCCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACttatttat > 1:924979/1‑150 (MQ=11)
aaCCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACttatttat < 2:3449881/150‑1 (MQ=11)
aCCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTtatttatt < 2:1863065/150‑1 (MQ=11)
aCCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTtatttatt > 2:1274493/1‑150 (MQ=11)
ccTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTatttattt > 1:2096625/1‑150 (MQ=255)
ccTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATAT‑AGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTatttatttn < 2:628437/150‑2 (MQ=11)
cTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTAtttt < 2:2797153/150‑1 (MQ=255)
gggAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAAt > 1:2817530/1‑150 (MQ=11)
ggAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATg < 1:49307/150‑1 (MQ=11)
ataaaCACTCGTTTGATAGAGCGTCTGAATGTTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAATTCGTTAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGTATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATg < 2:320607/148‑1 (MQ=1)
tctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaa > 1:3184129/1‑150 (MQ=2)
tctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaa > 2:853580/1‑150 (MQ=2)
tctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaa < 2:2413268/150‑1 (MQ=2)
tctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGCCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaa > 2:3634854/1‑150 (MQ=255)
ctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaa > 1:2379261/1‑150 (MQ=12)
ctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaa > 2:2164382/1‑150 (MQ=9)
ctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaa > 1:1477289/1‑150 (MQ=9)
ctcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaa > 1:1404175/1‑150 (MQ=9)
tcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaa < 2:1545454/150‑1 (MQ=255)
tcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaa > 2:3521662/1‑150 (MQ=255)
tcAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaa < 1:2661283/150‑1 (MQ=255)
cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaaa < 1:2956282/150‑1 (MQ=12)
cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaaa < 2:410113/150‑1 (MQ=255)
cAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTaaaaa < 2:1335868/150‑1 (MQ=12)
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aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat < 2:4057869/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat > 2:4442363/1‑150 (MQ=255)
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aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat > 1:865068/1‑150 (MQ=255)
aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat < 2:925497/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat < 1:1691901/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAat < 1:2937683/150‑1 (MQ=255)
aaTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTAGAAGTTTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTTATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTATCTAGCAATTCGGGTaaaaan < 2:2632810/150‑2 (MQ=11)
aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata > 2:1636568/1‑150 (MQ=255)
aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata > 1:1794135/1‑150 (MQ=255)
aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata > 2:574309/1‑150 (MQ=255)
aTGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAata > 1:1056407/1‑150 (MQ=255)
tGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatat < 2:2456381/150‑1 (MQ=255)
ggTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatc < 1:1290009/150‑2 (MQ=255)
ggTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatc < 2:3008834/150‑2 (MQ=255)
ggTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTagaaagttt < 2:1741780/150‑5 (MQ=1)
ggTTATCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTagaaagttt > 2:594220/1‑146 (MQ=11)
gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTCGTGCTTGAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatca > 2:4310673/1‑148 (MQ=11)
gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatca > 2:1435240/1‑148 (MQ=255)
gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatca > 1:1185729/1‑148 (MQ=255)
gTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatca < 1:3268901/150‑3 (MQ=255)
ttGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaa < 1:2297664/150‑4 (MQ=11)
ttGTCAGTAAATAAACAAAAACTATTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaa < 1:4433590/150‑4 (MQ=11)
ntGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaa > 2:3369391/2‑147 (MQ=11)
tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag > 1:4034860/1‑146 (MQ=255)
tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag < 2:3235297/150‑5 (MQ=11)
tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag < 1:1528077/150‑5 (MQ=11)
tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag > 1:2772053/1‑146 (MQ=255)
tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaag > 2:2064283/1‑146 (MQ=11)
tGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAAATCGGGTAAAAatatcaag > 2:2921432/1‑146 (MQ=11)
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gTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagt > 2:4180624/1‑145 (MQ=11)
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cAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGAGCTTTCTAATGCTTAGTGCTTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAatatcaagtac > 1:2621691/1‑143 (MQ=11)
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|
ATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGAAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTTAGTGGGTTAAGATTAGGATAGCACGACTTATTTATTTTCCAATGAAATTAACTAGCAATTCGGGTAAAAATATAATGATG > CP043523/1891094‑1891335
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
