Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 804 total aligned reads displayed.
GGATACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTT > CP043523/248466‑248764
|
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GATACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATC < SRR13214403.2078249/150‑1 (MQ=20)
ATACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCT < SRR13214403.3398888/150‑1 (MQ=42)
ATACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCT < SRR13214403.1224890/150‑1 (MQ=42)
ATACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCT < SRR13214403.2212416/150‑1 (MQ=42)
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ACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGA > SRR13214403.1242948/1‑150 (MQ=42)
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GGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTT < SRR13214403.492561/150‑1 (MQ=42)
GTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTG > SRR13214403.3326556/1‑150 (MQ=42)
GTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTG < SRR13214403.2895888/150‑1 (MQ=20)
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TAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGC < SRR13214403.3449403/150‑1 (MQ=20)
TAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGC < SRR13214403.1129804/150‑1 (MQ=20)
TAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGC > SRR13214403.1528006/1‑150 (MQ=20)
AAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCG < SRR13214403.3581096/150‑1 (MQ=42)
AAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCG > SRR13214403.4148863/1‑150 (MQ=20)
GAGGGCATTACACCGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAG < SRR13214403.3314300/150‑1 (MQ=20)
GAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAG > SRR13214403.1009900/1‑150 (MQ=42)
AGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGA > SRR13214403.18950/1‑150 (MQ=42)
GGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATG > SRR13214403.3294680/1‑150 (MQ=42)
GCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGG < SRR13214403.196529/150‑1 (MQ=42)
GCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGG > SRR13214403.3822265/1‑150 (MQ=42)
CATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGA > SRR13214403.423025/1‑150 (MQ=42)
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TACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGT < SRR13214403.2950156/150‑1 (MQ=42)
TACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGT < SRR13214403.718067/150‑1 (MQ=20)
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ACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTT > SRR13214403.19212/1‑150 (MQ=42)
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GACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTT < SRR13214403.157210/150‑1 (MQ=42)
ACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTT > SRR13214403.2741050/1‑150 (MQ=20)
CAAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTT > SRR13214403.1519627/1‑150 (MQ=20)
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AAAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTG > SRR13214403.3206239/1‑150 (MQ=20)
AAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATCACTAAGCAATCTGATGTTGCGATATGGACGGTCTTTCGGTTTTGA > SRR13214403.3881579/1‑150 (MQ=19)
AAGCGAGAATATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGA < SRR13214403.1060897/150‑1 (MQ=20)
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AATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAA < SRR13214403.696049/150‑1 (MQ=42)
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TATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGG > SRR13214403.2498849/1‑150 (MQ=20)
TATTCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGG > SRR13214403.566850/1‑150 (MQ=20)
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ATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGG > SRR13214403.2232897/1‑150 (MQ=42)
ATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGG > SRR13214403.2810952/1‑150 (MQ=42)
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TCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGA > SRR13214403.1610401/1‑150 (MQ=42)
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TCTAGGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGA > SRR13214403.4526616/1‑150 (MQ=20)
TAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAAC > SRR13214403.2248632/1‑150 (MQ=42)
GGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCC > SRR13214403.4346234/1‑150 (MQ=50)
GGAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACAC > SRR13214403.2434864/1‑150 (MQ=20)
GAAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACT > SRR13214403.644572/1‑150 (MQ=20)
AAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTC < SRR13214403.363312/150‑1 (MQ=49)
AAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTC > SRR13214403.2878228/1‑150 (MQ=49)
AAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTC > SRR13214403.3944702/1‑150 (MQ=21)
AAAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGAGGAACACTC > SRR13214403.3700061/1‑150 (MQ=20)
AAGTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCG > SRR13214403.4100981/1‑150 (MQ=21)
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ATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGT > SRR13214403.3911569/1‑150 (MQ=45)
ATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGT > SRR13214403.2770602/1‑150 (MQ=45)
GTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTT > SRR13214403.307058/1‑150 (MQ=21)
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AGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTT > SRR13214403.2362521/1‑150 (MQ=20)
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TTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTT < SRR13214403.2463874/150‑1 (MQ=0)
TTCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTT < SRR13214403.2125814/150‑1 (MQ=0)
TCACTAAAATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTT < SRR13214403.313808/150‑1 (MQ=0)
TCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTT < SRR13214403.1546659/150‑1 (MQ=0)
CACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTG < SRR13214403.2619976/150‑1 (MQ=0)
TAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGA > SRR13214403.30575/1‑150 (MQ=0)
AAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGT < SRR13214403.444897/150‑1 (MQ=0)
AAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGT < SRR13214403.3759803/150‑1 (MQ=0)
AATGCAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTG > SRR13214403.3094811/1‑150 (MQ=0)
ATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGT > SRR13214403.1119638/1‑150 (MQ=0)
CAGTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCT < SRR13214403.851558/150‑1 (MQ=0)
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GTACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTAT > SRR13214403.259543/1‑150 (MQ=0)
ACGCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTA < SRR13214403.1601315/150‑1 (MQ=0)
ACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGGAGTGTGCTATTA > SRR13214403.833031/1‑150 (MQ=0)
GCCCCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATA < SRR13214403.596740/150‑1 (MQ=0)
GCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATA < SRR13214403.4602141/150‑1 (MQ=0)
CCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAACCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACCCTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTAAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAA < SRR13214403.1265768/150‑1 (MQ=0)
CCATAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGT > SRR13214403.2690100/1‑150 (MQ=0)
TAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCAT < SRR13214403.66705/150‑1 (MQ=6)
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AGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATA < SRR13214403.1499069/150‑1 (MQ=8)
GTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATA < SRR13214403.4088916/150‑1 (MQ=8)
AACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAG > SRR13214403.2321333/1‑150 (MQ=8)
AAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTCCTATTATAAGTCATATAAGTCG > SRR13214403.3436686/1‑150 (MQ=8)
AGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGT > SRR13214403.78733/1‑150 (MQ=8)
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AACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTT > SRR13214403.1294229/1‑150 (MQ=6)
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AAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTA > SRR13214403.2849590/1‑150 (MQ=6)
GCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAAT < SRR13214403.778633/150‑1 (MQ=6)
AATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGC < SRR13214403.1158890/150‑1 (MQ=6)
AATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGC > SRR13214403.1347136/1‑150 (MQ=6)
AATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCAGATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGC > SRR13214403.4460144/1‑150 (MQ=6)
AATCTGATGTTGCGAGATGGACGTACTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGC < SRR13214403.3991414/150‑1 (MQ=6)
TCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTT < SRR13214403.1718731/150‑1 (MQ=6)
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GGATACTCGGTAAGAGGGCATTACAACGGCGGACAAAGCGAGAATATTCTAGGAAATTAGGAAATAAACTTTGAGCAAGTTGGTGCTTAGCTTTAAGCGTTTCACTAAAATGCAGTACGCCCCAGAGGTAACAAGCGATAACTAAGCAATCTGATGTTGCGAGATGGACGTTCTTTCGGTTTTGAACCTCAAGGGGAACACTCGTTTGATAAAGCGTCTCAATGGTTGTCAGTCAATAAACAAAAACTTTTGGAAGTGTGCTATTATAAGTCATATAAGTCGTGCGCTTTCTAATGCTT > CP043523/248466‑248764
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |