Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 642 total aligned reads displayed.
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|
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TTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGT > SRR13214403.3766058/1‑150 (MQ=60)
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ATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGT > SRR13214403.3755254/1‑150 (MQ=60)
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TTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTT > SRR13214403.214271/1‑150 (MQ=60)
TTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTT < SRR13214403.2514783/150‑1 (MQ=60)
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TAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTT > SRR13214403.580712/1‑150 (MQ=60)
TAACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTN < SRR13214403.1265055/150‑1 (MQ=60)
AACTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTC < SRR13214403.1196616/150‑1 (MQ=60)
ACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTTGAGAATGTCTGTTTCA < SRR13214403.2816208/150‑1 (MQ=60)
ACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCA < SRR13214403.1853755/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCAT > SRR13214403.1640848/1‑150 (MQ=60)
CTTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCAT < SRR13214403.1073754/150‑1 (MQ=60)
TTGCCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATC > SRR13214403.1574036/1‑150 (MQ=60)
TTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCCACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCCACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATC > SRR13214403.1838667/1‑150 (MQ=60)
CCCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGT < SRR13214403.4311254/150‑1 (MQ=60)
CCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGT > SRR13214403.4083285/1‑150 (MQ=60)
CCTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTA > SRR13214403.885954/1‑150 (MQ=60)
CTTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAA > SRR13214403.1067464/1‑150 (MQ=60)
TTTAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAA > SRR13214403.4057342/1‑150 (MQ=60)
TAATTCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAAT < SRR13214403.773540/150‑1 (MQ=60)
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ATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCA > SRR13214403.3727760/1‑150 (MQ=60)
ATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCA > SRR13214403.2563912/1‑150 (MQ=60)
ATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCA > SRR13214403.509658/1‑150 (MQ=60)
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TCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAAT < SRR13214403.3926394/150‑1 (MQ=60)
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CAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAA > SRR13214403.2407860/1‑150 (MQ=60)
AACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAGC > SRR13214403.4255785/1‑150 (MQ=60)
AACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAAC < SRR13214403.566029/150‑1 (MQ=60)
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CTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACAT > SRR13214403.374744/1‑150 (MQ=60)
TCCTGGAATATTTTTAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGCTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATT < SRR13214403.3885976/150‑1 (MQ=60)
ccctGAATATTTTCACCCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAAAGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTA < SRR13214403.723920/146‑1 (MQ=60)
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CCTGGAATCTTTTCAACCGCTCCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTA < SRR13214403.3868391/150‑1 (MQ=60)
CCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTA > SRR13214403.4149952/1‑150 (MQ=60)
CTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTAC > SRR13214403.2924479/1‑150 (MQ=60)
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TGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACG < SRR13214403.4338444/150‑1 (MQ=60)
GAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAA > SRR13214403.4280452/1‑150 (MQ=60)
AATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAAC < SRR13214403.2746150/150‑1 (MQ=60)
AATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAAC > SRR13214403.413702/1‑150 (MQ=60)
AATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAAC < SRR13214403.983534/150‑1 (MQ=60)
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ATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACA > SRR13214403.2070150/1‑150 (MQ=60)
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TTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAA > SRR13214403.4246146/1‑150 (MQ=60)
TCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAAC > SRR13214403.2389377/1‑150 (MQ=60)
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GCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCG > SRR13214403.2342252/1‑150 (MQ=60)
CTTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGT < SRR13214403.325372/150‑1 (MQ=60)
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TTCAACTTTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTC < SRR13214403.906962/150‑1 (MQ=60)
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TTTAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAAT < SRR13214403.1762151/150‑1 (MQ=60)
TAGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGT < SRR13214403.2367591/150‑1 (MQ=60)
AGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTT < SRR13214403.3383594/150‑1 (MQ=60)
AGATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTT < SRR13214403.640236/150‑1 (MQ=60)
AGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTT > SRR13214403.139724/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCC > SRR13214403.1595413/1‑150 (MQ=60)
TTTCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCG > SRR13214403.760512/1‑150 (MQ=60)
TTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCG > SRR13214403.1052265/1‑150 (MQ=60)
TCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTT > SRR13214403.4404975/1‑150 (MQ=60)
TCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTT < SRR13214403.4419567/150‑1 (MQ=60)
CCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTT < SRR13214403.2586055/150‑1 (MQ=60)
CAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTT > SRR13214403.3357518/1‑150 (MQ=60)
AAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTT < SRR13214403.1135016/150‑1 (MQ=60)
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CTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTT < SRR13214403.2374009/150‑1 (MQ=60)
CTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTT > SRR13214403.2125611/1‑150 (MQ=60)
CTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTT < SRR13214403.533757/150‑1 (MQ=60)
CAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAA > SRR13214403.144413/1‑150 (MQ=60)
AAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAAT > SRR13214403.3950670/1‑150 (MQ=60)
AAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAAT > SRR13214403.3948621/1‑150 (MQ=60)
AAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAAT > SRR13214403.120413/1‑150 (MQ=60)
AGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATT < SRR13214403.1288305/150‑1 (MQ=60)
GCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAAT < SRR13214403.3769117/150‑1 (MQ=60)
TGCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAA < SRR13214403.2984122/150‑1 (MQ=60)
TGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAA > SRR13214403.2540261/1‑150 (MQ=60)
GCCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAA > SRR13214403.3708076/1‑150 (MQ=60)
GCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAA < SRR13214403.1898968/150‑1 (MQ=60)
CCATGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAAC < SRR13214403.1381278/150‑1 (MQ=60)
CATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACC < SRR13214403.4065761/150‑1 (MQ=60)
ATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCA < SRR13214403.4132912/150‑1 (MQ=60)
TGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCAT < SRR13214403.221958/150‑1 (MQ=60)
TGATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCAT > SRR13214403.3899226/1‑150 (MQ=60)
GATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATT > SRR13214403.3235750/1‑150 (MQ=60)
GATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATT > SRR13214403.3762174/1‑150 (MQ=60)
ATTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTT < SRR13214403.3052298/150‑1 (MQ=60)
ATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTT > SRR13214403.1663582/1‑150 (MQ=60)
TTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTT > SRR13214403.1813868/1‑150 (MQ=60)
TTTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTT < SRR13214403.2299402/150‑1 (MQ=60)
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TTGGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTT < SRR13214403.743089/150‑1 (MQ=60)
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GGAGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAG < SRR13214403.3035060/150‑1 (MQ=60)
AGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCA > SRR13214403.1156975/1‑150 (MQ=60)
AGAGTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCA > SRR13214403.3139489/1‑150 (MQ=60)
AGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCA > SRR13214403.4042067/1‑150 (MQ=60)
AATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCAGA > SRR13214403.3310458/1‑150 (MQ=60)
GTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCAGAA < SRR13214403.2672875/150‑1 (MQ=60)
GTGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCAGAA > SRR13214403.2663805/1‑150 (MQ=60)
ATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCAGAA > SRR13214403.3450890/1‑150 (MQ=60)
ATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGATTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCAGAA > SRR13214403.3567325/1‑150 (MQ=60)
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AGTTTTGATTAACTTGCCCTTTAATCCCAACTCCTGGAATATTTTCAACCGCTTCAACTTTTAGATTTCCAAGAGGTTTAGCAGCTGCAACGATTGATTGAGCAATCGGGTGAGTGGAACTTCCTTCAAGTGCTGCCATGATTTGGAGAATGTCTGTTTCATCAGTAAAATCAATAACATTACGAACAATAAACTTACCGTCAGTTAATGTTCCCGTTTTATCCATTAAGGCATATTTAATTGTATTTATTTTTTCTAGAGAAGTTCTGTTTTGAATTAATAAACCATTTTTAGCAGAA > CP043523/480121‑480419
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
