Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 529 total aligned reads displayed.
AACTACTTTCAAGTCTACTGCAACTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATG > CP043523/838725‑839023
|
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CTTTCAAGTCTACTGCAACTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTA < SRR13214403.643951/150‑1 (MQ=60)
CTTTCAAGTCTACTGCAACCTGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTA > SRR13214403.362332/1‑150 (MQ=60)
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TTTCAAGTCTACTGCAACCTGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTAC < SRR13214403.94928/150‑1 (MQ=60)
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TCAAGTCTACTGCAACCTGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAA < SRR13214403.26311/150‑1 (MQ=60)
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AAGTCTACTGCAACCTGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATC > SRR13214403.1356437/1‑150 (MQ=60)
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CTACTGCAACCTGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTT > SRR13214403.4210048/1‑150 (MQ=60)
TACTGCAACCTGTGATTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTG > SRR13214403.2332566/1‑150 (MQ=60)
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TGCAACCTGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCAC > SRR13214403.4014419/1‑150 (MQ=60)
AACTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCAC < SRR13214403.3389655/150‑1 (MQ=60)
AACTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCAC < SRR13214403.4412059/150‑1 (MQ=60)
CTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTT < SRR13214403.3995114/150‑1 (MQ=60)
CTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTT > SRR13214403.3741882/1‑150 (MQ=60)
CTGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTT > SRR13214403.2726061/1‑150 (MQ=60)
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TGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATC > SRR13214403.3001800/1‑150 (MQ=60)
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GTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCT < SRR13214403.939284/150‑1 (MQ=60)
TTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTTATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTT < SRR13214403.3599888/150‑1 (MQ=60)
TCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCAT > SRR13214403.3076129/1‑150 (MQ=60)
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CCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATA > SRR13214403.3400380/1‑150 (MQ=60)
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CCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAA > SRR13214403.1044380/1‑150 (MQ=60)
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AACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGT > SRR13214403.1959176/1‑150 (MQ=60)
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TCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAA > SRR13214403.1191255/1‑150 (MQ=60)
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ACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTC < SRR13214403.2283805/150‑1 (MQ=60)
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CGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCC < SRR13214403.3012030/150‑1 (MQ=60)
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ACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAAT < SRR13214403.914199/150‑1 (MQ=60)
ACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAAT > SRR13214403.1503492/1‑150 (MQ=60)
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CCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATT > SRR13214403.3451737/1‑150 (MQ=60)
CCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATT < SRR13214403.2533341/150‑1 (MQ=60)
CCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATT < SRR13214403.2246579/150‑1 (MQ=60)
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TGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTC < SRR13214403.1036466/150‑1 (MQ=60)
TGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTC < SRR13214403.1545725/150‑1 (MQ=60)
TGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTC > SRR13214403.387801/1‑150 (MQ=60)
GTTGTAACATCATCAGTATTAATACGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCT < SRR13214403.3958792/150‑1 (MQ=60)
GTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCT > SRR13214403.3577550/1‑150 (MQ=60)
GTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCT > SRR13214403.2740942/1‑150 (MQ=60)
TTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTG < SRR13214403.1660352/150‑1 (MQ=60)
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GTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGT > SRR13214403.3659084/1‑150 (MQ=60)
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AACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTG > SRR13214403.4061938/1‑150 (MQ=60)
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CATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCA > SRR13214403.3842714/1‑150 (MQ=60)
CATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCA < SRR13214403.2137615/150‑1 (MQ=60)
CATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCA < SRR13214403.1360137/150‑1 (MQ=60)
CATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCA > SRR13214403.1578197/1‑150 (MQ=60)
CATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCA > SRR13214403.2297186/1‑150 (MQ=60)
ATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCAT < SRR13214403.4348393/150‑1 (MQ=60)
ATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCAT > SRR13214403.252497/1‑150 (MQ=60)
ATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCAT < SRR13214403.2406984/150‑1 (MQ=60)
TCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATA > SRR13214403.3530208/1‑150 (MQ=60)
CCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAA < SRR13214403.3718656/150‑1 (MQ=60)
CCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAA < SRR13214403.2837722/150‑1 (MQ=60)
CACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAAT > SRR13214403.225537/1‑150 (MQ=60)
CACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAAT > SRR13214403.1348752/1‑150 (MQ=60)
ACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATA > SRR13214403.2710459/1‑150 (MQ=60)
ACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATCTTTTCTTGTACCATAATA > SRR13214403.3827711/1‑150 (MQ=60)
TGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATT > SRR13214403.69966/1‑150 (MQ=60)
TGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATT > SRR13214403.3239594/1‑150 (MQ=60)
GATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTC > SRR13214403.135782/1‑150 (MQ=60)
ATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTT > SRR13214403.545974/1‑150 (MQ=60)
TTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTN < SRR13214403.265347/150‑1 (MQ=60)
TTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTC < SRR13214403.1239160/150‑1 (MQ=60)
TTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTC > SRR13214403.2926466/1‑150 (MQ=60)
TTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTC < SRR13214403.4555104/150‑1 (MQ=60)
TCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCC < SRR13214403.1711836/150‑1 (MQ=60)
CTAATGCTAAACCTACAATCTTTCGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCT < SRR13214403.4473428/150‑1 (MQ=60)
AATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTT > SRR13214403.4333773/1‑150 (MQ=60)
AATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTT < SRR13214403.3682025/150‑1 (MQ=60)
ATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTT < SRR13214403.1291420/150‑1 (MQ=60)
TGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTA < SRR13214403.828563/150‑1 (MQ=60)
TGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTA < SRR13214403.301022/150‑1 (MQ=60)
CTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATA > SRR13214403.1101081/1‑150 (MQ=60)
CTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATA < SRR13214403.3086393/150‑1 (MQ=60)
GTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATG > SRR13214403.4302047/1‑150 (MQ=60)
GTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATG > SRR13214403.1482047/1‑150 (MQ=60)
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AACTACTTTCAAGTCTACTGCAACTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATG > CP043523/838725‑839023
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |