Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 539 total aligned reads displayed.
CAACTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAAT > CP043523/838745‑839042
|
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ACTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACAGATTCTAATGCTAGTCCAACAATCTTTTGCACCACT > SRR13214403.3790492/1‑150 (MQ=60)
CTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTT < SRR13214403.3995114/150‑1 (MQ=60)
CTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTT < SRR13214403.2872882/150‑1 (MQ=60)
CTGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTT < SRR13214403.2376313/150‑1 (MQ=60)
TGTGTTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTA > SRR13214403.261526/1‑150 (MQ=60)
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GTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTAT < SRR13214403.1361125/150‑1 (MQ=60)
GTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTAT > SRR13214403.2893436/1‑150 (MQ=60)
TGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATC > SRR13214403.3004365/1‑150 (MQ=60)
GTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCT < SRR13214403.3141937/150‑1 (MQ=60)
TTTTCCCAACTTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTTATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTT < SRR13214403.3599888/150‑1 (MQ=60)
TTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTC < SRR13214403.1300138/150‑1 (MQ=60)
ACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATA < SRR13214403.2390287/150‑1 (MQ=60)
CCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAA > SRR13214403.1042472/1‑150 (MQ=60)
TTCTACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGCTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAA < SRR13214403.2167879/150‑1 (MQ=60)
TCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAA > SRR13214403.1192180/1‑150 (MQ=60)
TACGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGT < SRR13214403.3505141/150‑1 (MQ=60)
ACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCC < SRR13214403.733136/150‑1 (MQ=60)
CGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCAC > SRR13214403.424763/1‑150 (MQ=60)
CGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCC > SRR13214403.417012/1‑150 (MQ=60)
CGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCC > SRR13214403.2394773/1‑150 (MQ=60)
CGTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCC > SRR13214403.603854/1‑150 (MQ=60)
GTCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCC > SRR13214403.3701658/1‑150 (MQ=60)
TCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCC < SRR13214403.924972/150‑1 (MQ=60)
TCAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAcatcccc > SRR13214403.3734879/1‑143 (MQ=60)
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CAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCT > SRR13214403.1677527/1‑150 (MQ=60)
CAACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCT < SRR13214403.2225811/150‑1 (MQ=60)
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ACACCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTA < SRR13214403.4356000/150‑1 (MQ=60)
GCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAAT > SRR13214403.182366/1‑150 (MQ=60)
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CCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATT < SRR13214403.2246579/150‑1 (MQ=60)
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CTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTT < SRR13214403.624513/150‑1 (MQ=60)
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TGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTC < SRR13214403.3063482/150‑1 (MQ=60)
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GTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCT > SRR13214403.3577550/1‑150 (MQ=60)
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AACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTG > SRR13214403.3201126/1‑150 (MQ=60)
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cggtggtcgccgtacattTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTG > SRR13214403.4088009/19‑150 (MQ=60)
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TATTAATAAGTTTTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTG > SRR13214403.2463343/1‑150 (MQ=60)
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AAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGG > SRR13214403.1736421/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAG < SRR13214403.1558383/150‑1 (MQ=60)
TTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTT > SRR13214403.757297/1‑150 (MQ=60)
TTCCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTT < SRR13214403.2372948/150‑1 (MQ=60)
CCTGTTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCT > SRR13214403.4570588/1‑150 (MQ=60)
TGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTT > SRR13214403.1654913/1‑150 (MQ=60)
GTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTT > SRR13214403.2750114/1‑150 (MQ=60)
TTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTT < SRR13214403.1321866/150‑1 (MQ=60)
TTAAGTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTT > SRR13214403.792618/1‑150 (MQ=60)
GGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTG > SRR13214403.6394/1‑150 (MQ=60)
GGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTG > SRR13214403.178273/1‑150 (MQ=60)
GGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTG < SRR13214403.1340082/150‑1 (MQ=60)
GTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGC > SRR13214403.4566770/1‑150 (MQ=60)
GTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGC < SRR13214403.3469791/150‑1 (MQ=60)
GTTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGC < SRR13214403.1840421/150‑1 (MQ=60)
TTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCC > SRR13214403.4380423/1‑150 (MQ=60)
TTTGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCC > SRR13214403.1916469/1‑150 (MQ=60)
TTGCGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCA < SRR13214403.4120113/150‑1 (MQ=60)
TGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCAT < SRR13214403.2066395/150‑1 (MQ=60)
TGAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCAT < SRR13214403.2532563/150‑1 (MQ=60)
GAGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATT > SRR13214403.2161082/1‑150 (MQ=60)
AGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTG > SRR13214403.463611/1‑150 (MQ=60)
AGAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTG < SRR13214403.2817681/150‑1 (MQ=60)
GAAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGT < SRR13214403.3637/150‑1 (MQ=60)
AAGAACCCACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGCTTTCCTTTGTTATAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTT > SRR13214403.3880372/1‑150 (MQ=60)
AAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCA < SRR13214403.2061233/150‑1 (MQ=60)
CCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAAT < SRR13214403.2088189/150‑1 (MQ=60)
ACCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGC > SRR13214403.2426946/1‑150 (MQ=60)
CCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCT < SRR13214403.4346131/150‑1 (MQ=60)
CCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCT > SRR13214403.840346/1‑150 (MQ=60)
CCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCT > SRR13214403.4479064/1‑150 (MQ=60)
CCTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCT < SRR13214403.352083/150‑1 (MQ=60)
CTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTT > SRR13214403.2195506/1‑150 (MQ=60)
CTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTT > SRR13214403.2763396/1‑150 (MQ=60)
CTTCTACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTT < SRR13214403.1959240/150‑1 (MQ=60)
CTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCA < SRR13214403.3188277/150‑1 (MQ=60)
TACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCAT < SRR13214403.3970940/150‑1 (MQ=60)
TACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCAT < SRR13214403.2791564/150‑1 (MQ=60)
ACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATG < SRR13214403.3070102/150‑1 (MQ=60)
ACAGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATG > SRR13214403.819076/1‑150 (MQ=60)
CGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGT > SRR13214403.4025009/1‑150 (MQ=60)
CGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGT > SRR13214403.3736221/1‑150 (MQ=60)
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GGAAAGAAGTCCATACACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTT < SRR13214403.3395358/150‑1 (MQ=60)
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TGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATT > SRR13214403.3239594/1‑150 (MQ=60)
GATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTC > SRR13214403.135782/1‑150 (MQ=60)
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ATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCT > SRR13214403.205850/1‑150 (MQ=60)
ATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTT > SRR13214403.1990380/1‑150 (MQ=60)
ATTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTT > SRR13214403.545974/1‑150 (MQ=60)
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TTCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTC > SRR13214403.2926813/1‑150 (MQ=60)
TCTAATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCC < SRR13214403.1208709/150‑1 (MQ=60)
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AATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTT > SRR13214403.4333773/1‑150 (MQ=60)
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AATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTT > SRR13214403.3369988/1‑150 (MQ=60)
ATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTT < SRR13214403.1291420/150‑1 (MQ=60)
ATGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTTATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTT > SRR13214403.1745938/1‑150 (MQ=60)
TGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTA < SRR13214403.674284/150‑1 (MQ=60)
TGCTAAACCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTA < SRR13214403.301022/150‑1 (MQ=60)
GCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTAT > SRR13214403.2097400/1‑150 (MQ=60)
ctaaaCCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATA < SRR13214403.2553033/145‑1 (MQ=60)
CTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATA > SRR13214403.1101081/1‑150 (MQ=60)
CTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATA < SRR13214403.3086393/150‑1 (MQ=60)
AGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAAT > SRR13214403.3218656/1‑150 (MQ=60)
aaCCTACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATACGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATG < SRR13214403.4053628/148‑1 (MQ=60)
GTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATG > SRR13214403.1482047/1‑150 (MQ=60)
GTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATG > SRR13214403.4302047/1‑150 (MQ=60)
TCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGT < SRR13214403.477077/150‑1 (MQ=60)
TACAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTAT < SRR13214403.11867/150‑1 (MQ=60)
ACAATCTTTTGCACCACTTTCTCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATT < SRR13214403.2214847/150‑1 (MQ=60)
CAATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTT > SRR13214403.1227760/1‑150 (MQ=60)
AATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTA < SRR13214403.2982497/150‑1 (MQ=60)
ATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTAC < SRR13214403.3665934/150‑1 (MQ=60)
ATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTAC < SRR13214403.376150/150‑1 (MQ=60)
ATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTAC < SRR13214403.487778/150‑1 (MQ=60)
ATCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTAC < SRR13214403.813590/150‑1 (MQ=60)
TCTTTTGCACAACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACG < SRR13214403.1661786/150‑1 (MQ=60)
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CACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATA < SRR13214403.3948030/150‑1 (MQ=60)
ACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAA < SRR13214403.3266891/150‑1 (MQ=60)
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CACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAAT < SRR13214403.524915/150‑1 (MQ=60)
CACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAAT < SRR13214403.4422071/150‑1 (MQ=60)
AACTTTATCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAAT < SRR13214403.4433307/150‑1 (MQ=60)
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CAACTTGTGTTTTACCAACTTCTACGTCAACGCCTGTTGTAACATCATCAGTATTAATAAGTTTTCCTGTTAGGTTTGAGAAGAAGCCACCTTCTACGGAAAGAAGTCCATCCACTGATTCTAATGCTAGTCCTACAATCTTTTGCACCACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAAT > CP043523/838745‑839042
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |