Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 532 total aligned reads displayed.
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|
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CTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAG < SRR13214403.1175972/150‑1 (MQ=60)
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TATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATN < SRR13214403.548387/150‑1 (MQ=60)
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TCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAA > SRR13214403.949329/1‑150 (MQ=60)
TCTTCATAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAA > SRR13214403.2802358/1‑150 (MQ=60)
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TAAGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTC > SRR13214403.4328426/1‑150 (MQ=60)
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AGTCAAAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCT > SRR13214403.1896738/1‑150 (MQ=60)
GTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTG > SRR13214403.2452768/1‑150 (MQ=60)
GTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTG < SRR13214403.2220308/150‑1 (MQ=60)
GTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTG < SRR13214403.2250848/150‑1 (MQ=60)
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AAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGattt < SRR13214403.2579207/150‑5 (MQ=60)
AAGTCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGattt < SRR13214403.788601/150‑5 (MQ=60)
AAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCT > SRR13214403.4560936/1‑150 (MQ=60)
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agcccttggtctcaaagatgttcattatcTTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCT < SRR13214403.3656661/121‑1 (MQ=60)
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TCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCATAATCCAATTAAAAATA > SRR13214403.4191415/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAA < SRR13214403.682474/150‑1 (MQ=60)
CTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAA > SRR13214403.337497/1‑150 (MQ=60)
TTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAAGAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAA > SRR13214403.3782483/1‑150 (MQ=60)
TTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAA < SRR13214403.2677222/150‑1 (MQ=60)
TTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAA < SRR13214403.2719203/150‑1 (MQ=60)
TTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAAC > SRR13214403.434337/1‑150 (MQ=60)
TTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACC > SRR13214403.2196755/1‑150 (MQ=60)
TGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCTTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGA > SRR13214403.1595474/1‑150 (MQ=60)
TGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGA < SRR13214403.1119284/150‑1 (MQ=60)
GCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAA > SRR13214403.2539353/1‑150 (MQ=60)
GCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAA > SRR13214403.2301682/1‑150 (MQ=60)
GCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTGTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAA < SRR13214403.891284/150‑1 (MQ=60)
CATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATC > SRR13214403.4230627/1‑150 (MQ=60)
CATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATC > SRR13214403.907211/1‑150 (MQ=60)
CATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATC > SRR13214403.3601861/1‑150 (MQ=60)
ATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCA > SRR13214403.119549/1‑150 (MQ=60)
TGTTCCAAATGATTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATT < SRR13214403.4101649/150‑1 (MQ=60)
TTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTT < SRR13214403.4525551/150‑1 (MQ=60)
TTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTT < SRR13214403.2176343/150‑1 (MQ=60)
CCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCC < SRR13214403.1181908/150‑1 (MQ=60)
CAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCA < SRR13214403.1045457/150‑1 (MQ=60)
CAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCA > SRR13214403.625103/1‑150 (MQ=60)
AAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAA > SRR13214403.288501/1‑150 (MQ=60)
AAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAA > SRR13214403.4457168/1‑150 (MQ=60)
AAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAA > SRR13214403.3549669/1‑150 (MQ=60)
AAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAA < SRR13214403.129956/150‑1 (MQ=60)
AAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAA > SRR13214403.2560229/1‑150 (MQ=60)
AATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAA < SRR13214403.3963912/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATC > SRR13214403.1863830/1‑150 (MQ=60)
TTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCA > SRR13214403.2738890/1‑150 (MQ=60)
TTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCA < SRR13214403.215353/150‑1 (MQ=60)
TTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAA < SRR13214403.2508495/150‑1 (MQ=60)
TTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAA > SRR13214403.2702293/1‑150 (MQ=60)
TCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAAT < SRR13214403.1970966/150‑1 (MQ=60)
TCATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAAT < SRR13214403.2534676/150‑1 (MQ=60)
TCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAAT < SRR13214403.1766491/150‑1 (MQ=60)
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CATGTTTTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATA > SRR13214403.13405/1‑150 (MQ=60)
CATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATA > SRR13214403.88047/1‑150 (MQ=60)
ATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAG > SRR13214403.2698403/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTG < SRR13214403.3909648/150‑1 (MQ=60)
TTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGA > SRR13214403.2891292/1‑150 (MQ=60)
TTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAA > SRR13214403.966355/1‑150 (MQ=60)
TTCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAG < SRR13214403.3867555/150‑1 (MQ=60)
TCTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGA > SRR13214403.1477723/1‑150 (MQ=60)
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TCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGA < SRR13214403.725147/150‑1 (MQ=60)
CTTGTACCATAATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGaccaccg < SRR13214403.2468364/150‑8 (MQ=60)
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TACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACAC < SRR13214403.3527152/150‑1 (MQ=60)
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TAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGC < SRR13214403.2129326/150‑1 (MQ=60)
TAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGC > SRR13214403.3085999/1‑150 (MQ=60)
AATATTTTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCA < SRR13214403.852256/150‑1 (MQ=60)
AATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCA < SRR13214403.922880/150‑1 (MQ=60)
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TATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTA > SRR13214403.1161413/1‑150 (MQ=60)
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ATAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTAC > SRR13214403.3201630/1‑150 (MQ=60)
TAATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACG < SRR13214403.3942712/150‑1 (MQ=60)
TAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACG > SRR13214403.3133317/1‑150 (MQ=60)
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ATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGAT < SRR13214403.906032/150‑1 (MQ=60)
ATGTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGAT > SRR13214403.1234922/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTC > SRR13214403.4016616/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTC > SRR13214403.70665/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTC > SRR13214403.1854809/1‑150 (MQ=60)
TATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCC < SRR13214403.3339043/150‑1 (MQ=60)
ATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCC > SRR13214403.3787346/1‑150 (MQ=60)
ATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCC > SRR13214403.3750705/1‑150 (MQ=60)
ATTTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCC > SRR13214403.1859286/1‑150 (MQ=60)
ATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTC < SRR13214403.4308428/150‑1 (MQ=60)
TTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCC > SRR13214403.2537244/1‑150 (MQ=60)
TTACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCT < SRR13214403.1653116/150‑1 (MQ=60)
TTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCT > SRR13214403.659922/1‑150 (MQ=60)
TTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCT > SRR13214403.3118084/1‑150 (MQ=60)
TACGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTA < SRR13214403.3956870/150‑1 (MQ=60)
ACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTAT < SRR13214403.2674927/150‑1 (MQ=60)
CGATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATA < SRR13214403.4404375/150‑1 (MQ=60)
ATTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAAT < SRR13214403.3209837/150‑1 (MQ=60)
ATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAAT < SRR13214403.2442511/150‑1 (MQ=60)
TTTATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATT < SRR13214403.1787961/150‑1 (MQ=60)
TTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGCTTCCTCCTATAATC > SRR13214403.410932/1‑150 (MQ=60)
TTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATC < SRR13214403.1449832/150‑1 (MQ=60)
TTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCG > SRR13214403.1801666/1‑150 (MQ=60)
TATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGG > SRR13214403.4602432/1‑150 (MQ=60)
TATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGG > SRR13214403.55812/1‑150 (MQ=60)
TATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGG > SRR13214403.2691272/1‑150 (MQ=60)
ATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGG > SRR13214403.1223762/1‑150 (MQ=60)
ATAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGG < SRR13214403.2830134/150‑1 (MQ=60)
TAAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGT < SRR13214403.987034/150‑1 (MQ=60)
AAATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTA < SRR13214403.3640292/150‑1 (MQ=60)
AAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTA > SRR13214403.465988/1‑150 (MQ=60)
AATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTGTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTAT < SRR13214403.1348638/150‑1 (MQ=60)
ATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATC > SRR13214403.4026293/1‑150 (MQ=60)
TAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCG > SRR13214403.3131348/1‑150 (MQ=60)
TAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCG > SRR13214403.3128464/1‑150 (MQ=60)
TGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGA < SRR13214403.1016214/150‑1 (MQ=60)
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ACTTTATCTTCATAAGTCAAAGCCCCCTTAATTTCTGGTTGGGTTTCCTTTGTTTTAGGAGTTTCTTTTTCTGCCATTGTTCCAAATGCTTTCATGTTTTCTTGTACCATAATATTCTCCTTTTATAATGTTATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGA > CP043523/838894‑839192
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |