Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 507 total aligned reads displayed.
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|
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TTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCC > SRR13214403.2537244/1‑150 (MQ=60)
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TTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCT > SRR13214403.1714561/1‑150 (MQ=60)
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TATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGG > SRR13214403.55812/1‑150 (MQ=60)
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AATTGATCAATGATTCCTGATTTTTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTAT > SRR13214403.1442174/1‑150 (MQ=60)
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ctgattttTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAAT < SRR13214403.2857337/142‑1 (MQ=60)
tgattttTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATA < SRR13214403.911212/143‑1 (MQ=60)
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CCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGG < SRR13214403.755869/150‑1 (MQ=60)
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TAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCG > SRR13214403.331461/1‑150 (MQ=60)
AATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGT < SRR13214403.4356819/150‑1 (MQ=60)
AATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGT < SRR13214403.70572/150‑1 (MQ=60)
TCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTT > SRR13214403.3739892/1‑150 (MQ=60)
TCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTT < SRR13214403.2284731/150‑1 (MQ=60)
TCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTT > SRR13214403.4030639/1‑150 (MQ=60)
CCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTA > SRR13214403.4563813/1‑150 (MQ=60)
AATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGG > SRR13214403.2100048/1‑150 (MQ=60)
AATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGG > SRR13214403.339257/1‑150 (MQ=60)
AATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGG < SRR13214403.2893364/150‑1 (MQ=60)
ATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGG < SRR13214403.3581045/150‑1 (MQ=60)
ATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGG > SRR13214403.4416460/1‑150 (MQ=60)
ATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGG < SRR13214403.3176094/150‑1 (MQ=60)
TAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTT < SRR13214403.505477/150‑1 (MQ=60)
TAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTT < SRR13214403.1894180/150‑1 (MQ=60)
AAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTA < SRR13214403.4050842/150‑1 (MQ=60)
AAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTA > SRR13214403.1150731/1‑150 (MQ=60)
AAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTAT < SRR13214403.3280943/150‑1 (MQ=60)
AAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATC > SRR13214403.2351462/1‑150 (MQ=60)
AAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTGTAGGGTTATC > SRR13214403.4396877/1‑150 (MQ=60)
ATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGT < SRR13214403.2130723/150‑1 (MQ=60)
TAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTC < SRR13214403.3715228/150‑1 (MQ=60)
TAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATC < SRR13214403.1314138/150‑1 (MQ=60)
AAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAACCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCT < SRR13214403.62189/150‑1 (MQ=60)
AAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCT < SRR13214403.1334379/150‑1 (MQ=60)
AAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTT < SRR13214403.3141407/150‑1 (MQ=60)
AAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTT < SRR13214403.2674527/150‑1 (MQ=60)
CCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTAC < SRR13214403.1402378/150‑1 (MQ=60)
GAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTA > SRR13214403.819279/1‑150 (MQ=60)
GAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTA < SRR13214403.3753361/150‑1 (MQ=60)
AATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAA < SRR13214403.1390300/150‑1 (MQ=60)
AATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAA > SRR13214403.982755/1‑150 (MQ=60)
ATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCAATTGATCCATACTATATAAAACGTTGTCGTTTAGGGCTATTGTATTTACTTAAT > SRR13214403.4037006/1‑150 (MQ=60)
ATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAAT < SRR13214403.178965/150‑1 (MQ=60)
ATTTTCCAAACTCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTA < SRR13214403.2092383/150‑1 (MQ=60)
TTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATT > SRR13214403.2544995/1‑150 (MQ=60)
TTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATT > SRR13214403.2938256/1‑150 (MQ=60)
TTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATT < SRR13214403.3782906/150‑1 (MQ=60)
CCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGAC < SRR13214403.831900/150‑1 (MQ=60)
CAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACT < SRR13214403.2383105/150‑1 (MQ=60)
CAAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACT > SRR13214403.4494099/1‑150 (MQ=60)
AAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTT > SRR13214403.1260709/1‑150 (MQ=60)
AAAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTT > SRR13214403.1924152/1‑150 (MQ=60)
AAATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTT > SRR13214403.895512/1‑150 (MQ=60)
AATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTT < SRR13214403.2406584/150‑1 (MQ=60)
AATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTT > SRR13214403.4322759/1‑150 (MQ=60)
atcacATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA < SRR13214403.3508313/145‑1 (MQ=60)
ATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA < SRR13214403.1805449/150‑1 (MQ=60)
ATCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTA < SRR13214403.1341405/150‑1 (MQ=60)
TCCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTAC > SRR13214403.3081065/1‑150 (MQ=60)
CCAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACT > SRR13214403.3916188/1‑150 (MQ=60)
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CAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTT < SRR13214403.2428803/150‑1 (MQ=60)
CAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTT < SRR13214403.2918722/150‑1 (MQ=60)
CAATAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTT < SRR13214403.1354753/150‑1 (MQ=60)
AATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTT > SRR13214403.572549/1‑150 (MQ=60)
AATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTT < SRR13214403.2942088/150‑1 (MQ=60)
ATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTA > SRR13214403.2166/1‑150 (MQ=60)
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TAGTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAA > SRR13214403.1579910/1‑150 (MQ=60)
AGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAG > SRR13214403.4127072/1‑150 (MQ=60)
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GTGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGT > SRR13214403.521114/1‑150 (MQ=60)
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TGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTT < SRR13214403.2049629/150‑1 (MQ=60)
NGAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTT > SRR13214403.722719/1‑150 (MQ=60)
GAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTT > SRR13214403.4432937/1‑150 (MQ=60)
GAAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTT > SRR13214403.2549736/1‑150 (MQ=60)
AAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTA < SRR13214403.3555685/150‑1 (MQ=60)
AAGATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTA > SRR13214403.3350852/1‑150 (MQ=60)
AGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAA > SRR13214403.3602538/1‑150 (MQ=60)
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ATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACT > SRR13214403.2784160/1‑150 (MQ=60)
ATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAGTTGGGTATCGAGTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACGCGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACC < SRR13214403.4501501/150‑1 (MQ=60)
ATACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGTGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACC < SRR13214403.1011576/150‑1 (MQ=60)
TACACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCG < SRR13214403.846932/150‑1 (MQ=60)
CACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTA > SRR13214403.1872737/1‑150 (MQ=60)
CACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTA > SRR13214403.2721342/1‑150 (MQ=60)
CACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTA > SRR13214403.4570152/1‑150 (MQ=60)
ACACAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTAT < SRR13214403.631200/150‑1 (MQ=60)
CAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTT < SRR13214403.538262/150‑1 (MQ=60)
AGCTATGAGTGCACCTACGATTCCCCCCATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTC < SRR13214403.4096624/150‑1 (MQ=60)
AGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTC > SRR13214403.3255515/1‑150 (MQ=60)
AGCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTC < SRR13214403.4592222/150‑1 (MQ=60)
GCAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCC < SRR13214403.733663/150‑1 (MQ=60)
CAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCA > SRR13214403.1251135/1‑150 (MQ=60)
CAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCA > SRR13214403.3683311/1‑150 (MQ=60)
CAATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCA < SRR13214403.1280482/150‑1 (MQ=60)
AATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAA > SRR13214403.4552619/1‑150 (MQ=60)
ATGAGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAAT < SRR13214403.2220627/150‑1 (MQ=60)
TGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATC < SRR13214403.94924/150‑1 (MQ=60)
GAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCC < SRR13214403.2425705/150‑1 (MQ=60)
GAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCC < SRR13214403.1743632/150‑1 (MQ=60)
AGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCA < SRR13214403.3471999/150‑1 (MQ=60)
AGTGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCA < SRR13214403.3470443/150‑1 (MQ=60)
GTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAA > SRR13214403.1322240/1‑150 (MQ=60)
GTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAA < SRR13214403.3274013/150‑1 (MQ=60)
TGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAA > SRR13214403.2876604/1‑150 (MQ=60)
TGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAA < SRR13214403.2182257/150‑1 (MQ=60)
TGCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAA < SRR13214403.2507472/150‑1 (MQ=60)
GCACCTACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAG < SRR13214403.4211953/150‑1 (MQ=60)
CCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAA < SRR13214403.1952007/150‑1 (MQ=60)
CTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAAC < SRR13214403.2450165/150‑1 (MQ=60)
TACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACT < SRR13214403.310434/150‑1 (MQ=60)
ACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTT < SRR13214403.1522719/150‑1 (MQ=60)
ACGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTT < SRR13214403.659570/150‑1 (MQ=60)
CGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTT < SRR13214403.810931/150‑1 (MQ=60)
CGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTT > SRR13214403.1072354/1‑150 (MQ=60)
CGATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTT > SRR13214403.865497/1‑150 (MQ=60)
GATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTT > SRR13214403.586474/1‑150 (MQ=60)
ATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTT < SRR13214403.875728/150‑1 (MQ=60)
ATTCCCCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTT > SRR13214403.1981867/1‑150 (MQ=60)
TTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTA > SRR13214403.2667715/1‑150 (MQ=60)
TCCTCCTATAATCGGGTATCGATTATTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAA < SRR13214403.3981255/150‑1 (MQ=60)
CCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTANC < SRR13214403.2634997/150‑1 (MQ=60)
CCCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGACCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACC < SRR13214403.4419650/150‑1 (MQ=60)
CCCTATAATTGGGTATCGATTTTTTTCGAAATAATCCATTGATCCCTCCTACATAACACGTTGGCGTTTAGGGTTATCATCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACCGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCC > SRR13214403.1432531/1‑150 (MQ=60)
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TATTTACGATTTATAAATAGATCAATGATTCCTGTCCTCTTTAAAAATAGACCAATATAAATTCCTAATCCAATTAAAAATAAAACCAGAATCATTTTCCAAAATCCAATAGTGAAGATACACAGAGCAATGAGTGCACCTACGATTCCTCCTATAATCGGGTATCGATTTTTTTCGAGATAATCCATTGATCCCTCCTATATAACACGTTGTCGTTTAGGGCTATCGTCTTTACTTAATGTATTGACTTTTACTTTAAGTTTAACTGTATGTTCCAATCCAAAGAAACTTTTTAACCC > CP043523/839025‑839323
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
