Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
9216842 |
90.5% |
8341242 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 549 total aligned reads displayed.
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|
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AATCATTCCAACTTTACTTCCTCGAATACTTGCCATGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCC < SRR13214403.1055709/150‑1 (MQ=60)
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ATGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCA > SRR13214403.2916540/1‑150 (MQ=60)
ATGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCA < SRR13214403.1466707/150‑1 (MQ=60)
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TGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCAC > SRR13214403.1815907/1‑150 (MQ=60)
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CCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAA < SRR13214403.899761/150‑1 (MQ=60)
CCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAA < SRR13214403.2852623/150‑1 (MQ=60)
GTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGA < SRR13214403.3769639/150‑1 (MQ=60)
GTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGA > SRR13214403.453604/1‑150 (MQ=60)
GTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGA > SRR13214403.1933461/1‑150 (MQ=60)
TTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGAC < SRR13214403.40295/150‑1 (MQ=60)
TTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACT > SRR13214403.93876/1‑150 (MQ=60)
TTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACT < SRR13214403.3928684/150‑1 (MQ=60)
TTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTT < SRR13214403.713211/150‑1 (MQ=60)
TTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTT < SRR13214403.478422/150‑1 (MQ=60)
TACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTA > SRR13214403.4105186/1‑150 (MQ=60)
TACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTA > SRR13214403.1884578/1‑150 (MQ=60)
ACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAA > SRR13214403.3322225/1‑150 (MQ=60)
CAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAAT > SRR13214403.2958125/1‑150 (MQ=60)
AATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATC > SRR13214403.336749/1‑150 (MQ=60)
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TCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAA > SRR13214403.1057996/1‑150 (MQ=60)
TCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAA > SRR13214403.3993146/1‑150 (MQ=60)
TCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAA < SRR13214403.3750215/150‑1 (MQ=60)
TCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAA > SRR13214403.1028126/1‑150 (MQ=60)
CACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAAT < SRR13214403.3082129/150‑1 (MQ=60)
ACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATA < SRR13214403.2021822/150‑1 (MQ=60)
ACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATA < SRR13214403.243651/150‑1 (MQ=60)
TCTTCCTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCA > SRR13214403.274356/1‑150 (MQ=60)
CTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCAT < SRR13214403.4130184/150‑1 (MQ=60)
CTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCAT < SRR13214403.849535/150‑1 (MQ=60)
atggtttaaagacatttagtccttctttatgaAGTTTGATTTTGGTTGTTTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGGTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAATCTTCACCACGTCGAAGACTTAAATCAATATCATAA < SRR13214403.1217804/118‑1 (MQ=60)
CTCATCCAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAAT > SRR13214403.1046469/1‑150 (MQ=60)
CTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAAT < SRR13214403.816682/150‑1 (MQ=60)
TCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATT < SRR13214403.361822/150‑1 (MQ=60)
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TCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCT > SRR13214403.2172161/1‑150 (MQ=60)
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CAATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTT > SRR13214403.2113157/1‑150 (MQ=60)
CAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTT > SRR13214403.2698391/1‑150 (MQ=60)
CAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACGTAAATCAATATCATAAATTGCTTT > SRR13214403.3954842/1‑150 (MQ=60)
AATAAAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTT < SRR13214403.1482076/150‑1 (MQ=60)
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ATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTT > SRR13214403.138401/1‑150 (MQ=60)
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AAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAA > SRR13214403.2730895/1‑150 (MQ=60)
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AAATGGATCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAA < SRR13214403.90378/150‑1 (MQ=60)
ATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAGTCAATATCATAAATTGCTTTTTGTAAT > SRR13214403.4088109/1‑150 (MQ=60)
ATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAAT > SRR13214403.1205997/1‑150 (MQ=60)
ATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAAT > SRR13214403.253007/1‑150 (MQ=60)
TGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATT < SRR13214403.1797847/150‑1 (MQ=60)
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GCCTCTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCATAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACC < SRR13214403.3505478/150‑1 (MQ=60)
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TTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCG > SRR13214403.503901/1‑150 (MQ=60)
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GTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAG < SRR13214403.704432/150‑1 (MQ=60)
GTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAA < SRR13214403.11119/150‑1 (MQ=60)
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GTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCAC > SRR13214403.1778991/1‑150 (MQ=60)
TTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACT > SRR13214403.292220/1‑150 (MQ=60)
TGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCGAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTT < SRR13214403.2106884/150‑1 (MQ=60)
TGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTT < SRR13214403.4283822/150‑1 (MQ=60)
TGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTT < SRR13214403.1260599/150‑1 (MQ=60)
TGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTT < SRR13214403.3690723/150‑1 (MQ=60)
TGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTT < SRR13214403.3712509/150‑1 (MQ=60)
GTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTG > SRR13214403.3037578/1‑150 (MQ=60)
TGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGT < SRR13214403.3338604/150‑1 (MQ=60)
TAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTT < SRR13214403.1844981/150‑1 (MQ=60)
TAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTT > SRR13214403.3798916/1‑150 (MQ=60)
AATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTT < SRR13214403.3179997/150‑1 (MQ=60)
AATCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTT > SRR13214403.2479064/1‑150 (MQ=60)
TCCCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGC < SRR13214403.1407227/150‑1 (MQ=60)
CCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTT < SRR13214403.3165315/150‑1 (MQ=60)
CCATAACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTT < SRR13214403.819104/150‑1 (MQ=60)
CCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTT > SRR13214403.2453753/1‑150 (MQ=60)
CATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTC > SRR13214403.2725633/1‑150 (MQ=60)
TAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCA < SRR13214403.4574271/150‑1 (MQ=60)
AACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAA > SRR13214403.837871/1‑150 (MQ=60)
AACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAA > SRR13214403.2864783/1‑150 (MQ=60)
AACAGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAA < SRR13214403.822050/150‑1 (MQ=60)
AACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTTCTTCCAA > SRR13214403.1355382/1‑150 (MQ=60)
CAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAA > SRR13214403.4422581/1‑150 (MQ=60)
AGCAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAAT < SRR13214403.2867944/150‑1 (MQ=60)
CAGTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATAT < SRR13214403.3441342/150‑1 (MQ=60)
GTTGCCAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTT < SRR13214403.277373/150‑1 (MQ=60)
GTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTT > SRR13214403.962701/1‑150 (MQ=60)
TGCGAAAGTTGATTTCCCAGAACCTGACTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTC < SRR13214403.4100322/150‑1 (MQ=60)
GCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCA > SRR13214403.1341738/1‑150 (MQ=60)
AAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACT > SRR13214403.186644/1‑150 (MQ=60)
AAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACT > SRR13214403.2650358/1‑150 (MQ=60)
AAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTT < SRR13214403.3005046/150‑1 (MQ=60)
AAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTT < SRR13214403.2415880/150‑1 (MQ=60)
AGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCTGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTC > SRR13214403.3601077/1‑150 (MQ=60)
TGATTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCAT > SRR13214403.2937327/1‑150 (MQ=60)
ATTTCCCAGAACCTGATTCCCCATCAATGGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAGGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCATAT < SRR13214403.4447141/150‑1 (MQ=60)
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TGAAAAATCATTCCAACTTTACTTCCTCGAATACTTGCCATGGAGTCACCCGTTTTACCAATCACTTCTTCCTCATCCAATAAAATGGAGCCTGTAATTTGAGTTTGATTTGGGTTGTGTAATCCCATAACAGCAGTTGCAAAAGTTGACTTCCCAGAACCTGATTCCCCAACAATAGCTAAAACTTCACCACGTCTAAGACTTAAATCAATATCATAAATTGCTTTTTGAAATTTACCAGCAATCCGAAAAGCAACACTCACTTGTTTTGCTTCCAAAATATTTTCACTTTCCACATT > CP043523/1444628‑1444926
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
