Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F250 I1 R1
|
466 |
525.0 |
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90.5% |
8341242 |
150.0 |
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N/A
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BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 281 total aligned reads displayed.
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|
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TATACTATAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACcaccg < SRR13214403.3532043/150‑6 (MQ=60)
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ATACTATAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTG > SRR13214403.1499342/1‑150 (MQ=60)
ACTATAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAA < SRR13214403.1033165/150‑1 (MQ=60)
ACTATAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAA > SRR13214403.1883842/1‑150 (MQ=60)
CTATAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAAC < SRR13214403.4337432/150‑1 (MQ=60)
CTATAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAAC > SRR13214403.869855/1‑150 (MQ=60)
TATAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACT > SRR13214403.762458/1‑150 (MQ=60)
TATAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACT > SRR13214403.1601928/1‑150 (MQ=60)
TAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCT < SRR13214403.2918376/150‑1 (MQ=60)
TAAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCT > SRR13214403.3645085/1‑150 (MQ=60)
AAAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACGTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAGTCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTG > SRR13214403.3785944/1‑150 (MQ=60)
AAAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGT > SRR13214403.2077101/1‑150 (MQ=60)
AAGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTA < SRR13214403.4105180/150‑1 (MQ=60)
AGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAA > SRR13214403.1329196/1‑150 (MQ=60)
AGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAA < SRR13214403.2247071/150‑1 (MQ=60)
AGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAA > SRR13214403.3078263/1‑150 (MQ=60)
AGTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAA > SRR13214403.4511462/1‑150 (MQ=60)
GTGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAA > SRR13214403.4354641/1‑150 (MQ=60)
TGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAG > SRR13214403.3168062/1‑150 (MQ=60)
TGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAG > SRR13214403.3169169/1‑150 (MQ=60)
TGGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAG > SRR13214403.562287/1‑150 (MQ=60)
GGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGA < SRR13214403.1306169/150‑1 (MQ=60)
GGACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGA > SRR13214403.1648933/1‑150 (MQ=60)
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GACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGAT > SRR13214403.1746589/1‑150 (MQ=60)
GACAGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGAT > SRR13214403.1609159/1‑150 (MQ=60)
AGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTAT < SRR13214403.3739075/150‑1 (MQ=60)
AGAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTAT < SRR13214403.2919069/150‑1 (MQ=60)
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GAAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATG < SRR13214403.1861305/150‑1 (MQ=60)
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GAAAATTGTGTGTTATAATCTGACTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATG < SRR13214403.3416442/150‑1 (MQ=60)
AAAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATGG > SRR13214403.4491056/1‑150 (MQ=60)
AAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATGGG < SRR13214403.276406/150‑1 (MQ=60)
AAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATGGG < SRR13214403.835992/150‑1 (MQ=60)
AAATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATGGG > SRR13214403.3150185/1‑150 (MQ=60)
ATTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATGGGGT > SRR13214403.1953275/1‑150 (MQ=60)
TTGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATGGGGTA > SRR13214403.1146566/1‑150 (MQ=60)
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TTATCCGTGACAATTACTCTAGGTTCAACAAACTGCTTATGTAGTCGTTTCAAGAATGCATAAGCCGCTTGAGTATCCCGTTTCTTTCGTAACCAGATATCTAAAGTCAATCCAAAC‑‑TGGAGCTATACTATAAAAGTGGACAGAAAAATGTGTGTTATAATCTGTCTATTAAGACACAAAAATGAAAGGACTTTTATGTCAGGTTTTAAACGTTACGACGAGGATTTCAAACAATCGCTCGTTAATCTCTATCAAACTGGTAAAACACAAACTGAACTCTGTAAAGATTATGGGGTA > CP043523/1882649‑1882945
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
