Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
80 |
267.1 |
3493306 |
94.4% |
3297680 |
232.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002745 |
2,561,821 |
C→T |
pseudogene (1997/4115 nt) |
SA_RS14965 ← |
E domain‑containing protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002745 | 2,561,821 | 0 | C | T | 97.3%
| 407.9
/ NA
| 185 | pseudogene (1997/4115 nt) | SA_RS14965 | E domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/0); new base T (76/103); total (82/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.54e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
TGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGCCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTATTCTGTTAATTCATTAATCGGATCTTTTGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATT > NC_002745/2561590‑2562027
|
tgtgATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCt < 1:101596/234‑1 (MQ=25)
tctcTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTa < 1:167652/234‑1 (MQ=21)
tcttctTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTTCg > 2:548752/1‑234 (MQ=18)
cttcttTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCAGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGt < 1:1493391/234‑1 (MQ=21)
tttCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTTACTACGtctcn > 1:797846/1‑233 (MQ=25)
tttCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTTACTACGtctcn > 2:564924/1‑233 (MQ=25)
tttCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTTCGTCTcc > 1:678598/1‑234 (MQ=25)
tttCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGCCGGTGTTGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAACTCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTTTCGACCGGCGGCCTACCTTCgcttcn > 2:1715815/1‑229 (MQ=255)
gATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGtt < 2:1347930/234‑1 (MQ=25)
aTTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGttt > 1:1554510/1‑234 (MQ=25)
ttCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTc < 1:1126925/234‑1 (MQ=25)
tCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCt < 1:795727/234‑1 (MQ=25)
tCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCt < 1:922484/234‑1 (MQ=25)
tCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTAGTGCTAAATCAGGATTGAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTGACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCt < 1:300585/234‑1 (MQ=255)
cACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGGCTAACTTCGTcccccttttttg > 2:858623/1‑226 (MQ=255)
ccTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGa > 1:392978/1‑234 (MQ=25)
taataaTTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACTGGCTGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTaa < 2:697599/234‑1 (MQ=25)
aaataatTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTATTGTCGGTGTCGTGATTGTCATCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTaa < 1:1362411/233‑1 (MQ=255)
atTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCt < 1:1325472/234‑1 (MQ=25)
ttCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTTCTgg > 1:1744733/1‑234 (MQ=25)
ttCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCCTACTACTTCTCCTGTTTTTGGATTTTTCATTCCCgg > 2:1534248/1‑234 (MQ=11)
ttCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGCTATTGTCTTCTCAGCTTTTTGCCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAGATCAGGAATAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGCATCCCCTCTTTTTCTACAATCGAGTCGCCTTTTACAGGTCTATATTTTGCTACGCTATCGACCGGCGGTCTTACCACGGCGCCCGTCTCTGGAGTcccttcttccgg > 2:455067/1‑223 (MQ=11)
tcCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTTATTCCTGGttt > 1:342373/1‑234 (MQ=25)
ttAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTg < 1:455067/234‑1 (MQ=25)
ttAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTg < 2:1744733/234‑1 (MQ=25)
ggATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCTAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTTCAACTTCGTTTTCCGTTTTTTGGTTTTTTATTCCTTGtttctcttgtact > 2:1448272/1‑224 (MQ=11)
ttttAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAActtcttc < 1:780692/234‑1 (MQ=25)
ttttAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAActtcttc < 1:93854/234‑1 (MQ=25)
tAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCttcttt > 1:818078/1‑234 (MQ=25)
gtgtcggtgtcgTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCttctttct < 1:1514758/234‑1 (MQ=25)
gtgtcggtgtcgTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCttctttct < 1:89314/234‑1 (MQ=25)
ggtgtcgTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTTTAACTTCTTCTCCTGTTTTTTGGTTTTTTATTTCCGGTTTGACTGGGACTTTttcttttgcttnn > 2:780692/1‑227 (MQ=11)
gtcgTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGtt < 1:326602/234‑1 (MQ=17)
gtcgTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGtt < 1:83614/234‑1 (MQ=17)
aTTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTTACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTTTCCCCTTTTGGTAAc > 2:206968/1‑234 (MQ=12)
aTTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAAc > 2:664469/1‑234 (MQ=17)
aTTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAAc > 1:1736200/1‑234 (MQ=17)
ttctCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTTTCCTGTTGGTAACTTCGGa > 2:1190888/1‑234 (MQ=17)
ttctCACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGACTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTTACTACGTCGCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGGACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTACCTTCCGa > 2:537833/1‑234 (MQ=255)
tcACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGCTTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTTGTAACTTCGGATCa > 1:988437/1‑234 (MQ=17)
tcACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCa > 2:1120742/1‑234 (MQ=17)
tcACCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCa > 1:1250856/1‑234 (MQ=17)
aCCTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCaaa > 1:57983/1‑234 (MQ=17)
ccTTTTTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAAt < 2:1250856/234‑1 (MQ=17)
tGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGtct < 2:734125/234‑1 (MQ=17)
gTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGCTTAAATTTACGTTCTTTCTCGACTGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTTCCTGGGACTTCTTTTTTTTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATTCAATTCGgctc > 2:1599797/1‑234 (MQ=11)
gTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAAGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGGACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGCTCCAATTCGcctc > 2:443872/1‑234 (MQ=255)
ttCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATg < 2:818078/234‑1 (MQ=17)
tctTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGAcn > 1:1523237/1‑233 (MQ=17)
ctTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCt < 1:1120742/234‑1 (MQ=17)
ttGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGAtt > 1:439201/1‑228 (MQ=17)
tGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTgg < 2:361907/234‑1 (MQ=17)
gTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGgc < 1:870025/234‑1 (MQ=17)
gTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGgc < 1:548752/234‑1 (MQ=17)
tACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGgcgc < 2:1564020/234‑1 (MQ=17)
tACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGgcgc < 1:578688/234‑1 (MQ=17)
tACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGgcgc < 1:1602851/234‑1 (MQ=17)
tACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGgcgc < 1:1703118/234‑1 (MQ=17)
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aCTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTACGTCTCCTGTTTCTGGTTTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGgcgc > 2:599795/1‑233 (MQ=17)
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BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 218 total aligned reads displayed.
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|
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TTTGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTTC‑‑GTTTCCNN > SRR12793240.944408/1‑250 (MQ=34)
TTTGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCNNN > SRR12793240.44508/1‑250 (MQ=35)
TTTGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTG < SRR12793240.140526/250‑1 (MQ=35)
TTTGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGCCTAACTAnnnnnnnnn > SRR12793240.943424/1‑241 (MQ=54)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGT < SRR12793240.1694071/214‑1 (MQ=37)
NATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCT < SRR12793240.232290/250‑1 (MQ=35)
GATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAnnnnnnnnnnnnnn > SRR12793240.593086/1‑236 (MQ=34)
GATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTNN > SRR12793240.2148501/1‑250 (MQ=35)
GATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCCGTTTNN > SRR12793240.621322/1‑250 (MQ=34)
CTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTCAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑Gactcccttttcttgt > SRR12793240.1676893/1‑235 (MQ=30)
CTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCAGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGA < SRR12793240.2064304/250‑1 (MQ=34)
CTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATT > SRR12793240.545178/1‑250 (MQ=35)
CGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTTACTAC‑‑GCCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATT > SRR12793240.874825/1‑250 (MQ=34)
NATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTTGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGT‑CATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCC < SRR12793240.518219/250‑1 (MQ=17)
NATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTC < SRR12793240.1561548/250‑1 (MQ=35)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTA < SRR12793240.984036/157‑1 (MQ=21)
ATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCTGTTCATGGATTTCTTAGTGTCGGTGTTGTTTTTGTCTGCTCGCCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCC < SRR12793240.500545/250‑1 (MQ=31)
ATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCC < SRR12793240.1346256/250‑1 (MQ=35)
ATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCC < SRR12793240.1282487/250‑1 (MQ=35)
ATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCC < SRR12793240.2390912/250‑1 (MQ=35)
ATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCC < SRR12793240.1108739/250‑1 (MQ=35)
ATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCC < SRR12793240.785500/250‑1 (MQ=35)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCC < SRR12793240.1287450/76‑1 (MQ=0)
CCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GGCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTTCTGGTT > SRR12793240.2410092/1‑250 (MQ=34)
TTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTTATTCCTTGTTTAN > SRR12793240.474530/1‑250 (MQ=34)
ACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCT < SRR12793240.1210981/250‑1 (MQ=35)
ACAAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTATTGTCGGTGTCGTGATTGTCATCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCT < SRR12793240.1884125/250‑1 (MQ=33)
CTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTTTCCTGTTTCTGGATcttttattcctggcttacnnn > SRR12793240.1516740/1‑229 (MQ=35)
TAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAAC < SRR12793240.1833444/250‑1 (MQ=35)
TAATTCCTACAGTTAATGGATTGTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAAC < SRR12793240.164196/250‑1 (MQ=33)
TTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTTGTTATTGTCTTCTTACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCCCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTTTTTTTCTACAATCGAGTTTCCTTTTACAGGCCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAT‑‑GTCTCCCGTCTCCGGATTCTTTATTCCTGGGTTACCTGGGACTTN > SRR12793240.2177024/1‑250 (MQ=28)
nnnnnnnnnnnnnATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTC < SRR12793240.1483387/237‑1 (MQ=36)
CTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTC < SRR12793240.2327339/250‑1 (MQ=35)
CCAGTTAAAGGATTATTTAGGATCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTT < SRR12793240.1092145/250‑1 (MQ=28)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTC < SRR12793240.1064490/205‑1 (MQ=19)
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TTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTGTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTG < SRR12793240.2069733/250‑1 (MQ=34)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTG < SRR12793240.827799/180‑1 (MQ=20)
TAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTGCTTTTTCTGTCCCTGGTGCTGAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTACTCGAATCGAATCTCTTCTTATTCTTCAATCGGGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAAC < SRR12793240.444110/250‑1 (MQ=31)
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TAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCGTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTGCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTGCTACAAGCGAGGCTCCTTTTACAGGTCCATATTGTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAAC < SRR12793240.1947701/250‑1 (MQ=32)
GTGTTGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn > SRR12793240.413180/1‑218 (MQ=18)
GTGTTGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTT > SRR12793240.2398230/1‑250 (MQ=17)
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GTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATTTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAATTCG‑‑GTCTCTTGTTTCTGGTTTCTAAATTCCGGGTTTCCTGGGAACTCCTTCTTCCTCTCCTGTTGGTAAATT > SRR12793240.2017923/1‑250 (MQ=11)
GTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGCTTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTT > SRR12793240.425675/1‑250 (MQ=31)
GTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTTCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTTTCCTGTTGGTAACTT > SRR12793240.1710200/1‑250 (MQ=30)
GTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTT > SRR12793240.1538856/1‑250 (MQ=31)
GTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTT > SRR12793240.347314/1‑250 (MQ=31)
TGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTC < SRR12793240.657225/250‑1 (MQ=30)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAAC < SRR12793240.1788457/202‑1 (MQ=19)
GGTGTTGTTATTGTCTTCTCACCTTTTTGTCCTGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTT > SRR12793240.919800/1‑250 (MQ=18)
GGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGAT > SRR12793240.1751512/1‑250 (MQ=23)
NTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATC < SRR12793240.452349/250‑1 (MQ=19)
NTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATC < SRR12793240.979129/250‑1 (MQ=19)
NTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATC < SRR12793240.115690/250‑1 (MQ=19)
GTGTTGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATAGACCGGCGGTCT‑CCCACCGGCCTCC‑GGTTCTGGATTTTTGATTCCTGGTTTTTCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATN > SRR12793240.1035090/1‑250 (MQ=14)
GTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTTCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn > SRR12793240.591918/1‑181 (MQ=5)
GTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTTTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTTCCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTTGGATCAA > SRR12793240.1213379/1‑250 (MQ=17)
TCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGCTTCTTAATTCCTGGGTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTTGTAACTTCGGATCAAA > SRR12793240.1372499/1‑250 (MQ=17)
TCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAA > SRR12793240.1229510/1‑250 (MQ=17)
TCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAA > SRR12793240.1731306/1‑250 (MQ=17)
GTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTTGATTCTTAATTTCTGGGTTACCTGGGACTTTTTTTTTCTCTTCTGTTGGgaacctcnnnnnnnnnn > SRR12793240.1791104/1‑233 (MQ=16)
GTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGGTTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATT > SRR12793240.2283703/1‑250 (MQ=17)
GTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCACATT > SRR12793240.376151/1‑250 (MQ=17)
GTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATT > SRR12793240.1943126/1‑250 (MQ=17)
GTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATT > SRR12793240.80094/1‑250 (MQ=17)
TTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTTGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTC < SRR12793240.744586/250‑1 (MQ=0)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATT < SRR12793240.2231293/198‑1 (MQ=19)
CACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACC < SRR12793240.1559269/250‑1 (MQ=17)
CACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACC < SRR12793240.464866/250‑1 (MQ=17)
CCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACNNN > SRR12793240.2105118/1‑250 (MQ=17)
CCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GCCTCCTGTTTCTGGATTCTTTATTCCTGGTTTACCTGGTACTTTTTTTTTCTCTCCTTTTGTTAACTTCGGATCAAATTCGTtnnnnnnnnnnn > SRR12793240.344026/1‑238 (MQ=16)
TTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATTACCTGGN > SRR12793240.609397/1‑250 (MQ=17)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTTCCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGC < SRR12793240.1657256/200‑1 (MQ=19)
GTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGCCTCCTTTTCCAGGTCCTTATTTTGTAACGCAATCGACCGGCGGCCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTACTTTCGGTTCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTAT > SRR12793240.404178/1‑250 (MQ=31)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGtgttatc < SRR12793240.1701146/182‑8 (MQ=7)
CCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTGTCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTG < SRR12793240.1860252/250‑1 (MQ=17)
CTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACTTGGCACTTCTCCTTTTTCTTCTGTTGGTAAttttggtttaaaatcgtcctggtgacttggcgctattgt > SRR12793240.2409071/1‑211 (MQ=17)
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTT < SRR12793240.2240999/220‑1 (MQ=18)
CTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTC < SRR12793240.1553109/250‑1 (MQ=17)
TCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCA > SRR12793240.428502/1‑250 (MQ=17)
CTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTTTGGATTCTTAATTCCTGGTTTTCCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTTACTTCCGATCAAATTCGTCTCGATTACCTGGTGCTATTGTTTttg > SRR12793240.460216/1‑247 (MQ=16)
CTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTTATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGCTGACCTGGCGCTATTTTTTCCG > SRR12793240.851707/1‑250 (MQ=17)
TTGTTTCTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAAAGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGG < SRR12793240.1243097/250‑1 (MQ=17)
TTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGG < SRR12793240.1210823/250‑1 (MQ=17)
TTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGG < SRR12793240.762481/250‑1 (MQ=17)
NTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTC < SRR12793240.1157782/250‑1 (MQ=17)
NTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTC < SRR12793240.834493/250‑1 (MQ=17)
NTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTC < SRR12793240.2352956/250‑1 (MQ=17)
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NTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATCGTTTCTGGTC < SRR12793240.2214824/250‑1 (MQ=17)
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NTTACTTTTTCTGTCCCAGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTC < SRR12793240.1342028/250‑1 (MQ=17)
GTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTN > SRR12793240.1786472/1‑250 (MQ=17)
TACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCTGCGTCCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTCGATTCTTAATTCCATGTTTACCTGGGACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATTACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCG > SRR12793240.555663/1‑250 (MQ=32)
TTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTGCAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGGTCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTAT < SRR12793240.1614249/250‑1 (MQ=17)
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TTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTAT < SRR12793240.1649029/250‑1 (MQ=17)
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TTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTGATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTATTC < SRR12793240.1286734/250‑1 (MQ=17)
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TTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTATTCTGTTAATTCATTAATCGGATCTTTTGTGATC < SRR12793240.2370444/250‑1 (MQ=17)
nnnnnnnTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGTGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTATTCTGTTAATTCATTAATCGGATCTTTTGTGATCTCT < SRR12793240.1280763/243‑1 (MQ=0)
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TTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTATTCTGTTAATTCATTAATCGGATCTTTTGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAG < SRR12793240.1289099/250‑1 (MQ=0)
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CCGGCGGTCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTATTCTGTTAATTCATTAATCGGATCTTTTGCGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTACTAATTTCTCCAGTTACTGGATTTTTTAGTGTTGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTT > SRR12793240.1434477/1‑250 (MQ=0)
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TAATCGGATCTTTTGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTCGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTTT‑‑‑‑‑TGTCCTTCTCTTGTTACTTTTTCTGTCCCTGGTGCTAAATCAGGATTAAATTTACGTTCTTTCTCGAATGGAATCTCTTCTTTTTCTACAATCGAGTCTCCTTTTACAGGTCCATATTTTGTTACGCTATCGACCGGCGGCCTAACTAC‑‑GTCTCCTGTTTCTGGATTCTTAATTCCTGGTTTACCTGGAACTTCTTCTTTCTCTCCTGTTGGTAACTTCGGATCAAATTCGTCTCGATGACCTGGCGCTATTGTTTCAGGTCCGTATTCTGTTAATTCATTAATCGGATCTTTTGTGATCTCTTCTTTCGATTCACCTTTACTAATAATTTCTCCAGTTAATGGATTTTTTAGTGTTGGTGTCGTTATTGTCTTCTCACCTTT > NC_002745/2561577‑2562063
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |