Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F21 I1 R7
|
781 |
589.5 |
21734725 |
98.3% |
21365234 |
134.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
252,913 |
G→A |
A126T (GCA→ACA) |
yafP → |
GNAT family N‑acetyltransferase |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 252,913 | 0 | G | A | 100.0%
| 844.0
/ NA
| 218 | A126T (GCA→ACA) | yafP | GNAT family N‑acetyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (131/87); total (131/87) |
Only 100 of 218 total aligned reads displayed.
TGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAA > NZ_CP025268/252776‑253049
|
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gTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAg < 1:5970427/140‑1 (MQ=255)
ttATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGt > 1:7245251/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTa > 1:8096412/1‑140 (MQ=255)
tgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagc > 1:5482063/1‑140 (MQ=255)
tgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagc < 2:5725518/140‑1 (MQ=255)
tgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagc > 2:4990197/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 1:7650515/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 1:8387734/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 2:1499366/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 1:5327814/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 1:1838207/1‑140 (MQ=255)
cTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAgcgc > 2:1701550/1‑140 (MQ=255)
tGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGcgcg < 2:2461781/140‑1 (MQ=255)
gAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGt > 2:351002/1‑140 (MQ=255)
aaTACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGtt > 2:3214215/1‑140 (MQ=255)
aTACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTg > 2:4085663/1‑140 (MQ=255)
cccGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGc > 2:8055396/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagca < 2:1852714/123‑1 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 1:2106582/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:1369726/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:8296860/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:6342804/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:1989191/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:8435198/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:9415792/1‑140 (MQ=255)
gTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGa < 2:10247386/140‑1 (MQ=255)
gggTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGa < 1:7445390/137‑1 (MQ=255)
gggTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGa > 2:7445389/1‑137 (MQ=255)
gggTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCg < 2:10403097/140‑1 (MQ=255)
gTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTg < 1:2871534/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGtt > 2:6143792/1‑140 (MQ=255)
cAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTa < 1:8099814/140‑1 (MQ=255)
cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTa > 2:6686490/1‑140 (MQ=255)
gcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATGACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTaa > 1:2992135/1‑140 (MQ=255)
tGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAAtttt > 2:10630156/1‑140 (MQ=255)
tGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAAtttt > 1:1293343/1‑140 (MQ=255)
gTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAAttttt < 2:9595020/140‑1 (MQ=255)
aaaCCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTatat > 2:2638671/1‑140 (MQ=255)
tttGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGat > 2:6904526/1‑140 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTa > 1:3837456/1‑123 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATg < 2:2822590/134‑1 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGatat > 2:2107631/1‑140 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGatat > 2:7266963/1‑140 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGatat > 2:1548098/1‑140 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGatat > 2:6115986/1‑140 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGatat > 1:1422655/1‑140 (MQ=255)
gATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGAtata < 1:6404983/140‑1 (MQ=255)
aGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCg > 2:7510703/1‑140 (MQ=255)
aGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCg > 2:1779637/1‑140 (MQ=255)
gTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGc < 2:1002087/140‑1 (MQ=255)
gTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGc > 2:7922377/1‑140 (MQ=255)
gTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGc > 1:1040399/1‑140 (MQ=255)
tCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCa < 1:10000645/140‑1 (MQ=255)
tCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCa < 2:5482063/140‑1 (MQ=255)
aaTCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACAt > 2:10787514/1‑140 (MQ=255)
aaTCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACAt > 1:7061956/1‑140 (MQ=255)
aaCTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATc > 1:6752966/1‑140 (MQ=255)
aaCTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATc > 1:10374693/1‑140 (MQ=255)
aaCTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATc > 1:8565029/1‑140 (MQ=255)
aaCTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATc > 1:798612/1‑140 (MQ=255)
tACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGc > 1:107695/1‑140 (MQ=255)
tGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCa < 1:2692702/140‑1 (MQ=255)
gACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAAt > 1:4207234/1‑140 (MQ=255)
aCGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGATCGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAAAATTAAATCCAGCTTGCAATg < 1:8894221/140‑1 (MQ=255)
aCGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATg > 1:9764013/1‑140 (MQ=255)
cGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAGGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg < 1:9121031/77‑1 (MQ=255)
cGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGa > 2:5983058/1‑140 (MQ=255)
aaGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGaaaa > 2:4044606/1‑140 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTatat < 1:613153/94‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCTATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 1:2157770/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCa > 1:3513782/1‑128 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCa > 1:1706551/1‑128 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 1:10630157/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 1:6491358/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg > 2:2766108/1‑140 (MQ=255)
aaCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGAATGTTAAGCAGCAGCGAGTTGAATGCCGGGTAGCGTGGTTTACTAATTTTTATAGGAGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGATTGCAATGAAAATAAcgc < 2:9189623/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 2:45204/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 1:8604331/140‑1 (MQ=255)
gCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcccgc < 1:9896520/140‑1 (MQ=255)
cAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCa < 1:933134/103‑1 (MQ=255)
aaaCCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTg < 2:9062210/140‑1 (MQ=255)
aaCCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCa < 2:5271117/119‑1 (MQ=255)
ccTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCTCAACATTAAATACAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTAt > 2:7173332/1‑140 (MQ=255)
aaCGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATaaa > 2:3765452/1‑83 (MQ=255)
aaCGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATaaa < 1:4474914/83‑1 (MQ=255)
aaCGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATaaa < 1:3765452/83‑1 (MQ=255)
aCGTTATGGTTTTNAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGttt > 1:5754122/1‑140 (MQ=255)
aCGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcccgcc > 2:7862913/1‑124 (MQ=255)
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tATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTg > 1:903241/1‑140 (MQ=255)
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GTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCtgtct > SRR14920197.4004301/1‑146 (MQ=60)
GTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATAT > SRR14920197.6714054/1‑151 (MQ=60)
GTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATAT > SRR14920197.11098578/1‑151 (MQ=60)
GTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATAT > SRR14920197.2945262/1‑151 (MQ=60)
GTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATAT > SRR14920197.1485219/1‑151 (MQ=60)
ggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAAC < SRR14920197.640544/116‑1 (MQ=60)
AACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACC < SRR14920197.9497764/151‑1 (MQ=60)
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agatgtagagaggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTA < SRR14920197.3929393/105‑1 (MQ=60)
AGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAAT > SRR14920197.8705815/1‑151 (MQ=60)
AGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAAACGCAAAACCCTGTTTTGAACGTTATGGTTTTAAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGACGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATTCGATATAAACCGCAACA‑TTAAAT > SRR14920197.8451369/1‑151 (MQ=60)
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ggctcggagatgtgtataagagacagAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCC < SRR14920197.974063/125‑1 (MQ=60)
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TCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCC < SRR14920197.11268865/151‑1 (MQ=60)
TCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCC < SRR14920197.7834589/151‑1 (MQ=60)
TCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCC < SRR14920197.6382563/151‑1 (MQ=60)
TCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCC < SRR14920197.10425735/151‑1 (MQ=60)
GAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGC > SRR14920197.112778/1‑151 (MQ=60)
GAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGC < SRR14920197.1174184/151‑1 (MQ=60)
AACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAAT > SRR14920197.4390330/1‑151 (MQ=60)
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TGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAC < SRR14920197.2810273/151‑1 (MQ=60)
GGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACC > SRR14920197.1781027/1‑151 (MQ=60)
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ACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGATCGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAAAA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCC < SRR14920197.9274830/151‑1 (MQ=60)
ACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCC > SRR14920197.9402057/1‑151 (MQ=60)
CGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatcgcgtatgccgtcttctgcttgaaaggggggggggggggggggggg > SRR14920197.3304597/1‑62 (MQ=60)
CATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACctgtctctta > SRR14920197.5500719/1‑141 (MQ=60)
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TAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTA < SRR14920197.6773547/151‑1 (MQ=60)
TAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTA < SRR14920197.1774294/151‑1 (MQ=60)
TAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTA < SRR14920197.8902601/151‑1 (MQ=60)
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tgtgtataagagacagACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCG < SRR14920197.1981968/135‑1 (MQ=60)
gacagCCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCG < SRR14920197.8201323/146‑1 (MQ=60)
ACCCTTTTTTGATAGTTATTGTTTTCAGTCATTAAAGAAGCCGAGCTTTGAATGCCGGTGAGCGTGTTTTACTAATTTTTATATGCGTTATAAACCG‑AACATTTATATCAAGATTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTT < SRR14920197.10701898/151‑1 (MQ=51)
ACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatcgcgtatgccgtcttctgcttgaaaaggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggggg > SRR14920197.10839942/1‑38 (MQ=60)
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TTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAA > SRR14920197.9677105/1‑151 (MQ=60)
TATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAAC < SRR14920197.2672577/151‑1 (MQ=60)
GTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCA > SRR14920197.5590752/1‑151 (MQ=60)
TTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAActgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatgccgtcttctgctttaaaatgggggggggggggggggggggggggg > SRR14920197.7485812/1‑54 (MQ=60)
TTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCTCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAAG < SRR14920197.1616051/151‑1 (MQ=60)
TCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAGAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAAGGA < SRR14920197.1430006/151‑1 (MQ=60)
TCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAAGGA < SRR14920197.9020953/151‑1 (MQ=60)
GACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAAGGAGGT < SRR14920197.5862472/151‑1 (MQ=60)
GACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAAGGAGGT < SRR14920197.1857057/151‑1 (MQ=60)
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CATTATATCGATATGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACA‑TTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAAGGAGGT > NZ_CP025268/252763‑253062
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |