Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
252,913 |
G→A |
A126T (GCA→ACA) |
yafP → |
GNAT family N‑acetyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 252,913 | 0 | G | A | 99.2%
| 507.6
/ NA
| 134 | A126T (GCA→ACA) | yafP | GNAT family N‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (55/78); minor base C (0/1); total (55/79) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACA > NZ_CP025268/252776‑253048
|
gTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAg < 1:626683/140‑1 (MQ=255)
gTTATTTGTCGACCATGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTCATTAAGTCTGAATCCGCACTTACCGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAg < 2:4424530/140‑1 (MQ=255)
ttATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGt > 1:4804063/1‑140 (MQ=255)
ttATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGt > 1:4802880/1‑140 (MQ=255)
ttATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGt > 1:1790221/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATCACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTa > 2:2979276/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATCACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTa > 2:2979313/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACCGTTa > 2:2977996/1‑140 (MQ=255)
aTTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTa > 2:670205/1‑140 (MQ=255)
ttgttgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAag < 1:1464723/140‑1 (MQ=255)
ttgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcag < 1:3129378/140‑1 (MQ=255)
tgACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagc > 1:727410/1‑140 (MQ=255)
gACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagca > 1:3763711/1‑140 (MQ=255)
gACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagca < 2:2585735/140‑1 (MQ=255)
gACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTGATGGTTTTCAGACAGTTAatcagca > 2:705044/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 2:3177618/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 2:1206867/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 2:4972086/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 1:815077/1‑140 (MQ=255)
aCCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAagcagcag > 1:3101578/1‑140 (MQ=255)
cTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAgcgc > 1:1689779/1‑140 (MQ=255)
tGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGcgcg < 1:3501980/140‑1 (MQ=255)
gAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGt < 2:4444189/140‑1 (MQ=255)
aaTACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGtt < 1:3740397/140‑1 (MQ=255)
cacCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAAt < 2:1917945/140‑1 (MQ=255)
ccgccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGcc > 1:841714/1‑140 (MQ=255)
ccgccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGcc < 2:2146133/140‑1 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 1:497986/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 1:460703/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 1:4233583/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 2:4033309/1‑140 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg < 1:1211654/140‑1 (MQ=255)
ccgTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCggg > 1:1924109/1‑140 (MQ=255)
gTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCGGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGa < 1:4824809/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGtt > 1:3501114/1‑140 (MQ=255)
cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGGACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTa > 1:197550/1‑140 (MQ=255)
cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTAc < 2:4636411/138‑1 (MQ=255)
cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTAc > 1:4636411/1‑138 (MQ=255)
cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTa < 1:5198338/140‑1 (MQ=255)
cgcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTa > 1:1529488/1‑140 (MQ=255)
gcTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTaa < 1:837378/140‑1 (MQ=255)
tttGTTAAAAACTTTGATTAAGACAGAATACGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGGAAAACTATTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGACGGGGAGCGTGGTTTACTAAtg > 2:1990023/1‑139 (MQ=255)
tGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAAtttt > 1:704934/1‑140 (MQ=255)
tGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAAtttt > 1:704965/1‑140 (MQ=255)
aaaCCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTatat < 2:497986/140‑1 (MQ=255)
aaCTTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATATTCGCATAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATg < 2:1810570/140‑1 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGatat > 1:162800/1‑140 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGatat > 2:754020/1‑140 (MQ=255)
tGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGatat > 2:5159195/1‑140 (MQ=255)
aGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCg < 1:2380523/140‑1 (MQ=255)
gTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGc > 2:4904823/1‑140 (MQ=255)
tCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAACACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCa < 2:1544781/140‑1 (MQ=255)
tCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCa < 1:174559/140‑1 (MQ=255)
aaCTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATc > 1:1875094/1‑140 (MQ=255)
aaCTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATc > 2:428692/1‑140 (MQ=255)
tACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGc < 1:2960027/140‑1 (MQ=255)
tACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGc > 1:1587769/1‑140 (MQ=255)
cGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCtt < 2:4354641/140‑1 (MQ=255)
cATAACTGCAACACCCTGTTTTGCAGGTTATGGTTTTCAGACGGTTAAGCAGCAGCGCCTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATCTGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGACCATaa < 2:3035190/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACATTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATACACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 2:2518002/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCCGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATACACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 2:4447876/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 2:3294952/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 2:436674/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 1:4154138/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 1:1499878/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 1:290852/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 1:3242995/140‑1 (MQ=255)
tAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 1:3243008/140‑1 (MQ=255)
aCCTCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCCGCCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 2:2768037/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCTATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 2:3728895/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 2:1394863/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 2:3861854/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 1:3436053/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAAGCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 2:3728785/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGAGATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 2:4749566/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGACATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 2:4749374/140‑1 (MQ=255)
aCCGCAAAACCCTTTTCTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGACTGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcc < 1:2885122/140‑1 (MQ=255)
ccGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgccc > 1:4196625/1‑140 (MQ=255)
ccGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgccc > 1:1216808/1‑140 (MQ=255)
ccGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg > 1:492571/1‑137 (MQ=255)
ccGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcg < 2:492571/137‑1 (MQ=255)
cGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcccg < 2:2666319/140‑1 (MQ=255)
cAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGCTATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAcgcccgcc < 1:1727975/140‑1 (MQ=255)
aaaaCCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCt > 2:1840406/1‑140 (MQ=255)
ttttttGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCATGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTAtct > 2:3097583/1‑138 (MQ=255)
aaCGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGtt > 1:292826/1‑140 (MQ=255)
tATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGGAGCGCGTTGGATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATTGGAGATATACACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAAAGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTg < 2:1817892/140‑1 (MQ=255)
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tATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTg < 1:3066249/140‑1 (MQ=255)
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TAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTA < SRR14920191.4166175/151‑1 (MQ=60)
TAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTA < SRR14920191.291721/151‑1 (MQ=60)
ACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATG < SRR14920191.3445664/151‑1 (MQ=60)
ACCGCAAAACCCTTTTCTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGACTGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATG < SRR14920191.2893281/151‑1 (MQ=60)
CAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGCTATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCG < SRR14920191.1732657/151‑1 (MQ=60)
CAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCG < SRR14920191.3584236/151‑1 (MQ=60)
ACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTT > SRR14920191.1570066/1‑151 (MQ=60)
ACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTT > SRR14920191.293707/1‑151 (MQ=60)
TTTGAACGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGAT < SRR14920191.4986509/151‑1 (MQ=60)
CGTTATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACA > SRR14920191.373705/1‑151 (MQ=60)
TATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAAC < SRR14920191.3074882/151‑1 (MQ=60)
ATGGTTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACT < SRR14920191.3246182/151‑1 (MQ=60)
TTTTCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAA < SRR14920191.2648602/151‑1 (MQ=60)
TCAGACAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAAGGA < SRR14920191.1210089/151‑1 (MQ=60)
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ATTATATCGATATGTTATTTGTTGACCCTGAATACACCCGCCGTGGGGTTGCCAGCGCTTTGTTAAAACCTTTGATTAAGTCTGAATCCGAACTTACGGTGGACGCAAGCATAACCGCAAAACCCTTTTTTGAACGTTATGGTTTTCAGGCAGTTAAGCAGCAGCGCGTTGAATGCCGGGGAGCGTGGTTTACTAATTTTTATATGCGATATAAACCGCAACATTAAATCCAGCTTGCAATGAAAATAACGCCCGCCTGGTATGTGCGCGTTTTCTGATTCCACAAACTGCAAGGA > NZ_CP025268/252764‑253059
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
