Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R7
|
781 |
589.5 |
21734725 |
98.3% |
21365234 |
134.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,996,161 |
A→G |
*73* (TAA→TAG) |
CXP41_RS15615 → |
protein YgeI |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,996,161 | 0 | A | G | 100.0%
| 372.4
/ NA
| 108 | *73* (TAA→TAG) | CXP41_RS15615 | protein YgeI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (58/50); total (58/50) |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
TAAACACATCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATT > NZ_CP025268/2996026‑2996297
|
tAAACACATCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGa > 1:3063589/1‑140 (MQ=255)
aaCACATCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGAtt < 2:3063589/140‑1 (MQ=255)
acacATCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTg > 2:8635887/1‑140 (MQ=255)
acacATCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTg < 2:7017339/140‑1 (MQ=255)
acacATCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTg < 1:7730308/140‑1 (MQ=255)
cacaTCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGa < 1:1500331/140‑1 (MQ=255)
cacaTCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGa < 1:9690461/140‑1 (MQ=255)
caTCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAcc < 2:10551139/140‑1 (MQ=255)
caTCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAcc < 2:10550379/140‑1 (MQ=255)
caTCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAcc < 1:3914635/140‑1 (MQ=255)
gTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat < 2:9617507/133‑1 (MQ=255)
gTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat < 2:9617484/133‑1 (MQ=255)
gTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat > 1:9617485/1‑133 (MQ=255)
gTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAt > 1:10383237/1‑140 (MQ=255)
gTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAt < 1:7886135/140‑1 (MQ=255)
gTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCAt < 2:10383236/140‑1 (MQ=255)
gCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATaa < 1:10284316/140‑1 (MQ=255)
cTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAAc > 2:8065187/1‑140 (MQ=255)
aCTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaat > 2:3465116/1‑132 (MQ=255)
aCTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaat < 1:3465116/132‑1 (MQ=255)
aCTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACga > 2:4915471/1‑140 (MQ=255)
aCTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACga > 1:2480789/1‑140 (MQ=255)
aCTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACga > 1:9797904/1‑140 (MQ=255)
aCTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATACTATCTCACCGTACTTTACACTTGAGTGGTAGAAGATTGACACAGTAAGTCATACCga > 2:6871092/1‑140 (MQ=255)
cTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGa < 1:3021727/117‑1 (MQ=255)
cTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGa > 2:3021727/1‑117 (MQ=255)
cTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACgag > 2:4311563/1‑140 (MQ=255)
cTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACgag > 1:1514420/1‑140 (MQ=255)
gATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAt < 1:6099696/140‑1 (MQ=255)
gATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAt < 1:6099533/140‑1 (MQ=255)
gATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAt < 2:4678266/140‑1 (MQ=255)
caTACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGAt < 2:10833443/139‑1 (MQ=255)
tACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc < 1:8635888/140‑1 (MQ=255)
aCAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGTGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAcc < 1:9826891/118‑1 (MQ=255)
aCAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaa > 2:9021290/1‑125 (MQ=255)
aCAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaataaa < 1:9021291/125‑1 (MQ=255)
aCAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACt > 1:610273/1‑140 (MQ=255)
gATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat > 2:2900191/1‑119 (MQ=255)
gATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACtttt > 1:1239101/1‑140 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaa > 1:6784223/1‑116 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaa < 2:6784222/116‑1 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCa > 1:460871/1‑124 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCa < 2:460871/124‑1 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTta > 1:1771330/1‑140 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTta > 2:65739/1‑140 (MQ=255)
aTCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTta < 1:8065188/140‑1 (MQ=255)
aaTACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTataat > 1:7690256/1‑140 (MQ=255)
aGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc > 1:4413842/1‑125 (MQ=255)
aGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc < 2:4413842/125‑1 (MQ=255)
aGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtc > 1:5423129/1‑140 (MQ=255)
aGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTAtc < 2:5814924/140‑1 (MQ=255)
ttATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGtt > 1:9112601/1‑140 (MQ=255)
tataGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat < 2:3190327/102‑1 (MQ=255)
tataGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCaaat > 1:3190327/1‑102 (MQ=255)
aGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCtt < 2:4046502/140‑1 (MQ=255)
aGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCtt < 1:6768064/140‑1 (MQ=255)
tttCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGa < 2:7018557/91‑1 (MQ=255)
tttCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGa > 1:7018558/1‑91 (MQ=255)
aaCATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCTTTCATttcattc > 2:10101854/1‑140 (MQ=255)
ttCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGaaa > 2:4253310/1‑140 (MQ=255)
agaagaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACga > 2:8497549/1‑69 (MQ=255)
agaagaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACga < 1:8497550/69‑1 (MQ=255)
agaagaTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCaaaa > 2:3583080/1‑140 (MQ=255)
aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAc < 1:10054381/47‑1 (MQ=255)
aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGAc > 2:10054380/1‑47 (MQ=255)
aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTaa > 2:2208116/1‑140 (MQ=255)
aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTaa > 1:1346782/1‑140 (MQ=255)
aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTaa > 2:5155607/1‑140 (MQ=255)
aTAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTaa > 1:2389758/1‑140 (MQ=255)
tATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGtt > 2:8419106/1‑131 (MQ=255)
tATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGtt < 1:8419107/131‑1 (MQ=255)
aTCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTaa < 2:7722928/140‑1 (MQ=255)
tctcACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc > 1:2998720/1‑60 (MQ=255)
tctcACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc < 2:2998720/60‑1 (MQ=255)
tctcACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATAc > 1:2998505/1‑60 (MQ=255)
tctcACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAAc < 1:1770890/140‑1 (MQ=255)
tctcACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGCTAAATTCTTAAc > 2:9077227/1‑140 (MQ=255)
tcACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATaa < 2:7862633/50‑1 (MQ=255)
tcACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATaa > 1:7862634/1‑50 (MQ=255)
ccTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACg < 1:780209/49‑1 (MQ=255)
ccTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCt > 2:8079806/1‑140 (MQ=255)
ccTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCt > 1:8249704/1‑140 (MQ=255)
cTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCtt < 2:3679380/140‑1 (MQ=255)
ttACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTc < 1:8079807/140‑1 (MQ=255)
tataAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGt < 1:4311563/140‑1 (MQ=255)
ataAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGtt < 2:1239101/140‑1 (MQ=255)
taAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCAc > 2:7114425/1‑136 (MQ=255)
taAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCAc < 1:7114426/136‑1 (MQ=255)
aaTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACgaga < 1:7982884/41‑1 (MQ=255)
aaTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACgaga > 2:7982883/1‑41 (MQ=255)
aaTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGtt > 1:1649117/1‑113 (MQ=255)
aaTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGtt < 2:1649117/113‑1 (MQ=255)
aaTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGt > 2:5726302/1‑140 (MQ=255)
aaTTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGt > 1:3681374/1‑140 (MQ=255)
gAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcat > 1:6531771/1‑68 (MQ=255)
gAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTttcat < 2:6531770/68‑1 (MQ=255)
aGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTAtatt > 1:5910656/1‑140 (MQ=255)
aGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTAtatt > 1:2465085/1‑140 (MQ=255)
aGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTAACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTAtatt > 1:3263329/1‑140 (MQ=255)
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AATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTT > SRR14920197.9501819/1‑151 (MQ=60)
ATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGctgtctcttatacacatctccgagccc > SRR14920197.3329334/1‑124 (MQ=60)
AGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgtatg > SRR14920197.8077028/1‑99 (MQ=60)
CATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacctctctacatctcgta > SRR14920197.3755126/1‑102 (MQ=60)
AGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCC < SRR14920197.7061782/151‑1 (MQ=60)
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TTACTATAAAATTGAGTGGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTAT < SRR14920197.8427028/151‑1 (MQ=60)
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GGTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATActgtctcttatacacatcaccgagcccacgagaccacactacatcgcgtatgccctcgactgaggtacacgagggggggggggggggggggggggggggggggggggg > SRR14920197.2072263/1‑43 (MQ=60)
GTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTC > SRR14920197.2935349/1‑151 (MQ=60)
GTAGACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTC > SRR14920197.9958464/1‑151 (MQ=60)
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GTCGTATCATTAGATAAACACATCAACACCAGTGCTACTGATACAGATCAAATACAAGCATTTATAGTTTCAACATGGATGGCGCCTTTTCAAAATGATATGTATTCAGAAGATAATCCTATCTCACCTTACTATAAAATTGAGTGGTAAACGATTGACCAAATAAATCATAACGAGATACTTTTATAATAGTATCTCGTTCCTTTCATTCAATCCTCACACATGAAAAAATATGCGCTCACCAAAAGTTAAATTCTTAACCATCTTCACGTTTTGTATATTTATTACAAAAATGTC > NZ_CP025268/2996012‑2996308
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
