Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,146,507 |
+T |
pseudogene (1028/1643 nt) |
flgK → |
flagellar hook‑associated protein FlgK |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,146,507 | 1 | . | T | 98.9%
| 2347.1
/ 11.7
| 624 | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/3); new base T (248/366); total (252/372) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.50e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 667 total aligned reads displayed.
ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GG‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGG > NZ_CP025268/1146368‑1146637
|
cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGGTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggt < 2:1732353/140‑2 (MQ=255)
ttGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggtgac > 2:2793650/1‑136 (MQ=255)
tGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggtgacg > 1:10366423/1‑135 (MQ=255)
tGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑ggtgacg > 2:8995614/1‑135 (MQ=255)
ggACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGt > 2:3514062/1‑140 (MQ=255)
gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGtt > 1:5151512/1‑140 (MQ=255)
gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGtt > 1:2733368/1‑140 (MQ=255)
gACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGtt > 2:475495/1‑140 (MQ=255)
cAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGC‑TTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCg > 2:1216688/1‑140 (MQ=255)
aCTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGa > 1:6527509/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCACCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 2:40164/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 1:10457489/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 1:7786684/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 2:5796754/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 2:7885747/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGACGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt > 2:1543043/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATGTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAGGG‑GACGTTGCGAt > 2:6296221/1‑140 (MQ=255)
tGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATc < 1:7300300/140‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCg > 2:6257743/1‑140 (MQ=255)
cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGt < 1:4787515/140‑1 (MQ=255)
cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGt < 1:7513675/140‑1 (MQ=255)
cgcTGGCATTTGCCGACGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAACCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGAGACGTTGCGATCGGt < 2:10001132/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCCACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGc < 1:9076071/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACACAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGc < 2:724602/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGc < 2:5156476/140‑1 (MQ=255)
ggCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCa < 1:2393899/140‑1 (MQ=255)
cATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTg < 2:8151447/126‑1 (MQ=255)
cATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACg < 1:1966182/140‑1 (MQ=255)
cATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACg < 2:1689428/140‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCCTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 1:11468949/140‑1 (MQ=255)
ttGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTa > 2:7435225/1‑140 (MQ=255)
ccGAGGCTTTCAACACCCAACACCAAGCCGGATTTGATGCTACCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTCTCGGTAAGCCCGCGGTTCGGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACt < 2:8275944/140‑1 (MQ=255)
aGGCTTTCAACACCCAACACACTGCCGGAGTGGCTGCTAACGGCGCTGCCGGTGCAGATTGCTGTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTGCTGCATAACACGATAGACAAT‑GGTGCCGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGag > 2:2410415/1‑139 (MQ=255)
gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTATCGTCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTTAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAATACTAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:2958147/140‑1 (MQ=255)
ttCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTc < 2:9701132/140‑1 (MQ=255)
caacacccaacaccACGCCGGATTTGATGCTATCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTTAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 2:5598467/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:1482776/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:2071309/140‑1 (MQ=255)
ccccACCCAACGCCGGATATGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTGGCTAACGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAATAACAAA‑GGTGACGGTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTa < 2:11238930/140‑1 (MQ=255)
cccAACACAACGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTGGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTa < 1:5059392/140‑1 (MQ=255)
ccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTAGCGGTAAGCCCGCGGTTAGGCCAAACGCGTACAGCAAA‑GGTGTCGTGGCGTTCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTag > 2:2020436/1‑139 (MQ=255)
cAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACt > 2:7654758/1‑140 (MQ=255)
aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGAt < 2:4197271/106‑1 (MQ=255)
acacAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTgg > 1:10709856/1‑140 (MQ=255)
acacAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTgg > 1:765643/1‑140 (MQ=255)
acacAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTgg > 2:4940432/1‑140 (MQ=255)
acacAAAGCCGGATGTGATGCCAACGCCGATGCCGGAGCAGATTTCTTTGCTATCGGTACGCCCACGGTGCGGGAAAACAGGAGAAACAAA‑GGTGACGTATCGTACGGTGCGACGGTAACGGATGCCTCCGGGGGAcagc > 2:6573415/1‑137 (MQ=255)
caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAATCACGTAATACAAA‑GGTGACTTTGCGATCGGTGCCACGGTAAATGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 1:4176325/140‑1 (MQ=255)
caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 2:331174/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACa > 1:7990034/1‑140 (MQ=255)
aaGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACa < 1:6357367/140‑1 (MQ=255)
gCCGGATTTGATGCTACCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGa < 1:1248376/140‑1 (MQ=255)
gCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGa > 1:4478095/1‑140 (MQ=255)
cGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAATCACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGAtt > 1:4043394/1‑140 (MQ=255)
cGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGAtt > 2:2261638/1‑140 (MQ=255)
gATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTAc > 1:598433/1‑140 (MQ=255)
gATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAAt > 1:3950946/1‑140 (MQ=255)
tGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAAtct > 1:10024863/1‑140 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCTGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:3746873/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:4549555/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:8215524/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:5490392/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:9808558/140‑1 (MQ=255)
gATGCCGGTGACGATTTCGTTGCCATCGGTCAGCCCGCGGTTCGGCAAACCACGAACAACACC‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACCGCTGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATAACAAAATCTCGTTCGagaa < 2:6088436/140‑1 (MQ=255)
gATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGataa < 1:6943688/140‑1 (MQ=255)
gATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGataa < 2:4466474/140‑1 (MQ=255)
tGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGataata > 1:9474357/1‑140 (MQ=255)
ccGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGAGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATaataat < 2:9565996/140‑1 (MQ=255)
cGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATc > 2:535817/1‑140 (MQ=255)
gTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAg < 2:5958005/140‑1 (MQ=255)
aaGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTgg < 1:9716532/140‑1 (MQ=255)
gATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCa < 2:8447057/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCa < 2:10799896/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCa < 1:5429980/140‑1 (MQ=255)
tGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCAccc < 1:6222067/140‑1 (MQ=255)
tATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGcc < 1:11575003/140‑1 (MQ=255)
tATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGCCAGGTCACCCGcc < 1:10898509/140‑1 (MQ=255)
tCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCtt > 2:1348398/1‑140 (MQ=255)
gTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGACAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGcc < 2:7054863/140‑1 (MQ=255)
gTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGcc < 1:7145216/140‑1 (MQ=255)
gTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGcc < 1:3302435/140‑1 (MQ=255)
gTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGcc < 1:2565663/140‑1 (MQ=255)
gTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACCGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGcc < 2:6809206/140‑1 (MQ=255)
aGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGc < 1:8393134/140‑1 (MQ=255)
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TATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGCCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAAT < SRR14920161.10971314/151‑1 (MQ=60)
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GTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCAC < SRR14920161.2822949/151‑1 (MQ=60)
GTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCAC < SRR14920161.2582872/151‑1 (MQ=60)
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AAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTT < SRR14920161.2604971/151‑1 (MQ=60)
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GCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTT > SRR14920161.6912378/1‑151 (MQ=60)
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CTGCAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGACACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACAGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGC > SRR14920161.4423529/1‑151 (MQ=60)
GCAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCG < SRR14920161.11215363/151‑1 (MQ=60)
CAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGG < SRR14920161.412286/151‑1 (MQ=60)
CAAAACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGAGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGG < SRR14920161.9743701/151‑1 (MQ=60)
ACACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGC > SRR14920161.11273610/1‑151 (MQ=60)
CACGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCC < SRR14920161.11443637/151‑1 (MQ=60)
CGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAA > SRR14920161.11129517/1‑151 (MQ=60)
CGAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAA < SRR14920161.9444370/151‑1 (MQ=60)
AAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGT > SRR14920161.10659163/1‑151 (MQ=60)
AAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGT > SRR14920161.8125318/1‑151 (MQ=60)
AAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGT < SRR14920161.5857030/151‑1 (MQ=60)
AAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAG < SRR14920161.3063283/151‑1 (MQ=60)
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AAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGT < SRR14920161.2288517/151‑1 (MQ=60)
GT‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGTGGC > SRR14920161.10539532/1‑151 (MQ=60)
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AGACGCGTAATACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAGG‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGTGGC > NZ_CP025268/1146357‑1146656
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |