Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,146,507 |
+T |
pseudogene (1028/1643 nt) |
flgK → |
flagellar hook‑associated protein FlgK |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,146,507 | 1 | . | T | 97.5%
| 1009.6
/ 13.2
| 280 | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/4); new base T (135/138); total (138/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑G‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAT > NZ_CP025268/1146368‑1146639
|
cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gt > 1:1581304/1‑139 (MQ=255)
gCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtg < 1:1421132/140‑3 (MQ=255)
gCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtg < 1:1667461/140‑3 (MQ=255)
cTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACACAGCCGGATTCGATGCTAACGGCGATGCCGGCGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAACAACAAA‑g‑gtga > 2:1012090/1‑137 (MQ=255)
ttGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtgac > 2:2288421/1‑136 (MQ=255)
ttGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtgac > 2:3736885/1‑136 (MQ=255)
tGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtgacg < 1:305796/140‑6 (MQ=255)
tGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑g‑gtgacg > 1:4064343/1‑135 (MQ=255)
ggACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGt > 2:722589/1‑140 (MQ=255)
aaCTGGCGCTGGCAGTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCg < 2:5163823/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACCCCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 1:3860922/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACCCAAAGCCGGATTTGATGCTACCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGCTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 2:5049220/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt > 2:4065514/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt > 1:4645924/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt > 2:1674353/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 1:3662554/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt > 1:3633435/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt > 1:2138653/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCGTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt > 1:4309186/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCAGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTTCGAt < 2:4787398/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGACTTGATGGTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 1:3202012/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATGTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACCAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAATATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGGAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt < 2:4288979/140‑1 (MQ=255)
tGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATc < 2:433180/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGc < 2:3304025/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGc > 1:3707834/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGc < 1:3405729/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGc < 2:2071598/140‑1 (MQ=255)
cATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACg < 1:2622352/140‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 2:262503/140‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 1:2751/140‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAAAACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 1:3326707/140‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGAGGATTTCAACCCCCAACACAAAGCCGCATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 2:267231/140‑1 (MQ=255)
aTTTGACGAGGACTTAAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGACAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 2:3850069/140‑1 (MQ=255)
tttGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGt < 1:4220321/140‑1 (MQ=255)
ttGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTa < 1:1272553/140‑1 (MQ=255)
aGGCTTTCAACACCCAACACACAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt > 1:4617444/1‑140 (MQ=255)
aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt > 2:1266434/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGC‑AAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:1461560/140‑1 (MQ=255)
ttCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTc < 1:1987658/140‑1 (MQ=255)
tCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTcc > 1:3392119/1‑140 (MQ=255)
cAACACCCAACACACGGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTCTCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGACCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 2:1308841/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 2:4968791/140‑1 (MQ=255)
cacCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCgg > 1:3161477/1‑140 (MQ=255)
ccccACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTCCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTa < 2:4467081/140‑1 (MQ=255)
cccaacccaaAGCCGGATTTGATGCGAACGGCGATGGCGGTTAAGCTTGCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAACACACGAAACACAAA‑GAT‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTa < 2:818627/140‑1 (MQ=255)
cccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGGAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCACGGTa > 2:4581608/1‑140 (MQ=255)
cccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTa > 1:4731513/1‑140 (MQ=255)
cccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTa > 2:1815714/1‑140 (MQ=255)
cccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTa < 2:3649930/140‑1 (MQ=255)
cccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGGAACTGATGCCTCCGCGGTa > 1:53694/1‑140 (MQ=255)
ccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTAc > 2:679892/1‑140 (MQ=255)
aaGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt > 1:2908980/1‑119 (MQ=255)
aaGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACa < 1:624232/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACa > 2:2735199/1‑140 (MQ=255)
aGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAg > 1:1805197/1‑140 (MQ=255)
aGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGAGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAg > 2:4425894/1‑140 (MQ=255)
gCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGa > 2:2704863/1‑140 (MQ=255)
aTTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTGGCGAGCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACa < 1:3956041/140‑1 (MQ=255)
cTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCg < 1:116978/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:3738194/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:3511001/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:482180/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt > 1:2063866/1‑140 (MQ=255)
aTGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGAGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGataat > 2:3197316/1‑140 (MQ=255)
tGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGataata < 1:788475/140‑1 (MQ=255)
cGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATc > 1:471780/1‑140 (MQ=255)
gTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGAt > 1:4641153/1‑70 (MQ=255)
gTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAg > 2:1379983/1‑140 (MQ=255)
aGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGc < 2:1915036/140‑1 (MQ=255)
tCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGC‑AAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCa < 2:773995/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACg > 1:1640958/1‑70 (MQ=255)
cTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGGCa > 2:1633000/1‑140 (MQ=255)
tATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGcc < 2:3426896/140‑1 (MQ=255)
tATCGGTAAGCACGCGGTTCTGCAGAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGCTCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGAAGATCACCCgac > 2:2576776/1‑138 (MQ=255)
aGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGc > 2:2187842/1‑140 (MQ=255)
aGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGc < 1:4412793/140‑1 (MQ=255)
gCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCa > 2:3962486/1‑140 (MQ=255)
gctgTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:3022005/137‑1 (MQ=255)
gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACACA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 1:2472656/140‑1 (MQ=255)
gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAC‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:288603/140‑1 (MQ=255)
gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:4219963/140‑1 (MQ=255)
gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 1:4858163/140‑1 (MQ=255)
gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 2:3789507/140‑1 (MQ=255)
gcgGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑G‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATAc < 1:4964464/140‑1 (MQ=255)
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AAACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGT < SRR14920191.3179353/151‑1 (MQ=60)
ACAAA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCATTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAA < SRR14920191.3119252/151‑1 (MQ=60)
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AA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGT > SRR14920191.1294580/1‑151 (MQ=60)
AA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGT < SRR14920191.429158/151‑1 (MQ=60)
AA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGT < SRR14920191.1039376/151‑1 (MQ=60)
AA‑GGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGT < SRR14920191.2571550/151‑1 (MQ=60)
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AGACGCGTAATACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAA‑GG‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGT > NZ_CP025268/1146357‑1146653
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |