Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,146,507 |
+T |
pseudogene (1028/1643 nt) |
flgK → |
flagellar hook‑associated protein FlgK |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,146,507 | 1 | . | T | 98.9%
| 959.3
/ 1.2
| 264 | pseudogene (1028/1643 nt) | flgK | flagellar hook‑associated protein FlgK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/2); new base T (121/139); total (123/141) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
ACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑G‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGAT > NZ_CP025268/1146368‑1146639
|
cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gt < 1:3446962/140‑2 (MQ=255)
cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gt < 1:1254545/140‑2 (MQ=255)
cGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gt < 2:5091239/140‑2 (MQ=255)
gCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gtg < 1:1063946/140‑3 (MQ=255)
gCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gtg < 1:3973554/140‑3 (MQ=255)
cTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gtga > 1:3726192/1‑137 (MQ=255)
ttGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAg‑gtgac > 1:2911038/1‑136 (MQ=255)
ggACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCGCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGt > 2:4032655/1‑140 (MQ=255)
ggACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGt > 2:5189269/1‑140 (MQ=255)
aaCTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCg < 1:2446786/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACCCAAAGCCGGATTTGATGCTAACGTCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt > 1:160411/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAAG‑T‑GACGTTGCGAt > 2:4591559/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 2:2310638/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 2:1798638/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt > 2:1731497/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 1:82183/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 1:4313363/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 1:4247185/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 2:811225/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 1:2183098/140‑1 (MQ=255)
cTGGCGCTGGCATCTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCAGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGCTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAt < 2:4633161/140‑1 (MQ=255)
tGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATc < 1:2635148/140‑1 (MQ=255)
tGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATc > 2:4478751/1‑140 (MQ=255)
cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGt < 2:2603061/140‑1 (MQ=255)
cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGt < 1:4165771/140‑1 (MQ=255)
cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGt < 2:2349107/140‑1 (MQ=255)
cgcTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGAGGTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTGCTGGAAGACACGAAAAAC‑CAAG‑GTGACGTTTCGATCGGt > 1:2479546/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGc < 2:3957867/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGc > 2:1965724/1‑140 (MQ=255)
tGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGcc < 1:1727245/140‑1 (MQ=255)
ggCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGGGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCGCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCa > 1:4932764/1‑140 (MQ=255)
gCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCAc > 1:313571/1‑140 (MQ=255)
ccctttGCGCAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTTCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCAc < 2:4388028/137‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 2:1087011/140‑1 (MQ=255)
aTTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACgg < 1:5268892/140‑1 (MQ=255)
tGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTaa > 2:2652014/1‑140 (MQ=255)
gAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGa < 1:3647968/140‑1 (MQ=255)
aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt > 1:1009826/1‑140 (MQ=255)
aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGAt > 1:488781/1‑140 (MQ=255)
aGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCAGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACGGAt > 2:2112648/1‑140 (MQ=255)
gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:2593633/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:2847903/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGc < 2:3620745/140‑1 (MQ=255)
tCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTcc > 2:4359329/1‑140 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAACC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 2:405809/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTATCTGATGCCTCcg < 2:5282648/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:1991166/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 2:2200173/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:3471174/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:4406910/140‑1 (MQ=255)
cAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGATTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcg < 1:3905310/140‑1 (MQ=255)
ccAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTAGCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAACC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGACGCCTCCGCGGTAc > 2:4916897/1‑140 (MQ=255)
aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTGTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTg > 1:2775716/1‑140 (MQ=255)
aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTg > 1:3303647/1‑140 (MQ=255)
aaCACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTg > 2:3425514/1‑140 (MQ=255)
acacAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTgg > 1:2811278/1‑140 (MQ=255)
caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 1:1303457/140‑1 (MQ=255)
caAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGa < 1:110981/140‑1 (MQ=255)
aaaGCCGGATTTGGTGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACCTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGAc > 2:2778853/1‑140 (MQ=255)
aaGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACa > 1:3423127/1‑140 (MQ=255)
gCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCcgcg < 1:2026823/126‑1 (MQ=255)
gCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGa > 1:2426185/1‑140 (MQ=255)
gCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGa > 1:3526708/1‑140 (MQ=255)
gCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGa < 2:344592/140‑1 (MQ=255)
gATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTAc > 1:3838363/1‑140 (MQ=255)
gATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTAc > 1:2553668/1‑140 (MQ=255)
gATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTAc > 2:4230486/1‑140 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:1342031/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:651627/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:4045006/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:577619/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 1:674419/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGATGCCGGTGAAGATTGCCTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTAGCGATCGGTGCAACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGAAAGATTACAAAATATCGtt < 2:4213424/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGAGGCCGGTGAAGATTTCTTTCCTTTTGCTACGCCCGCGGTTCTGCACGCCACGACAAAC‑AAAG‑GTGACGCTGAGATCGCTGCCACGGTACCTGATCCCTCCGCGGTACTGGCGACCGATTAAAACATCCCGtt < 2:4148506/140‑1 (MQ=255)
aaCGGAGAGGCCGGTGAAGAGTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGtt < 2:1596062/140‑1 (MQ=255)
gCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGat > 2:4262132/1‑140 (MQ=255)
gATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGataa < 2:1470937/140‑1 (MQ=255)
aaGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTgg < 1:1559438/140‑1 (MQ=255)
gATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCa < 2:302888/140‑1 (MQ=255)
tGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCAccc > 1:4718784/1‑140 (MQ=255)
cTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGc > 2:3089327/1‑140 (MQ=255)
tCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACCCGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGAGCGGTGCCACTTTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAAGCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGGCAccgtactt > 2:1692543/1‑134 (MQ=255)
tCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGACAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCtt < 1:2237842/140‑1 (MQ=255)
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gTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAAC‑AAAG‑GTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGcc < 2:4718784/140‑1 (MQ=255)
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GAAAAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAAC < SRR14920189.3121657/151‑1 (MQ=60)
AAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGT > SRR14920189.2281092/1‑151 (MQ=60)
AAACAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGT > SRR14920189.514952/1‑151 (MQ=60)
CAAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAA > SRR14920189.2139672/1‑151 (MQ=60)
AAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAG < SRR14920189.779690/151‑1 (MQ=60)
AAAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAG < SRR14920189.3776363/151‑1 (MQ=60)
AAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGT < SRR14920189.2757066/151‑1 (MQ=60)
AAGGTGACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGT < SRR14920189.3860532/151‑1 (MQ=60)
GT‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGTGGC > SRR14920189.2185810/1‑151 (MQ=60)
GT‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGTGGC > SRR14920189.2185575/1‑151 (MQ=60)
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AGACGCGTAATACGCTTGGACAACTGGCGCTGGCATTTGCCGAGGCTTTCAACACCCAACACAAAGCCGGATTTGATGCTAACGGCGATGCCGGTGAAGATTTCTTTGCTATCGGTAAGCCCGCGGTTCTGCAAAACACGAAAAACAAAGG‑GACGTTGCGATCGGTGCCACGGTAACTGATGCCTCCGCGGTACTGGCGACAGATTACAAAATCTCGTTCGATAATAATCAGTGGCAGGTCACCCGCCTTGCCAGCAATACCACTTTTACGGTGACGCCGGATGCCAACGGTAAAGTGGC > NZ_CP025268/1146357‑1146656
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |