Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,620,861 |
T→C |
A93A (GCT→GCC) |
yneK → |
putative protein YneK |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,620,861 | 0 | T | C | 100.0%
| 644.7
/ NA
| 185 | A93A (GCT→GCC) | yneK | putative protein YneK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (106/79); total (106/79) |
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
GTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCTAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGC > NZ_CP025268/1620726‑1620997
|
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tAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGa < 1:10012374/140‑1 (MQ=255)
tAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGa < 2:1456404/140‑1 (MQ=255)
aaaCATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGaa < 1:487683/140‑1 (MQ=255)
aattCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACaa < 1:319368/137‑1 (MQ=255)
aaCTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGa < 1:7921872/132‑1 (MQ=255)
aaCTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACaa < 2:3620908/140‑1 (MQ=255)
cTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAg > 1:9904320/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGa < 1:3983203/140‑1 (MQ=255)
cAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGaa > 1:5425734/1‑140 (MQ=255)
ccACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAat > 2:8412984/1‑140 (MQ=255)
caAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATAtt < 1:9723714/140‑1 (MQ=255)
aaGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAAtt < 1:11030846/140‑1 (MQ=255)
tttAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGa < 1:4869336/131‑1 (MQ=255)
tttAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGa > 2:4869336/1‑131 (MQ=255)
tttAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGgt > 2:1607297/1‑140 (MQ=255)
tttAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGgt > 2:1607232/1‑140 (MQ=255)
ttAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGgta < 1:6988617/140‑1 (MQ=255)
atccTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACCTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAATGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 1:11385136/138‑1 (MQ=255)
aaCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 2:924917/140‑1 (MQ=255)
aaCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 2:128813/140‑1 (MQ=255)
tGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACaa > 1:5760623/1‑108 (MQ=255)
tGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat > 2:11256948/1‑135 (MQ=255)
tGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 1:11256948/135‑1 (MQ=255)
tGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAAtt > 1:899618/1‑140 (MQ=255)
aCAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTa > 1:8925062/1‑140 (MQ=255)
aaCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAg < 2:390479/140‑1 (MQ=255)
tATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCt > 2:4245591/1‑140 (MQ=255)
atatTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGTTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGTATGGAAGACACATAGATAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCtatttat < 1:2896582/140‑1 (MQ=255)
atatTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCtatttat > 1:4542153/1‑140 (MQ=255)
atTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTatttattt > 2:3107093/1‑140 (MQ=255)
agagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 2:7961043/108‑1 (MQ=255)
agagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg > 1:7961043/1‑108 (MQ=255)
agagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaa > 2:7861730/1‑114 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAATCTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGCGACAAAGAAAATATTGAATTAGAGGTATTAATAAATGTAAGCAATattgattttgtgaa > 2:7013269/1‑134 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 1:1045074/106‑1 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg > 2:1045074/1‑106 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGgt < 1:2156509/107‑1 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGgt > 2:2156509/1‑107 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATaa > 1:1689239/1‑140 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATaa > 2:2206971/1‑140 (MQ=255)
gACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAAtt > 1:8527368/1‑140 (MQ=255)
aCTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGTAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGTTAGTAATAAAATTAAGCACTATTTATTTAGATAAatt > 1:3252275/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGgta > 2:6804093/1‑103 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGgta < 1:6804093/103‑1 (MQ=255)
ttCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACATAGAAAATATTGAATTTCAGGGAGTAATAAATTTAAGACGTATTTATTTAGATAATTTTAGACat > 2:7550544/1‑140 (MQ=255)
ggggTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCatgat > 2:9675808/1‑140 (MQ=255)
aaCGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCGATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGgaga > 1:6201878/1‑140 (MQ=255)
cGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGa > 1:4645805/1‑64 (MQ=255)
cTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCAGTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAatat > 1:6509296/1‑140 (MQ=255)
cTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAatat > 2:10014154/1‑140 (MQ=255)
cTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAatat > 2:10707194/1‑140 (MQ=255)
taCAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATAtttt > 2:568219/1‑140 (MQ=255)
aCAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGACATTAATAttttt > 2:5709286/1‑140 (MQ=255)
aaTGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTg > 1:689991/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGACTGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCGCGTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTCATATGTTTTgcg > 2:2862149/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGa < 1:5964074/54‑1 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGa > 2:5964074/1‑54 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTaa < 1:10394496/86‑1 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 1:1410923/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 1:10510279/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 2:1921425/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 1:7440595/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 2:5812326/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTAGTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAACTTAATATTTTTTgcg > 1:9607979/1‑140 (MQ=255)
gAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcgc > 2:8768692/1‑140 (MQ=255)
gAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcgc > 1:2873089/1‑140 (MQ=255)
aaaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCt > 2:11556854/1‑140 (MQ=255)
aaaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCt > 1:9430622/1‑140 (MQ=255)
aaaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCt > 2:4580257/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg > 2:6200580/1‑68 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 2:10276261/75‑1 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 1:10190629/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 1:7580346/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 1:10917716/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 2:7094373/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 2:2976691/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 1:3079100/1‑140 (MQ=255)
aaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcc < 1:11617801/140‑1 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAAttt < 1:5901022/62‑1 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAAttt > 2:5901022/1‑62 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc > 2:106206/1‑140 (MQ=255)
cAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 2:9928468/68‑1 (MQ=255)
cAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaaccc < 1:10014154/140‑1 (MQ=255)
aGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaaccca < 2:2444732/140‑1 (MQ=255)
gTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaacccaa > 2:4888635/1‑140 (MQ=255)
tttAAACTCTCTTATCCCGCCAGGTATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTTTTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCaaa < 2:4968055/140‑1 (MQ=255)
ttAAACACACTTATCCCGCCAGGAATTGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAg < 2:11159798/140‑1 (MQ=255)
tAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGc < 1:1607232/140‑1 (MQ=255)
aaCACACTTAACCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCGTATTTATTTAGATAATTTTCTCAATGATGGAGTAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCt > 2:7329911/1‑140 (MQ=255)
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aCTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTg < 2:3079100/140‑1 (MQ=255)
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ACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTAGTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAACTTAATATTTTTTGCG > SRR14920161.9672483/1‑151 (MQ=60)
CGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGC > SRR14920161.9811255/1‑151 (MQ=60)
CGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGC > SRR14920161.2892287/1‑151 (MQ=60)
GCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCT > SRR14920161.9493945/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgcc > SRR14920161.10345031/1‑99 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920161.7631562/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920161.5097199/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920161.2895039/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920161.3099750/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920161.10258855/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920161.10990629/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920161.3915842/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920161.4665334/1‑151 (MQ=60)
ATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCC > SRR14920161.4084961/1‑151 (MQ=60)
ATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTgtctcttatacacatctcccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttc > SRR14920161.9995015/1‑92 (MQ=60)
ATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCC < SRR14920161.5948901/151‑1 (MQ=60)
ATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGCAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCC < SRR14920161.8646451/151‑1 (MQ=60)
AAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGC < SRR14920161.11695553/151‑1 (MQ=60)
GGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTGGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCT > SRR14920161.9386984/1‑151 (MQ=60)
GGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTCTTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCT > SRR14920161.5939862/1‑151 (MQ=60)
GGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCT > SRR14920161.6931529/1‑151 (MQ=60)
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CAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCA < SRR14920161.10081255/151‑1 (MQ=60)
GTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACT > SRR14920161.2433163/1‑151 (MQ=60)
GTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACT > SRR14920161.2017125/1‑151 (MQ=60)
TAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATG < SRR14920161.1617960/151‑1 (MQ=60)
TAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATG < SRR14920161.1617895/151‑1 (MQ=60)
ACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGATAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGG < SRR14920161.7505442/151‑1 (MQ=60)
ACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGG < SRR14920161.107010/151‑1 (MQ=60)
CACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGC > SRR14920161.5224080/1‑151 (MQ=60)
CACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGC > SRR14920161.9472730/1‑151 (MQ=60)
CACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGC > SRR14920161.5224280/1‑151 (MQ=60)
CCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCTCCATGATGGAGATATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTTTGGGTCGCGTATTTC < SRR14920161.10500464/151‑1 (MQ=60)
CGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAG < SRR14920161.6447607/151‑1 (MQ=60)
GCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAGA > SRR14920161.4979308/1‑151 (MQ=60)
CAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAGACC < SRR14920161.3800504/151‑1 (MQ=60)
|
TGGCGCACGTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCTAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAGACC > NZ_CP025268/1620718‑1621011
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
