Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,266,812 |
T→C |
*313* (TAA→TAG) |
tdcA ← |
transcriptional regulator TdcA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,266,812 | 0 | T | C | 98.6%
| 498.9
/ NA
| 147 | *313* (TAA→TAG) | tdcA | transcriptional regulator TdcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (68/77); minor base A (1/1); total (69/78) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > NZ_CP025268/3266676‑3266947
|
tcatcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTaa > 2:3790952/1‑140 (MQ=255)
catcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAAtaactaac < 2:5055432/140‑1 (MQ=255)
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc < 1:7084765/140‑1 (MQ=255)
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc < 2:3102510/140‑1 (MQ=255)
aaTAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAAc < 2:5045790/140‑1 (MQ=255)
aTAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACt < 2:8129257/140‑1 (MQ=255)
aGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATAATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTc < 1:9690721/140‑1 (MQ=255)
cAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTa > 2:7670082/1‑140 (MQ=255)
cAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATAAAATAAGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTa > 1:1449699/1‑140 (MQ=255)
aCCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTAtt > 1:9057507/1‑140 (MQ=255)
aCCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACAGTAACCGACACCTGAAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAAATAACCAACTTCTAta > 2:10326310/1‑139 (MQ=255)
cGGCAGATCGTATGTAAGATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTATATAAGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAATCAAATAACTAACCAACTTCTATTaa < 2:5571111/140‑1 (MQ=255)
gCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAAtt > 2:2436981/1‑140 (MQ=255)
cAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTg > 1:1306335/1‑140 (MQ=255)
cAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTg < 1:2296798/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTACCCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:4220292/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:8241889/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:9965957/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:7241600/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:1537912/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:2217587/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:5465126/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:10848148/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAAGTGcc < 1:3667521/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:3475043/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:6266666/140‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:4992802/140‑1 (MQ=255)
tCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt < 1:2821340/140‑1 (MQ=255)
tCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt < 1:3093876/140‑1 (MQ=255)
tCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCtt < 1:5179898/140‑1 (MQ=255)
gTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCg > 2:4947010/1‑140 (MQ=255)
tGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCt > 1:8734134/1‑140 (MQ=255)
tGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCt < 1:7797462/140‑1 (MQ=255)
gTAATATGCATTACAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 1:1594764/140‑1 (MQ=255)
aaTATGCATTATAACACCACTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTaca < 2:11345838/140‑1 (MQ=255)
aaTATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTaca < 2:11345814/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTTGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 1:242163/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 1:4963065/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 1:5839800/140‑1 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc > 1:5450960/1‑140 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc < 2:9057507/140‑1 (MQ=255)
atGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:3257972/127‑1 (MQ=255)
atGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:3258006/127‑1 (MQ=255)
atGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc > 1:3257972/1‑127 (MQ=255)
atGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc > 1:3258006/1‑127 (MQ=255)
atGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAccc > 2:2509787/1‑140 (MQ=255)
ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 1:4139717/140‑1 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATACCAAACCCACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 2:3990766/1‑140 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATgata > 2:5087313/1‑140 (MQ=255)
agaaaaCCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCGGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATaa < 2:8996773/138‑1 (MQ=255)
taAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAg < 1:11486062/140‑1 (MQ=255)
taAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAg > 2:10435674/1‑140 (MQ=255)
aaCCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATGTATGTTTAAATAAAAGCAAATAACGAACCAACTTCTAGTAAGTGCCTTCGGCTACACCCAGTCTAAGATg > 2:6074062/1‑140 (MQ=255)
ccTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGaa > 1:6330558/1‑140 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTATATATGTAGGTAACCGTCCCCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAATCACACATAACTAACCCACGTCTATTCCTTGCGTTGGTCTGCGCGCTGTATAAGGTGatgtc > 2:9842763/1‑136 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTATCCAACTTCTATTAATTGCCGTCGTCTACTCCCATTATTAGATGAATAc > 2:10586931/1‑140 (MQ=255)
cGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActct < 2:6808486/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActct < 1:6253542/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActct < 2:9061611/140‑1 (MQ=255)
gAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGc > 1:8557456/1‑140 (MQ=255)
aaTTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCt > 1:7980667/1‑140 (MQ=255)
tatGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTcca > 1:714498/1‑140 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTCTTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 1:2410066/1‑140 (MQ=255)
accgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGa > 2:6566520/1‑140 (MQ=255)
ccgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAt > 2:7235980/1‑140 (MQ=255)
taaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgct > 1:10178486/1‑140 (MQ=255)
accgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgctgc > 2:7059418/1‑140 (MQ=255)
cacCTGCAAGACAGACCGGCGGCATAATAAGGATAAACCAAACACAAATAAATAACCAACATCTCTTACCTCCCTTCTTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCttttt < 2:2022920/140‑1 (MQ=255)
acCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 2:11258979/81‑1 (MQ=255)
acCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa > 1:11258979/1‑81 (MQ=255)
acCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCtttttt > 2:1320195/1‑140 (MQ=255)
gCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATa > 1:9423882/1‑140 (MQ=255)
aaGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACg > 2:3558575/1‑140 (MQ=255)
aaGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACg > 2:5090298/1‑140 (MQ=255)
gacagGTGGATTANTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACNGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAtt > 1:6121780/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 2:8045398/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 2:8045417/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 2:10194397/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 1:4269278/1‑140 (MQ=255)
gTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCg > 1:10870339/1‑140 (MQ=255)
tatttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCNTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACAGATGCGGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATa > 1:10773867/1‑140 (MQ=255)
tttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGTATACTCTTTTGATAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATAAGATAATTTTTCGACAATAcg > 2:10270999/1‑139 (MQ=255)
tttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATAcc > 1:10220417/1‑140 (MQ=255)
ttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACcg < 2:8734134/140‑1 (MQ=255)
atGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACcgcg < 1:11347998/140‑1 (MQ=255)
atGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACcgcg < 1:9000523/140‑1 (MQ=255)
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ACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAAC > SRR14920161.555107/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920161.7496641/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920161.3242582/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920161.2762966/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920161.382430/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920161.9122956/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920161.7315830/1‑151 (MQ=60)
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CGCTTCAATAATGTCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATTAAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > NZ_CP025268/3266663‑3266962
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |