Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
3,266,812 |
T→C |
*313* (TAA→TAG) |
tdcA ← |
transcriptional regulator TdcA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 3,266,812 | 0 | T | C | 99.6%
| 793.8
/ NA
| 231 | *313* (TAA→TAG) | tdcA | transcriptional regulator TdcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (127/103); minor base G (1/0); total (128/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
TCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGT > NZ_CP025268/3266676‑3266947
|
tcatcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTaa < 1:607576/140‑1 (MQ=255)
tcatcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTaa > 1:5448796/1‑140 (MQ=255)
catcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAAtaactaac < 2:10292856/140‑1 (MQ=255)
ctcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc < 1:10652452/139‑1 (MQ=255)
atcaATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAAcc < 2:2012592/140‑1 (MQ=255)
aTAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACt < 1:1030954/140‑1 (MQ=255)
aGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTc < 1:150330/140‑1 (MQ=255)
aGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTc < 2:724513/140‑1 (MQ=255)
ccGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTa > 1:8837736/1‑140 (MQ=255)
cGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTaa < 1:8122428/140‑1 (MQ=255)
cAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTg > 2:4385123/1‑140 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:4333890/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:5497105/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:6693802/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:4162811/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:1874024/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:1192411/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:10612220/140‑1 (MQ=255)
gATCGTATGTAATATGCAATATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 2:11299737/140‑1 (MQ=255)
caTCGTAAGTAATATGCATTATAACACCTCTACGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGcc < 1:8871035/139‑1 (MQ=255)
aTCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt > 2:6258920/1‑140 (MQ=255)
gTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCg > 2:7832768/1‑140 (MQ=255)
tATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGt > 1:5043353/1‑140 (MQ=255)
gTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 1:9744449/140‑1 (MQ=255)
gTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 2:8574670/140‑1 (MQ=255)
gTAATATGCAAGATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 2:6857923/140‑1 (MQ=255)
atatTCTTTATTAATCATCTTCGCATGTCTT‑AAATTTGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAATACAGACAGGTTGATTATTTATGTTTAATTAAAATCTATTTACTTTCCATCTTCTATTATTTGCCTTCGTATacac < 2:7614749/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt > 2:5565139/1‑130 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCt < 1:5565139/130‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 1:5810816/140‑1 (MQ=255)
atatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTacac < 2:4655110/140‑1 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc < 1:8198536/140‑1 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACAcc < 1:2620067/140‑1 (MQ=255)
tatGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTAGTCTACAcc > 2:10676748/1‑140 (MQ=255)
gCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAt > 1:3808614/1‑140 (MQ=255)
cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAtt > 2:144770/1‑140 (MQ=255)
cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAtt > 2:10245228/1‑140 (MQ=255)
cATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCAtt < 2:5590790/140‑1 (MQ=255)
ttATAAACCCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 2:7205154/140‑1 (MQ=255)
ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTACCCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 1:9948731/140‑1 (MQ=255)
ttATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat < 2:10533776/140‑1 (MQ=255)
tataAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtat > 2:10837566/1‑139 (MQ=255)
tataAAACCTATTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTTCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGGTTAAATACAAACAAATAACGAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATtata > 2:6507857/1‑140 (MQ=255)
ataAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATaa < 1:5372068/140‑1 (MQ=255)
ataAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATaa < 1:4319099/140‑1 (MQ=255)
taAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACAAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCAATTATAAg > 2:3850250/1‑140 (MQ=255)
ccTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTCAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCCTTATAAGATGaa > 2:2358221/1‑140 (MQ=255)
ctctTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAAt < 1:2938914/140‑1 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATTAAAATATGTAGGTAACCGAAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATAATAAGATGAATa > 1:2301941/1‑140 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTa < 1:5395167/119‑1 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 1:3972030/1‑140 (MQ=255)
ctTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAAATTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATAc > 2:2653151/1‑140 (MQ=255)
tCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATGAATTGCATTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActc > 2:7819485/1‑140 (MQ=255)
cGCCTGACTT‑CCAGAGGTCGGTCACCGTAACCGACACCTGCAAGACCGACAGGTGGATTATGTATGTGTAAAGAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATActct < 2:10875811/140‑1 (MQ=255)
gAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGc > 2:5516352/1‑140 (MQ=255)
aaaaTATGAACGTAACCGTACCCGACCCCAGCAAGACAGACAGGCGGATTCTTTATGTTTAAATAAACACAAATAACTAAACAACTTCTATTCATTGCCTTCTTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAAt < 2:3439796/139‑1 (MQ=255)
aaaTATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAAtt < 1:4862228/140‑1 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 1:244958/1‑140 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 2:4426782/1‑140 (MQ=255)
gTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTccacca > 1:6535955/1‑140 (MQ=255)
cgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGagg > 2:6226487/1‑138 (MQ=255)
cgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtg > 2:5696463/1‑140 (MQ=255)
cgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtg > 2:5673497/1‑140 (MQ=255)
cgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtg < 1:1709478/140‑1 (MQ=255)
cgtaaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtg > 1:10045463/1‑140 (MQ=255)
taaccgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgct > 1:7322230/1‑140 (MQ=255)
accgACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGAtgctgc < 1:3054395/140‑1 (MQ=255)
cacCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCttttt > 2:973126/1‑140 (MQ=255)
cacCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCttttt > 1:5672164/1‑140 (MQ=255)
acCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCtttttt > 1:3392070/1‑140 (MQ=255)
acCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTACACCAAAACCGATGCTGCtttttt > 2:10859440/1‑140 (MQ=255)
cAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATAc > 2:4727402/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 2:3011307/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt < 1:1743510/140‑1 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt > 1:7635996/1‑140 (MQ=255)
acagGTGGATTATTTATGTGTAAATAAAAACAAATAACTAACCATCTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAAttt < 2:10447926/140‑1 (MQ=255)
tGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGa > 1:9197131/1‑140 (MQ=255)
tGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGa < 1:8468761/140‑1 (MQ=255)
attattTATGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCa < 1:6519636/140‑1 (MQ=255)
tatttatGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATa < 1:5219531/140‑1 (MQ=255)
atGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACcgcg < 2:2503915/140‑1 (MQ=255)
tGTTTAAATAAAAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCgg < 1:333672/140‑1 (MQ=255)
taaataaaNACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATNAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCata > 1:5993068/1‑140 (MQ=255)
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taaataaaAACAAATAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTGTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCata > 1:10003909/1‑140 (MQ=255)
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TAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCA > SRR14920199.5286803/1‑151 (MQ=60)
TAACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCA > SRR14920199.3904033/1‑151 (MQ=60)
ACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAAC < SRR14920199.11195910/151‑1 (MQ=60)
ACTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAAC > SRR14920199.2677135/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920199.8007001/1‑151 (MQ=60)
CTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGACATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > SRR14920199.4690359/1‑151 (MQ=60)
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TCGCTTCAATAATGTCATCAATAGCAACCGGCAGATCGTATGTAATATGCATTATAAAACCTCTTCGCCTGAATT‑AAATATGTAGGTAACCGTAACCGACACCTGCAAGACAGACAGGTGGATTATTTATGTTTAAATAAAAACAAATAATTAACCAACTTCTATTAATTGCCTTCGTCTACACCCATTATAAGATGAATACTCTTTGGCTAATTCCACCAAAACCGATGCTGCTTTTTTAATACGATAATTTTTCGACCATACCGCGGCATATTGTGCCACAGGTAATGTTTCTTCAACC > NZ_CP025268/3266662‑3266962
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |