Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R5
|
785 |
665.2 |
22963641 |
98.6% |
22642150 |
138.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,588,591 |
A→G |
L63S (TTG→TCG) |
safA ← |
two‑component system connector SafA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,588,591 | 0 | A | G | 99.6%
| 799.7
/ NA
| 230 | L63S (TTG→TCG) | safA | two‑component system connector SafA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (159/70); minor base C (0/1); total (159/71) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.09e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
ATGTTAGCGTTGAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCAAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTC > NZ_CP025268/1588454‑1588727
|
aGCGTTGAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAATACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTAtt > 2:7077180/1‑140 (MQ=255)
aGCGTTGAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACt > 2:7762886/1‑137 (MQ=255)
aaGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATg > 1:10031830/1‑140 (MQ=255)
ggCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACCATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGaa < 2:117095/140‑1 (MQ=255)
ggCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGaa < 1:2681631/140‑1 (MQ=255)
ggCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATAATTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGaa < 2:10281708/140‑1 (MQ=255)
gCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGATTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGaaa < 2:10459332/140‑1 (MQ=255)
cATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAAt > 1:126032/1‑140 (MQ=255)
cATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAAt < 2:259230/140‑1 (MQ=255)
cATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCAGATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTCTTGATAATGAAAt < 2:5640798/140‑1 (MQ=255)
tgaATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTa < 2:2264860/140‑1 (MQ=255)
tgaATAAATACAACAGAACAAACGAGCGACAATTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTa < 1:9810347/140‑1 (MQ=255)
aataaataTAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAg < 1:9035582/140‑1 (MQ=255)
taaataTAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGAt > 1:1838894/1‑140 (MQ=255)
aCAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCg < 1:6385992/140‑1 (MQ=255)
cAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGa > 2:7412488/1‑140 (MQ=255)
cAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGa > 1:10561299/1‑140 (MQ=255)
cAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAAATATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGa > 2:11262306/1‑140 (MQ=255)
gAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCAt < 1:5776758/140‑1 (MQ=255)
gAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCAt < 2:2999983/140‑1 (MQ=255)
gAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCAt < 2:10031829/140‑1 (MQ=255)
gAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCAt < 2:6051136/140‑1 (MQ=255)
aGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCAtt > 2:6837233/1‑140 (MQ=255)
cGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTc > 1:5852249/1‑140 (MQ=255)
ttATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATa < 2:2545831/140‑1 (MQ=255)
ttAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTg > 2:3500222/1‑140 (MQ=255)
tAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGa > 1:4699367/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAACTGTGTCAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGc > 1:8390911/1‑140 (MQ=255)
ttATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGaaaaaa > 1:8680925/1‑140 (MQ=255)
tACTTTTTTAACCTTTCCTATGTCTAATTGGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTAt < 2:6786199/140‑1 (MQ=255)
tACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTAt < 1:11288620/140‑1 (MQ=255)
tttttAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAACTGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAAc < 1:8139623/140‑1 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc < 2:2244437/140‑1 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 2:2382191/1‑140 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc < 2:1838894/140‑1 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 2:317602/1‑140 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 2:6155088/1‑140 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc < 2:10136899/140‑1 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 2:6256409/1‑140 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGAGCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 1:7131938/1‑140 (MQ=255)
tCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAg > 1:10649207/1‑140 (MQ=255)
ttATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGtaataa > 1:6169176/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 1:3095520/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 2:4447007/1‑140 (MQ=255)
taATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCAAGCGAACTAATGAAAATGAAATGTGTAAGATCTCATGCAATGCGACCCAAATCTGAAAAACTCAGCTGATCAATTCCCGAAAAAAAGGCTATCAACGAAACTGTCAGTAATAAGAc > 2:4479618/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAAcc > 2:9241139/1‑140 (MQ=255)
ttGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAAcc > 2:1962917/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:9287746/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:7974373/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:765390/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:7368492/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:6761743/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:4093986/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:3252823/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 2:9691887/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGAAAGTGTCAGAAATAAGACAACca > 2:7294132/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCGTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAAGGGCTAGCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 2:980490/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 2:4564848/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 1:3774545/1‑140 (MQ=255)
tttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAtt > 2:5619032/1‑140 (MQ=255)
tttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAtt > 1:9203549/1‑140 (MQ=255)
ttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTg > 2:3728411/1‑140 (MQ=255)
ttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTg > 1:5978229/1‑140 (MQ=255)
tgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACACTTGc > 1:7164986/1‑140 (MQ=255)
tgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGc > 2:4081976/1‑140 (MQ=255)
ttCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGAc > 1:1974373/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACa > 1:1550730/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATa < 2:6578481/64‑1 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa < 1:3500223/140‑1 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:9750276/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:4490224/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:5062618/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa < 1:6256410/140‑1 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:948645/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:5015037/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:4776122/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:8458001/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:7850884/1‑140 (MQ=255)
ccTTTCCAACTAATGATCCTGAAATGTGTAAGATCTCTAGCACAGCGACCCAAATCTGAAAGACTCCCCAGATCAATAGCCTAAAAAAACGCTCTCAACGTAAGAGACAGTAAAACGACAACCACACTGTCAGACaatat < 2:4684758/140‑5 (MQ=255)
ccTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAAGTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAt < 2:8229655/140‑1 (MQ=255)
cTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAtt < 2:8968180/140‑1 (MQ=255)
ttGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAttt < 2:5978228/140‑1 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATgg > 2:7990717/1‑88 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAATACAACCACAATTGCAGACATGATTTc > 2:5105550/1‑140 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATTATTTc > 1:9567666/1‑140 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTc > 1:7223565/1‑140 (MQ=255)
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tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTc > 2:4166564/1‑140 (MQ=255)
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CTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTT > SRR14920198.4828644/1‑151 (MQ=60)
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CTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAGTTCTTTATAGTT > SRR14920198.9249070/1‑151 (MQ=60)
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GCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTTGTC > SRR14920198.6624501/1‑151 (MQ=60)
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GAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTTGTCTC < SRR14920198.8778179/151‑1 (MQ=60)
GAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTTGTCTC > SRR14920198.10140975/1‑151 (MQ=60)
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AAAATGTTAGCGTTGAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCAAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTTGTCTC > NZ_CP025268/1588451‑1588741
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |