Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,588,591 |
A→G |
L63S (TTG→TCG) |
safA ← |
two‑component system connector SafA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,588,591 | 0 | A | G | 100.0%
| 1086.7
/ NA
| 311 | L63S (TTG→TCG) | safA | two‑component system connector SafA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (222/89); total (222/89) |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
ATGTTAGCGTTGAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCAAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTC > NZ_CP025268/1588454‑1588727
|
aaGGCATTATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATg < 2:8546657/140‑1 (MQ=255)
aGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGa < 2:8251267/140‑1 (MQ=255)
ggCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGaa < 1:9145885/140‑1 (MQ=255)
atgatgAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTg > 1:3600596/1‑129 (MQ=255)
gatgaATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAAtgtg > 2:9599305/1‑140 (MQ=255)
tgaATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTa < 2:11323475/140‑1 (MQ=255)
aataaataTAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAg > 2:12649/1‑140 (MQ=255)
aataaataTAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAg < 2:11513136/140‑1 (MQ=255)
aataaataTAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCATTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAg > 2:7662902/1‑140 (MQ=255)
ataaataTAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGa < 2:8355715/140‑1 (MQ=255)
taaataTAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGAt < 2:4142688/140‑1 (MQ=255)
ataACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATGATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCtt > 1:10342349/1‑140 (MQ=255)
aCAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCa > 1:8211905/1‑140 (MQ=255)
aaCAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGc > 1:6085214/1‑140 (MQ=255)
cAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGa > 1:7519800/1‑140 (MQ=255)
aaCGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGAcc < 1:9790722/140‑1 (MQ=255)
aaCGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGAcc < 2:4742004/140‑1 (MQ=255)
aCGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGAccc > 1:6173664/1‑140 (MQ=255)
aCGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGAccc < 1:9529901/140‑1 (MQ=255)
gAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCAt < 2:7209/140‑1 (MQ=255)
ttATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATa < 1:6725019/140‑1 (MQ=255)
ccTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGGGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGc > 1:9987182/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTg < 2:10237083/118‑1 (MQ=255)
tAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGc > 1:4639489/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGc > 1:11416013/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGc > 1:11523728/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGc > 1:3324725/1‑140 (MQ=255)
tATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAAt < 2:2855920/140‑1 (MQ=255)
tACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATACTGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTAt < 2:3498170/140‑1 (MQ=255)
tACTTTTTTAACAGTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTAt < 2:6712131/140‑1 (MQ=255)
tAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTaa < 1:920333/140‑1 (MQ=255)
aTTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAgtgt < 1:772200/140‑1 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACt < 2:60910/97‑1 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 2:1089672/1‑140 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 2:11106017/1‑140 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 1:7911080/1‑140 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 1:3828649/1‑140 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGNGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 1:6295631/1‑140 (MQ=255)
cttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 2:5531456/2‑140 (MQ=255)
ttATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGtaataa > 1:5920661/1‑140 (MQ=255)
ttATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGtaataa > 2:628844/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg < 1:11140578/140‑1 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 2:1391161/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 2:10798431/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 2:7105891/1‑140 (MQ=255)
ataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGa > 1:7109366/1‑140 (MQ=255)
taATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGAc < 2:3900127/140‑1 (MQ=255)
tttGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAAc > 1:7269862/1‑140 (MQ=255)
tttGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAAc < 2:11433362/140‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGt > 2:2912974/1‑128 (MQ=255)
ttGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAAcc > 2:4614494/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAAt < 2:7599000/41‑1 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:2924881/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:11217691/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:5739357/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 2:4448544/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 2:10372220/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 1:2960133/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 1:9033954/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 1:1246114/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 2:7915426/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 2:4486387/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 1:8411446/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 2:9385217/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 2:6539700/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 1:10043818/1‑140 (MQ=255)
gtttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAt > 1:1342576/1‑140 (MQ=255)
tttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAtt > 2:8662362/1‑140 (MQ=255)
ttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTg > 1:4006886/1‑140 (MQ=255)
gtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAg > 2:11547799/1‑40 (MQ=255)
cAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACAt < 1:4818896/140‑1 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:5203729/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:3684533/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:31390/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:2224661/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:1975215/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:11233721/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:4107549/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:10518473/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa < 2:5713648/140‑1 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:206758/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAAGTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCCCAATAGCAGACATGa > 2:1683325/1‑140 (MQ=255)
ccTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAt < 1:3203279/140‑1 (MQ=255)
ccTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAt < 1:6666223/140‑1 (MQ=255)
ccTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAt < 1:5517982/140‑1 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTACTAAGACAACCCCAATTGCAGACATTAtttg > 2:6432022/1‑139 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa < 1:4277773/136‑1 (MQ=255)
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GCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAG > SRR14920200.2804359/1‑151 (MQ=60)
GCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAG > SRR14920200.7733379/1‑151 (MQ=60)
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ATCTTTATCTAAAATGTTAGCGTTGAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCAAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTTGTCTC > NZ_CP025268/1588441‑1588741
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |