Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,588,591 |
A→G |
L63S (TTG→TCG) |
safA ← |
two‑component system connector SafA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,588,591 | 0 | A | G | 100.0%
| 678.9
/ NA
| 195 | L63S (TTG→TCG) | safA | two‑component system connector SafA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (154/41); total (154/41) |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
ATGTTAGCGTTGAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCAAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTC > NZ_CP025268/1588454‑1588727
|
gAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCgaa > 1:4295836/1‑129 (MQ=255)
gAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCgaa < 2:4295836/129‑1 (MQ=255)
gAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAAt > 2:6284145/1‑140 (MQ=255)
aaGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATg > 2:3239954/1‑140 (MQ=255)
aGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGATTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGa < 1:1093997/140‑1 (MQ=255)
ggCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGaa < 1:1124384/140‑1 (MQ=255)
tgaATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTa < 1:10680868/140‑1 (MQ=255)
aataaataTAACAGAACAAAAGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAg < 2:870377/140‑1 (MQ=255)
gAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATg > 1:5233731/1‑140 (MQ=255)
aaCGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGAcc < 1:9909257/140‑1 (MQ=255)
gCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCAttt < 2:2445641/140‑1 (MQ=255)
gCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCAttt < 2:1355666/140‑1 (MQ=255)
cGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTc > 2:10382530/1‑140 (MQ=255)
aTCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACt > 2:3750985/1‑140 (MQ=255)
ccTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGc > 2:6337170/1‑140 (MQ=255)
tAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGc > 1:1750821/1‑140 (MQ=255)
tttttATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGaaa < 2:2909835/140‑1 (MQ=255)
tttttATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGaaa > 2:2360572/1‑140 (MQ=255)
ttATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGaaaaaa > 1:10285732/1‑140 (MQ=255)
tACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTAt > 1:305965/1‑140 (MQ=255)
aTTTCATATTTATAATTTTCTGTTTGTTTTCATCCTTTAGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATATATTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATAATCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAgttt < 2:3109035/140‑3 (MQ=255)
aTTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAgtgt < 1:64318/140‑1 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATa > 1:3348759/1‑95 (MQ=255)
tttCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTc > 1:8838173/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 2:9001816/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 1:1513131/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 1:10755314/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 1:7121198/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 2:3837480/1‑140 (MQ=255)
tataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAg > 1:53240/1‑140 (MQ=255)
ataATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAGGTGTCAGTAATAAGa > 1:11381425/1‑140 (MQ=255)
taATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGAc > 2:11322631/1‑140 (MQ=255)
taATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGAc > 2:4039032/1‑140 (MQ=255)
aaTTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACa > 2:10607240/1‑140 (MQ=255)
tttGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAAc < 2:1103752/140‑1 (MQ=255)
tttGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAAc > 1:1103752/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCATCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCATTAATAATACAACca > 1:7601348/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca < 2:935929/140‑1 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 2:11318114/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca < 2:1242088/140‑1 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 2:1656818/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:4597865/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:5145850/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 2:268815/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 1:2464082/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACca > 2:7473551/1‑140 (MQ=255)
tGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGGAAGTGTCAGTAATAAGACAAcaa > 2:8012085/1‑138 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGAc < 1:5086362/134‑1 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGAc > 2:5086362/1‑134 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 1:697092/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 2:9628493/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 1:5455930/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 1:594584/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 2:8782136/1‑140 (MQ=255)
gCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcac > 2:4877190/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 2:674848/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACcaca > 1:9705169/1‑140 (MQ=255)
gtttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAt > 1:9565053/1‑140 (MQ=255)
gtttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAt > 1:3752249/1‑140 (MQ=255)
gtttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAt > 1:4119138/1‑140 (MQ=255)
tttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAtt > 2:9775685/1‑140 (MQ=255)
tttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAtt > 2:4906248/1‑140 (MQ=255)
tttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAtt > 2:538143/1‑140 (MQ=255)
tttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAtt > 2:8562677/1‑140 (MQ=255)
tttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAAtt > 1:8654254/1‑140 (MQ=255)
ttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTg > 1:934871/1‑140 (MQ=255)
ttgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTg > 2:10005508/1‑140 (MQ=255)
tgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGc > 1:10146289/1‑140 (MQ=255)
tgtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGc > 1:5276869/1‑140 (MQ=255)
gtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACACTTGCa < 2:1533079/140‑1 (MQ=255)
gtttTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCa < 2:9688628/140‑1 (MQ=255)
ttCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGAc < 1:4906235/140‑1 (MQ=255)
cAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACAt > 1:22947/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCATCGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:4600808/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:5641106/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:7241546/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:6557560/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:7678462/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:785568/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:2224529/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 2:1449650/1‑140 (MQ=255)
gCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGa > 1:21202/1‑140 (MQ=255)
ccTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTTTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAt < 2:8558961/140‑1 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGAt > 1:11504031/1‑137 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTc > 2:7905880/1‑140 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTc > 2:5608622/1‑140 (MQ=255)
tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTc > 1:1200227/1‑140 (MQ=255)
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tGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTc > 1:7438058/1‑140 (MQ=255)
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AATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGC > SRR14920161.5312183/1‑151 (MQ=60)
AATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGC > SRR14920161.5312140/1‑151 (MQ=60)
CTGTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACAT > SRR14920161.23149/1‑151 (MQ=60)
GTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGA > SRR14920161.5678899/1‑151 (MQ=60)
GTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGA > SRR14920161.790887/1‑151 (MQ=60)
GTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGA > SRR14920161.20991/1‑151 (MQ=60)
GTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGA > SRR14920161.21389/1‑151 (MQ=60)
GTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGA > SRR14920161.7730353/1‑151 (MQ=60)
GTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGA > SRR14920161.7693962/1‑151 (MQ=60)
GTTTGTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGA > SRR14920161.6601860/1‑151 (MQ=60)
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GTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaatgggggggggggggggggggggggggggggggggggggg > SRR14920161.9405627/1‑44 (MQ=60)
GTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTC > SRR14920161.463165/1‑151 (MQ=60)
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GTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTC > SRR14920161.4274237/1‑151 (MQ=60)
GTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTC > SRR14920161.5956758/1‑151 (MQ=60)
GTTTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTACTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATAAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTC > SRR14920161.11012499/1‑151 (MQ=60)
GTTATCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTC > SRR14920161.83451/1‑151 (MQ=60)
TTTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTT > SRR14920161.8787606/1‑151 (MQ=60)
TTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTT < SRR14920161.4939039/151‑1 (MQ=60)
TTCAGCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTT < SRR14920161.4939052/151‑1 (MQ=60)
GCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAG > SRR14920161.1574460/1‑151 (MQ=60)
GCCTTGCGAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAG > SRR14920161.2158332/1‑151 (MQ=60)
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GAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTTGTCTC > SRR14920161.6257386/1‑151 (MQ=60)
GAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTTGTCTC > SRR14920161.11226085/1‑151 (MQ=60)
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CTTTATCTAAAATGTTAGCGTTGAAGGCATGATGAATAAATATAACAGAACAAACGAGCGACATTTTATCTCCTTAAAACAATAAAGTTTTTATCGATACTTTTTTAACATTTCATATTTATAATTTGCTGTTTGTTTTCAGCCTTGCAAACTATTGATAATGAAATGTGTAAGATCTCTTGCAATGCGACCCATTTCTGAAATACTCAGCTGATCAATTGCCGAAAAAATGGCTATCAACGTAAGTGTCAGTAATAAGACAACCACAATTGCAGACATGATTTCTTTATAGTTGTCTC > NZ_CP025268/1588443‑1588741
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |