Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R2
|
870 |
341.9 |
11209456 |
97.2% |
10895591 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
4,476,316 |
A→G |
pseudogene (259/585 nt) |
bdcR → |
TetR/AcrR family transcriptional regulator |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 4,476,316 | 0 | A | G | 99.5%
| 1252.0
/ NA
| 375 | pseudogene (259/585 nt) | bdcR | TetR/AcrR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (176/197); minor base T (1/1); total (177/198) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 375 total aligned reads displayed.
TATCTTGGTATTAACCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAAGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGATCCACAAGCGCGTGATATTGCCGTTCAATATTATCA > NZ_CP025268/4476181‑4476452
|
tATCTTGGTATTAACCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGa < 1:4732036/140‑1 (MQ=255)
aTCTTGGTATTAACCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAg > 2:4547937/1‑140 (MQ=255)
tCTTGGTATTAACCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTCGGCGAGt > 1:2519531/1‑140 (MQ=255)
cTTGGTATTAACCCCCGGCGCCGATACGCGGCTTATGGCAGTAAAGCTGGGTTATGTAGCCGTGTACTCAATGAATACGCCGGTACGCAAGCGATTCCGCTTGCCGAGATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTg < 2:4130360/140‑1 (MQ=255)
ttGGTATTAACCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGc < 2:2304514/140‑1 (MQ=255)
tATTAACCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTgg > 2:3673894/1‑140 (MQ=255)
tAACCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTg < 2:3276167/140‑1 (MQ=255)
aaCCCCCCGCGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTCGCCGTGTACTCAATCAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGa < 1:2935439/140‑1 (MQ=255)
aaCCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGATGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGTTTGa > 1:3070813/1‑140 (MQ=255)
aCCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAg < 2:5489431/140‑1 (MQ=255)
aCCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAg > 1:1324519/1‑140 (MQ=255)
ccGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTAtt > 1:467877/1‑140 (MQ=255)
ccGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTAtt > 2:2965757/1‑140 (MQ=255)
ccGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTAtt > 2:2513281/1‑140 (MQ=255)
ccGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTAtt > 1:1282433/1‑140 (MQ=255)
ccGAGCCTCTACGCGGCATTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTGGAGGTAtt > 2:3688935/1‑140 (MQ=255)
tctACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAaagaa > 2:1314723/1‑140 (MQ=255)
tctACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAaagaa > 1:3271534/1‑140 (MQ=255)
tACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAgc > 1:1947523/1‑140 (MQ=255)
cgcgGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAgcgg < 1:3464617/140‑1 (MQ=255)
gCTTTTGGCAGTAAAGGTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGgcgcg < 1:2343650/140‑1 (MQ=255)
gCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGgcgcg < 1:939351/140‑1 (MQ=255)
gCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGgcgcg < 1:2811440/140‑1 (MQ=255)
gCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGgcgcg < 1:4233152/140‑1 (MQ=255)
tGGCAGTAAAGCTGGTTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAGGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATAATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGat < 2:2812553/140‑1 (MQ=255)
tAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGcc > 1:4912909/1‑140 (MQ=255)
tAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGcc > 1:2025627/1‑140 (MQ=255)
tAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGcc > 1:1791063/1‑140 (MQ=255)
gaaaGCTGGGTTATTTAGCCGTGGACGCAAAGAATACGTCGGTACGGAAGCCATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTCGGCGAGAGCCTGGCTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGcc > 1:3359560/2‑140 (MQ=255)
ggTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAAcggc > 2:4322750/1‑140 (MQ=255)
gtagttAGCGGTGTACTCAATGAATACGGTGGTACGTCAGCTGTTCCGTTTGCCGATCTTCTTCGTGATGATGGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAACGTAGCGGCGCGCAGATATAGCGAAGAcggcgg > 2:5319448/5‑140 (MQ=255)
aGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTgcgc < 1:3978750/140‑1 (MQ=255)
aGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTgcgc < 1:4078865/140‑1 (MQ=255)
gCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCgct < 2:1218880/140‑1 (MQ=255)
ccGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCgctg > 1:1622918/1‑140 (MQ=255)
ccGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCgctg > 1:4852775/1‑140 (MQ=255)
cGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTACAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCgctgg < 2:4809596/140‑1 (MQ=255)
tACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGt > 1:5463331/1‑140 (MQ=255)
tACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGt > 2:183772/1‑140 (MQ=255)
tACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGt > 1:382007/1‑140 (MQ=255)
tACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGt > 2:528317/1‑140 (MQ=255)
cTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTAt < 1:3015231/140‑1 (MQ=255)
cTCAATGAATACGTCGGTAAGGAAGCTATTCCTCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTAt < 2:2053611/140‑1 (MQ=255)
aaTGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGt > 1:602549/1‑140 (MQ=255)
aaTGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGt > 1:4961157/1‑140 (MQ=255)
aaTGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGt > 2:1417103/1‑140 (MQ=255)
aTACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCATAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTg < 2:4264929/140‑1 (MQ=255)
aTACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTg > 1:732088/1‑140 (MQ=255)
aTACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTg > 2:778886/1‑140 (MQ=255)
aTACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTg < 1:1024255/140‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGaa < 1:5210642/140‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGaa < 2:5130403/140‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGaa < 2:5547915/140‑1 (MQ=255)
aCGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGaa < 1:4636525/140‑1 (MQ=255)
cGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAg < 2:2409016/140‑1 (MQ=255)
cGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAg > 1:1055473/1‑140 (MQ=255)
cGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAg > 2:1971562/1‑140 (MQ=255)
cGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCAGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAg < 2:3061477/140‑1 (MQ=255)
tCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGt > 1:870063/1‑140 (MQ=255)
tCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGt < 1:1008181/140‑1 (MQ=255)
tCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGt > 1:1739472/1‑140 (MQ=255)
ggTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTAt > 1:1917609/1‑140 (MQ=255)
tACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTc > 2:4972476/1‑140 (MQ=255)
tACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTc > 2:2113086/1‑140 (MQ=255)
tACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTc > 2:595679/1‑140 (MQ=255)
aCGTAAGTTATTCCGCTTTCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCa < 2:1343422/140‑1 (MQ=255)
aCGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCa < 2:3791353/140‑1 (MQ=255)
aCGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCa < 1:3208858/140‑1 (MQ=255)
aCGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCa < 2:3428589/140‑1 (MQ=255)
aCGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCa < 1:5001376/140‑1 (MQ=255)
gCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCa < 2:1788221/140‑1 (MQ=255)
gCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCa < 1:2189940/140‑1 (MQ=255)
gCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCa < 1:3634970/140‑1 (MQ=255)
gCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCa < 2:1735121/140‑1 (MQ=255)
gCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCa < 2:1659245/140‑1 (MQ=255)
gCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCa < 2:3376371/140‑1 (MQ=255)
tATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATg < 1:2512918/140‑1 (MQ=255)
aTTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGa > 1:1217532/1‑140 (MQ=255)
aTTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGGTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGa > 2:3217653/1‑140 (MQ=255)
ttCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGAt < 2:1077871/140‑1 (MQ=255)
gCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGATCcac < 1:2562440/140‑1 (MQ=255)
cgtGCCGATATTCTTCGTGATTATCGTCAGGTAGGCTAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGTCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATAGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCGTGATCcaca > 2:275201/3‑140 (MQ=255)
cTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGa < 2:4449398/50‑1 (MQ=255)
cTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGa > 1:4449398/1‑50 (MQ=255)
ccGATATTCTTCGTGATTATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGATCCACAAgcg < 2:5090258/140‑1 (MQ=255)
ccGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGATCCACAAgcg < 1:142132/140‑1 (MQ=255)
cGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGCATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGATCCACAAgcgc > 1:5134723/1‑140 (MQ=255)
gATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAGGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGATCCACAAGcgcg < 1:3403432/140‑1 (MQ=255)
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GCTGAAGTTACTGATTATCTTGGTATTAACCCCCCGAGCCTCTACGCGGCTTTTGGCAGTAAAGCTGGGTTATTTAGCCGTGTACTCAATGAATACGTCGGTACGGAAGCTATTCCGCTTGCCGATATTCTTCGTGATGATCGTCCGGTAAGCGAGTGCCTGGTTGAGGTATTAAAAGAAGCGGCGCGCAGATATAGCCAAAACGGCGGCTGCGCTGGCTGTATGGTTCTTGAAGGTATTCATAGTCATGATCCACAAGCGCGTGATATTGCCGTTCAATATTATCACGCCGCAGAAACG > NZ_CP025268/4476166‑4476465
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |