Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R2
|
777 |
572.4 |
18918554 |
98.5% |
18634775 |
138.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,717,337 |
(C)7→6 |
intergenic (+361/‑251) |
nth → / → dtpA |
endonuclease III/dipeptide/tripeptide permease DtpA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,717,331 | 0 | C | . | 99.9%
| 3394.3
/ ‑3.6
| 709 | intergenic (+355/‑257) | nth/dtpA | endonuclease III/dipeptide/tripeptide permease DtpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base . (357/350); minor base A (1/0); total (358/351) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 788 total aligned reads displayed.
GAATCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAA > NZ_CP025268/1717192‑1717466
|
aaTCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcc < 1:9028927/140‑1 (MQ=255)
aaTCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATATTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcc < 2:7404293/140‑1 (MQ=255)
aTCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccc > 2:5974684/1‑140 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc > 1:1586751/1‑140 (MQ=255)
aGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccc > 2:1358028/1‑140 (MQ=255)
gTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctc > 2:2035581/1‑138 (MQ=255)
ttAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctct < 1:4513119/140‑4 (MQ=255)
atAACATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACAGTACCCTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctct < 2:4069055/139‑4 (MQ=255)
aTCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTcagtg < 2:9294842/140‑1 (MQ=255)
cATTTAAATTTACACACTCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTccgtgca < 2:4565593/140‑1 (MQ=255)
tttAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTcagtgcagt > 1:8152468/1‑140 (MQ=255)
tACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAAt > 1:5753920/1‑140 (MQ=255)
acacacGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAccc < 2:1117775/116‑1 (MQ=255)
ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtttttt > 1:7802246/1‑140 (MQ=255)
tGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTg < 1:6697425/140‑1 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑a > 1:7628887/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑a > 1:5579766/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑a > 2:154193/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑a > 2:6460129/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑a > 2:6935518/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑a > 2:9053376/1‑140 (MQ=255)
ccTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑aaa > 1:965027/1‑140 (MQ=255)
ccTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCGAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑aaa > 2:6775604/1‑140 (MQ=255)
cAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAAtt > 2:3759880/1‑140 (MQ=255)
aaCATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTaa < 2:1179499/140‑1 (MQ=255)
aaCATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTaa < 1:3599888/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTACATAGCAGAACCTATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACg < 2:7994051/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCCTCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACg > 2:9377808/1‑140 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACg < 2:555462/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACg < 1:6453708/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACg < 1:4083684/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACg < 2:5282236/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACg < 1:379795/140‑1 (MQ=255)
ttACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCt > 1:2234253/1‑140 (MQ=255)
ttACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCt > 2:1738902/1‑140 (MQ=255)
tACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTg > 1:6847122/1‑140 (MQ=255)
tACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTg > 1:1910794/1‑140 (MQ=255)
cccTGGCTATATTTCAGAAACTGGACTATCTCACTCGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGa < 1:7445650/138‑1 (MQ=255)
cacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGa < 1:8823418/140‑1 (MQ=255)
cacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGa < 1:3507661/140‑1 (MQ=255)
acTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGAt > 2:7929505/1‑140 (MQ=255)
tGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATaa > 2:8739774/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACa > 2:2236912/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:2941261/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:9169708/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACa > 2:3995605/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:8508587/1‑140 (MQ=255)
cTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTACAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACAt > 2:2410635/1‑140 (MQ=255)
tCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCgg < 2:5096242/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACg > 1:5161744/1‑120 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 2:7704199/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa > 2:4233546/1‑140 (MQ=255)
aTCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 2:3281546/128‑1 (MQ=255)
aTCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa > 1:3281546/1‑128 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTccc < 1:8668190/140‑1 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTccc < 2:6018527/140‑1 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTccc < 2:8881384/140‑1 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTccc < 1:6088148/140‑1 (MQ=255)
cACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGc < 1:2356227/140‑1 (MQ=255)
cACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGc < 2:7096291/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:5907000/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:3603905/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:7568805/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:1416747/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:3437781/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:2646528/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:4745318/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:3929269/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAACAGCAGAACCAATCCCCGAAAAGCCCTCA‑CCCCCCTCTCCGTCCAGTGAAACAATCAGCCGTTACGTTTTTTG‑CAAAATTTACCGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAAGGCCCCGCCt < 2:4421808/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAg < 2:3151772/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAg < 1:5382729/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACAGTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAg < 2:6698641/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGt > 2:1840348/1‑140 (MQ=255)
aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt > 2:290964/1‑135 (MQ=255)
aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGtt < 1:8351545/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGtt > 2:6100600/1‑140 (MQ=255)
aaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTta > 1:7074851/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGatat > 1:2545652/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTtat < 1:1039924/140‑1 (MQ=255)
aaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTtata < 2:827587/140‑1 (MQ=255)
aCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTatat > 1:467425/1‑140 (MQ=255)
aCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTatat > 1:1838013/1‑140 (MQ=255)
aCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTatat > 1:2828961/1‑140 (MQ=255)
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CTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTG > SRR14920173.6887545/1‑151 (MQ=60)
CTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAAAATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTT‑AAAAATTTAAatctg > SRR14920173.7644668/1‑146 (MQ=60)
AAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAA > SRR14920173.6503816/1‑151 (MQ=60)
AAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATATAACGCTGGATAA > SRR14920173.6902803/1‑151 (MQ=60)
ACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGCCTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACA > SRR14920173.2996248/1‑151 (MQ=60)
ACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACA > SRR14920173.1612543/1‑151 (MQ=60)
ACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACA > SRR14920173.8092468/1‑151 (MQ=60)
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ACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACA < SRR14920173.9245612/151‑1 (MQ=60)
ACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACA > SRR14920173.6852272/1‑151 (MQ=60)
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ACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACA > SRR14920173.8565801/1‑151 (MQ=60)
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ACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACA > SRR14920173.7842253/1‑151 (MQ=60)
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CATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACAT < SRR14920173.4692364/151‑1 (MQ=60)
ATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATT < SRR14920173.484916/151‑1 (MQ=60)
CCCTGGCTATATTTCAGAAACTGGACTATCTCACTCGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCC < SRR14920173.7489742/151‑1 (MQ=60)
CACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCC < SRR14920173.8875921/151‑1 (MQ=60)
CACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCC < SRR14920173.8780991/151‑1 (MQ=60)
GGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑TAAAATTTAACGCTGGATAACATctgtctctt > SRR14920173.5191670/1‑142 (MQ=60)
GGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAA > SRR14920173.6944193/1‑151 (MQ=60)
GGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAA > SRR14920173.5176331/1‑151 (MQ=60)
TTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTT < SRR14920173.8745396/151‑1 (MQ=60)
TTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTG < SRR14920173.6143252/151‑1 (MQ=60)
CAGACACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATT < SRR14920173.1916705/151‑1 (MQ=60)
AGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTC < SRR14920173.367036/151‑1 (MQ=60)
AGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTC < SRR14920173.2360115/151‑1 (MQ=60)
GAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCC > SRR14920173.9274527/1‑151 (MQ=60)
GAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCC > SRR14920173.3301849/1‑151 (MQ=60)
CTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGC > SRR14920173.8044270/1‑151 (MQ=60)
ccacaaacacacaAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCG > SRR14920173.2218032/14‑151 (MQ=60)
GGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCT > SRR14920173.1399659/1‑151 (MQ=60)
ATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTT > SRR14920173.9429888/1‑151 (MQ=60)
TCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTA > SRR14920173.8021605/1‑151 (MQ=60)
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TCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACAGATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTA < SRR14920173.8494201/151‑1 (MQ=60)
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CACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATAT < SRR14920173.5681530/151‑1 (MQ=60)
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CACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATAT > SRR14920173.3127240/1‑151 (MQ=60)
CACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATAT < SRR14920173.2370066/151‑1 (MQ=60)
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ACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATG < SRR14920173.4004309/151‑1 (MQ=60)
tataagagacaGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGT < SRR14920173.6016013/140‑1 (MQ=60)
CTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGT < SRR14920173.3952139/151‑1 (MQ=60)
CTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGT < SRR14920173.3137246/151‑1 (MQ=60)
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agatgtagctccgtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAAC < SRR14920173.1408663/105‑1 (MQ=60)
AAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGAT < SRR14920173.1045874/151‑1 (MQ=60)
AAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGAT < SRR14920173.3246306/151‑1 (MQ=60)
AAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGAT < SRR14920173.5913911/151‑1 (MQ=60)
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CTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTG‑AAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTA > SRR14920173.2581815/1‑151 (MQ=60)
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|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |