Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R5
|
781 |
658.8 |
22969755 |
98.0% |
22510359 |
137.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,717,337 |
(C)7→6 |
intergenic (+361/‑251) |
nth → / → dtpA |
endonuclease III/dipeptide/tripeptide permease DtpA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,717,331 | 0 | C | . | 99.7%
| 7009.3
/ 7.8
| 1460 | intergenic (+355/‑257) | nth/dtpA | endonuclease III/dipeptide/tripeptide permease DtpA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/5); new base . (735/717); total (737/723) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.97e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 1592 total aligned reads displayed.
GAATCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAA > NZ_CP025268/1717192‑1717466
|
aaTCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcc < 2:1916548/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCNCTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc < 1:10632412/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc < 1:10014127/140‑1 (MQ=255)
tCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccc < 1:296690/140‑1 (MQ=255)
gTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctc > 1:9362722/1‑138 (MQ=255)
gTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACACATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctc > 1:6069097/1‑138 (MQ=255)
ttAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCAcccccctct < 2:4786860/140‑4 (MQ=255)
aTCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTcagtg < 1:7420359/140‑1 (MQ=255)
cATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTcagtgca < 1:5334024/140‑1 (MQ=255)
tttAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTcagtgcagt > 2:2688579/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtttttt > 2:410004/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtttttt > 2:10343183/1‑140 (MQ=255)
ttGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGtttttt > 1:3959745/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 2:9776808/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 1:11005178/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 2:8133948/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGa > 2:5481933/1‑140 (MQ=255)
gACCTACAAAACATTACAATGGCTATTTTTCAGAAAATGGACTCTCTCACTACTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGATTTTTGa > 2:10005387/1‑140 (MQ=255)
cAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAtt > 2:10897465/1‑140 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACg < 2:3911484/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACg < 1:11368238/140‑1 (MQ=255)
cATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACg < 2:6514652/140‑1 (MQ=255)
ttACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCt > 2:6280643/1‑140 (MQ=255)
tACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTg > 2:8272000/1‑140 (MQ=255)
cacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTCCGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGa > 2:2456663/1‑140 (MQ=255)
cacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGa > 1:9564663/1‑140 (MQ=255)
cacTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGa < 1:11150596/140‑1 (MQ=255)
acTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGAt < 1:5560814/140‑1 (MQ=255)
tGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATaa > 2:8932450/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCTGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:7262272/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:7606962/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:653378/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:9169626/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:4218546/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:3812194/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 1:2237529/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa > 2:9241905/1‑140 (MQ=255)
gCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCAC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACa < 2:1540648/140‑1 (MQ=255)
cTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAGATTTAACGCTGGATAACAt > 1:6777608/1‑140 (MQ=255)
ttttCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTcc < 2:3284475/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCTTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 2:6117327/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 2:1691439/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 2:7096805/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 1:7841462/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 2:7308739/140‑1 (MQ=255)
aGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 1:4541032/140‑1 (MQ=255)
aaaCTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATg > 2:5031902/1‑140 (MQ=255)
tGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTg > 1:10407806/1‑140 (MQ=255)
aTCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTcc > 2:9447048/1‑140 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTccc < 1:4078936/140‑1 (MQ=255)
tctcACTAGTAAAAACGCTAAATAGCACAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTccc < 1:8217164/140‑1 (MQ=255)
cACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGc < 2:5379728/140‑1 (MQ=255)
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cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTTAAAAAATCTGCCGTTACGTTTGTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATTGTTGAATTCCCCGCCt > 1:509995/1‑140 (MQ=255)
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cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:9595406/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:8042614/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:5690309/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:2716755/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 1:9776809/140‑1 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt > 1:5755350/1‑140 (MQ=255)
cTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCt < 2:764152/140‑1 (MQ=255)
gTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGaa < 1:3247881/119‑1 (MQ=255)
aataaagCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑ACCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGtt < 2:8684052/134‑1 (MQ=255)
aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGtt < 2:5271638/140‑1 (MQ=255)
aaaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGtt > 2:10699594/1‑140 (MQ=255)
aaaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGtt > 1:4782621/1‑139 (MQ=255)
aaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTtat < 2:2909965/140‑1 (MQ=255)
aaaCGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTtat < 2:3549922/140‑1 (MQ=255)
gCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAAGTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGACTGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGt > 2:11246801/1‑140 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTACGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 2:4347224/140‑1 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 1:6239266/140‑1 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 1:70391/140‑1 (MQ=255)
tAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 2:11053060/140‑1 (MQ=255)
aaTAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCTCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa < 1:8595458/140‑1 (MQ=255)
cAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTaa > 1:10792495/1‑133 (MQ=255)
cAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGatta > 1:10184292/1‑140 (MQ=255)
cAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGatta > 2:7906311/1‑140 (MQ=255)
cAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGatta < 1:1300321/140‑1 (MQ=255)
cAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGatta < 1:2383733/140‑1 (MQ=255)
cAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTCGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGatta < 2:11479891/140‑1 (MQ=255)
cAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑ACCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCAGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGatta < 2:6666428/140‑1 (MQ=255)
aGAACATATCGCCGTTAAGCCATCA‑CCCCC‑CTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGattat < 1:3643563/140‑1 (MQ=255)
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tccggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagAGCCATCA‑CCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGT < SRR14920170.10320352/113‑1 (MQ=60)
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CAAGAATCAGGTTAAAATCATTTAAATTTACACACGCAACAAATATTGACCTACAAAACATTACACTGGCTATTTTTCAGAAACTGGACTATCTCACTAGTAAAAACGCTAAATAGCAGAACATATCGCCGTTAAGCCATCACCCCCCCTCTCAGTGCAGTGAAAAAATCTGCCGTTACGTTTTTTGAAAAATTTAACGCTGGATAACATTTCCCGGAATGGTTGAATTCCCCGCCTCAGTTATATGTAACAGATTATTACAAAGGACTTGTCTGAAAGTGCAAGATAGTGAACATTAC > NZ_CP025268/1717189‑1717487
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |