Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R3
|
779 |
308.9 |
10220750 |
96.7% |
9883465 |
138.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,620,861 |
T→C |
A93A (GCT→GCC) |
yneK → |
putative protein YneK |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,620,861 | 0 | T | C | 99.1%
| 381.6
/ NA
| 116 | A93A (GCT→GCC) | yneK | putative protein YneK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (60/54); total (61/55) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
CGTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCTAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGG > NZ_CP025268/1620725‑1620995
|
cGTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAgg > 1:3208515/1‑140 (MQ=255)
gTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGa > 2:3100422/1‑140 (MQ=255)
ttAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATgg < 1:3673932/140‑1 (MQ=255)
tAAACATCAACTCAGCTACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATCTATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGa < 1:2840335/140‑1 (MQ=255)
tAAAAATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGAAAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGa < 2:2675051/140‑1 (MQ=255)
aaCATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAg < 2:3427677/140‑1 (MQ=255)
cAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGAcaca > 1:455832/1‑140 (MQ=255)
cAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGAcaca < 2:4135385/140‑1 (MQ=255)
cAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGAcaca > 2:4104114/1‑140 (MQ=255)
cAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGAcaca > 2:5072849/1‑140 (MQ=255)
aaaccAGCCACACACAAGATATTTACTCACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCATTTCGGGGCAACGACACGCTCTACCATGTAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACaa < 2:4188321/136‑1 (MQ=255)
aaCTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACaa > 1:2588118/1‑140 (MQ=255)
caAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATAtt < 1:5105331/140‑1 (MQ=255)
caAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATAtt < 1:1465105/140‑1 (MQ=255)
gATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTGCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTc > 1:558845/1‑140 (MQ=255)
atatTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCa < 2:4290050/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAGCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 2:4211884/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATCTTCAGAGCACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 2:4212122/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 1:3842630/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 1:4660102/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 1:4659590/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 2:3502161/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 1:490213/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 1:2643530/140‑1 (MQ=255)
aaCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 2:4812848/140‑1 (MQ=255)
aaCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 1:3306231/140‑1 (MQ=255)
aaCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 1:1651893/140‑1 (MQ=255)
tGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATCAAtt > 1:2218663/1‑140 (MQ=255)
aCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGc < 1:4210287/140‑1 (MQ=255)
aCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGc < 2:4145372/140‑1 (MQ=255)
aCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGc < 1:1462973/140‑1 (MQ=255)
aCTTATCATATATTCAGAGGACATCTTTTCGGGGGAACGACACGCTATACAGTGAAAAGGTTCAGTTTCAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAACGAAAATATTGAATTTCAGGCTGTAATAAATTTAAGc < 2:3569279/140‑1 (MQ=255)
cTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGcc < 2:317115/140‑1 (MQ=255)
ttATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGccc < 1:211990/140‑1 (MQ=255)
tATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCt > 2:4113486/1‑140 (MQ=255)
atatTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCtatttat < 1:4052703/140‑1 (MQ=255)
atTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTatttattt > 1:2964123/1‑140 (MQ=255)
atTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCATatttattt > 2:1657594/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTAtttattta > 1:3918807/1‑140 (MQ=255)
agagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGAt > 2:2936338/1‑140 (MQ=255)
cggACTTCTTGTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATGACGCTAGGAATGGAAGACACAACGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATaa > 2:262771/2‑140 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTCTCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAAAATTGAATTTCAGGTAGTCATAAATTTAAGCCCTATTTATTGAGATaa > 2:2526141/1‑140 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATaa > 2:1534514/1‑140 (MQ=255)
aCTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCGATTTATTTAGATAAttt > 2:3392556/1‑140 (MQ=255)
cttcttTTCAGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAAGAATGGAAGAAACAAAAAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAAtttt < 2:1835262/140‑1 (MQ=255)
ttcttTTCTGGGTAACGACACACTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGATTGGAATAGACAAATAAAATATTGCATTTCATGTAGTAATAAATTTAATCCCTATTTATTTAGATAATTTTc > 2:203075/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTc > 1:4601903/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTc > 1:4614897/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTc > 1:4601660/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTc > 1:2117026/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTc > 2:4781666/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATATTc > 2:2794510/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTACCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATGTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTAGTTAGATAATTTTc > 2:4631933/1‑140 (MQ=255)
ttCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCat > 1:1578790/1‑140 (MQ=255)
aaCGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGgaga > 1:2139386/1‑140 (MQ=255)
cGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGaaa < 1:1212067/140‑1 (MQ=255)
cGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAat > 1:525179/1‑140 (MQ=255)
cGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAat > 1:3513800/1‑140 (MQ=255)
taCAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATAtttt < 2:1890217/140‑1 (MQ=255)
aaTGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTg > 1:3481339/1‑140 (MQ=255)
aTGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgc < 2:2164183/140‑1 (MQ=255)
aTGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgc < 1:3370094/140‑1 (MQ=255)
aTGAAAAGGTTCAGTGTAAACTCACTTATCACGCCAGGAATGGAAGACTCACGGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGATATTAATAATTTTTgc < 2:4103660/140‑1 (MQ=255)
aTGAAAAGATTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgc < 2:4764112/140‑1 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAATAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAGTTAATATGTTTTgag > 2:235892/1‑138 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 2:4878919/1‑140 (MQ=255)
gAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcgc > 1:4151243/1‑140 (MQ=255)
aaaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCt > 1:3172958/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 2:3286665/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 1:4457204/1‑140 (MQ=255)
aaaGGGTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCtctc > 2:1273217/1‑140 (MQ=255)
aaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcc < 1:1249609/140‑1 (MQ=255)
aaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcc < 1:1327039/140‑1 (MQ=255)
aaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcc < 2:2964123/140‑1 (MQ=255)
aaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcc < 2:1515001/140‑1 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc > 2:3115070/1‑140 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc < 2:3200691/140‑1 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc > 1:3753561/1‑140 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc > 1:3753519/1‑140 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTGATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc > 1:1874144/1‑140 (MQ=255)
ttCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaac > 2:850563/1‑140 (MQ=255)
aGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccagccca < 2:1838372/140‑1 (MQ=255)
aGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaaccca < 2:3110870/140‑1 (MQ=255)
gTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaacccaa > 1:2063665/1‑140 (MQ=255)
tAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGc < 2:2439557/140‑1 (MQ=255)
tAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGc > 2:224978/1‑140 (MQ=255)
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ACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGG < SRR14920166.2942579/151‑1 (MQ=60)
CACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGC > SRR14920166.927952/1‑151 (MQ=60)
CCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTC < SRR14920166.3121820/151‑1 (MQ=60)
CCAGGAATGCAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAGAC < SRR14920166.4608667/151‑1 (MQ=60)
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GAAGAGTGGCGCACGTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCTAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAGAC > NZ_CP025268/1620712‑1621010
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
