Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R6
|
776 |
393.9 |
12922803 |
98.2% |
12690192 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,620,861 |
T→C |
A93A (GCT→GCC) |
yneK → |
putative protein YneK |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,620,861 | 0 | T | C | 100.0%
| 664.2
/ NA
| 191 | A93A (GCT→GCC) | yneK | putative protein YneK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (116/75); total (116/75) |
Only 100 of 191 total aligned reads displayed.
ACGTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCTAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGC > NZ_CP025268/1620724‑1620997
|
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gTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGa > 2:4980398/1‑140 (MQ=255)
gTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGa < 1:6128666/140‑1 (MQ=255)
cTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAAt > 2:3260003/1‑140 (MQ=255)
tAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGa < 1:983653/140‑1 (MQ=255)
aaaCATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGaa < 1:5836075/140‑1 (MQ=255)
cATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGac < 2:4424433/140‑1 (MQ=255)
cATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGac < 1:1929604/140‑1 (MQ=255)
cAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACCATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGacacc > 2:5807091/1‑139 (MQ=255)
cAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGaa > 2:2533836/1‑134 (MQ=255)
cAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGAcaca > 2:606496/1‑140 (MQ=255)
aaCTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACaa > 1:6373926/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGa < 1:6459990/140‑1 (MQ=255)
cacaAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAata < 2:3884895/140‑1 (MQ=255)
cacaAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAANGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAata < 1:5699555/140‑1 (MQ=255)
caAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATAtt < 1:2726644/140‑1 (MQ=255)
caAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGAATTCTTTTCGGTGTAACGACACGCTATACAATGAAAATGTTCATTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATAtt < 1:3066503/140‑1 (MQ=255)
aaaaaGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGa > 1:1954866/1‑140 (MQ=255)
aGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAAttt < 2:4920519/140‑1 (MQ=255)
tatTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAg > 1:2915486/1‑140 (MQ=255)
tatTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAg < 2:2917156/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 2:5435297/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 1:114848/140‑1 (MQ=255)
atTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 2:6442799/140‑1 (MQ=255)
taaCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTAAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaa < 1:4980336/140‑1 (MQ=255)
aaCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 1:2233217/140‑1 (MQ=255)
aaCCTATACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACATTGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTTTCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGCAAATATTGAATTTCAGGTAGtaat < 2:6182855/140‑1 (MQ=255)
aCCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaata < 2:1251075/140‑1 (MQ=255)
ccTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaataa > 1:1099152/1‑140 (MQ=255)
ccTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGtaataa > 1:1099202/1‑140 (MQ=255)
gACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGACAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAATACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAAttt > 2:1941523/1‑140 (MQ=255)
gACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAAttt < 1:1778907/140‑1 (MQ=255)
gACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAAttt > 2:4040324/1‑140 (MQ=255)
aCAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTa > 2:4837823/1‑140 (MQ=255)
aCAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTa > 1:4005535/1‑140 (MQ=255)
aaCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAg < 1:6356328/140‑1 (MQ=255)
aCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGc < 2:1757545/140‑1 (MQ=255)
aCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGc < 2:1818459/140‑1 (MQ=255)
aCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGc < 2:568298/140‑1 (MQ=255)
aCTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGc < 1:1306909/140‑1 (MQ=255)
ttATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGccc < 2:4684538/140‑1 (MQ=255)
tATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCt > 2:3223621/1‑140 (MQ=255)
tATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCt > 2:6146469/1‑140 (MQ=255)
aTCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCta > 1:2543276/1‑140 (MQ=255)
tCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCtat > 1:3248511/1‑140 (MQ=255)
atTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTatttattt > 2:5893038/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAAttt > 2:89046/1‑107 (MQ=255)
ttCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAgg < 1:468787/111‑1 (MQ=255)
ttCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTAtttattta > 2:354650/1‑140 (MQ=255)
cAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGa < 2:2003450/140‑1 (MQ=255)
agagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACaa < 2:891661/88‑1 (MQ=255)
agagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACaa > 1:891661/1‑88 (MQ=255)
agagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGAt > 2:434801/1‑140 (MQ=255)
agagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGAt > 1:628180/1‑140 (MQ=255)
gagGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATa > 2:4713111/1‑140 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATATATTTAAGCCCTATTTATTTAGATaa > 2:5802224/1‑140 (MQ=255)
agGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATaa > 2:5065516/1‑140 (MQ=255)
aCTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAAttt > 1:165512/1‑140 (MQ=255)
ttcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTc > 2:3064887/1‑140 (MQ=255)
tcttTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAAGGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCg < 2:1068552/140‑1 (MQ=255)
cttTTCGGGGTAACGACACGCGATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCGTGTTTATTTAGATAATTTTCGc > 1:6157486/1‑140 (MQ=255)
gTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGga < 1:5469504/140‑1 (MQ=255)
gTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGga < 1:1345907/140‑1 (MQ=255)
cGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGACAATATTGAAGTTCAGGGAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATACTTTTCGCCATGATGGAGaaa > 2:707559/1‑140 (MQ=255)
cTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAatat > 1:2448049/1‑140 (MQ=255)
aCAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATAttttt > 1:5596586/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 1:1273166/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 1:3457129/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 2:5920837/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAAGTGCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATACTTTTCGCCATGATGTAGAAATTAATATTTTTTgcg > 2:1844564/1‑140 (MQ=255)
tGAAAAGGTTCAGTTAAAACTCACTTAGCCCGCCAGGAATGGAAGACACACAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCATATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcg > 2:1844636/1‑140 (MQ=255)
gAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTgcgc > 2:2557456/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCGCTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 2:5212174/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 2:1373495/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 1:103172/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 1:203346/1‑140 (MQ=255)
aaaGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTAGTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTc > 1:3927146/1‑140 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATCTTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc > 1:3677276/1‑140 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGANTTTCAGGTAGTAATAAATTTATGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTATTATTTTTTGCGCTccc > 1:5700939/1‑140 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc < 2:2847715/140‑1 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc < 1:5753408/140‑1 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc > 1:866995/1‑140 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTccc > 1:5040803/1‑140 (MQ=255)
aGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATAAATATTTTTTGCGCTccc < 2:5823859/140‑1 (MQ=255)
cAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaaccc > 1:5364/1‑140 (MQ=255)
cAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaaccc > 2:4364285/1‑140 (MQ=255)
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aGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTcccaaccca < 1:1853774/140‑1 (MQ=255)
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ACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTT > SRR14920171.3991249/1‑151 (MQ=60)
CGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTT > SRR14920171.5622375/1‑151 (MQ=60)
ACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCG > SRR14920171.1278997/1‑151 (MQ=60)
ACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCG > SRR14920171.3254265/1‑151 (MQ=60)
ACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCG > SRR14920171.3472915/1‑151 (MQ=60)
ACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCG > SRR14920171.6068612/1‑151 (MQ=60)
CGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGC > SRR14920171.543947/1‑151 (MQ=60)
GCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTCAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCT > SRR14920171.1130469/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920171.103702/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920171.388611/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920171.204364/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920171.204265/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920171.5773822/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920171.2894804/1‑151 (MQ=60)
CTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTAGTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTC > SRR14920171.3945142/1‑151 (MQ=60)
ATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATCTTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCC > SRR14920171.3694077/1‑151 (MQ=60)
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ATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCC > SRR14920171.5063987/1‑151 (MQ=60)
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ATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCC > SRR14920171.870883/1‑151 (MQ=60)
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ATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCC < SRR14920171.899008/151‑1 (MQ=60)
AGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGNAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGANAAATTAANATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCC > SRR14920171.5658822/1‑151 (MQ=60)
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GTTTAAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACT > SRR14920171.299531/1‑151 (MQ=60)
AAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGG > SRR14920171.3842463/1‑151 (MQ=60)
AAACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGG < SRR14920171.436759/151‑1 (MQ=60)
ACTCACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGG < SRR14920171.725893/151‑1 (MQ=60)
CACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGC > SRR14920171.2485283/1‑151 (MQ=60)
CACTTATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGC > SRR14920171.4408747/1‑151 (MQ=60)
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ATCCCGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATT > SRR14920171.5925390/1‑151 (MQ=60)
CGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGACATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAG > SRR14920171.1422443/1‑151 (MQ=60)
CGCCAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAG > SRR14920171.1422476/1‑151 (MQ=60)
CAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAGACC < SRR14920171.3414066/151‑1 (MQ=60)
|
AGTGGCGCACGTCTTTAAACATCAACTCAGCCACAAAAAAGATATTTAATAACCTTGACAACTTATCATATATTCAGAGGACTTCTTTTCGGGGTAACGACACGCTATACAATGAAAAGGTTCAGTTTAAACTCACTTATCCCGCTAGGAATGGAAGACACAAAGAAAATATTGAATTTCAGGTAGTAATAAATTTAAGCCCTATTTATTTAGATAATTTTCGCCATGATGGAGAAATTAATATTTTTTGCGCTCCCAACCCAAAGCCTGTCACTATGGGGCGCGTATTTCAGACC > NZ_CP025268/1620716‑1621011
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
