Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
255 |
508.1 |
22210536 |
99.3% |
22055062 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
2,651,339 |
T→C |
F68L (TTC→CTC) |
PA14_RS12480 → |
MFS transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 2,651,339 | 0 | T | C | 100.0%
| 1925.0
/ NA
| 491 | F68L (TTC→CTC) | PA14_RS12480 | MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (224/267); total (224/267) |
Only 100 of 491 total aligned reads displayed.
GGTGGCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGTTCAAGGGCTGGCTGATCAACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGC > NC_008463/2651191‑2651486
|
ggtggCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTc > 1:7410405/1‑151 (MQ=255)
gtggCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCa > 1:7271718/1‑151 (MQ=255)
gCGTTCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGGTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGGCCGCCGGGGACCGCGCCGCGGTGTCGTTGCGGGTGGCGCGGTTCGGAGTGGCGGTCGCCAGCACCAGCCCGCTCAAgg > 2:9121873/1‑151 (MQ=255)
tGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggctggct > 2:14808/1‑151 (MQ=255)
tGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGggctggct < 1:5178040/151‑1 (MQ=255)
cTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGa < 1:160251/151‑1 (MQ=255)
cTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGa > 2:10088459/1‑151 (MQ=255)
tCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGAt < 1:9963302/151‑1 (MQ=255)
cccACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGAcc < 1:438262/151‑1 (MQ=255)
aCCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGtt > 1:7156282/1‑151 (MQ=255)
ccGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTg < 2:8812085/151‑1 (MQ=255)
ggCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTggg > 2:4396915/1‑151 (MQ=255)
gCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTgggg < 2:5696520/151‑1 (MQ=255)
gctgAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCgcgg < 1:10267960/151‑1 (MQ=255)
ctgAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCgcggc > 2:2800249/1‑151 (MQ=255)
gAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGcggcgg > 1:9302902/1‑151 (MQ=255)
acacCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGAc > 1:3452849/1‑151 (MQ=255)
cacCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACa < 1:8911121/151‑1 (MQ=255)
ccTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAAt > 2:5435200/1‑151 (MQ=255)
ttCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGc < 1:6891318/151‑1 (MQ=255)
ttCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGc < 2:6616489/151‑1 (MQ=255)
ttCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGc > 1:1787348/1‑151 (MQ=255)
tCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCt > 1:4787229/1‑151 (MQ=255)
aGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCg > 1:10149600/1‑151 (MQ=255)
gTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCgg < 2:4863707/151‑1 (MQ=255)
gTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCgg < 1:2366642/151‑1 (MQ=255)
tCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCggg < 2:969359/151‑1 (MQ=255)
tCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTGGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCggg < 2:4198182/151‑1 (MQ=255)
tGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCt < 2:6230989/151‑1 (MQ=255)
cATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGAcc < 1:4684806/151‑1 (MQ=255)
cATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGAcc > 2:9540645/1‑151 (MQ=255)
cGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACcgcg < 1:6990335/151‑1 (MQ=255)
gCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCgg > 2:7681659/1‑151 (MQ=255)
ccGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGccc > 1:10640907/1‑151 (MQ=255)
cGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCt > 2:1614325/1‑151 (MQ=255)
gATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTg < 1:3071938/151‑1 (MQ=255)
gATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGGGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAAGGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTg > 1:6639615/1‑151 (MQ=255)
aTGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGt > 2:6370031/1‑151 (MQ=255)
tGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTc < 2:9840193/151‑1 (MQ=255)
gcgcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGATGGGGCGCGCCGCGGAATAAGCTCGGGCTGACCGCGGCACTggagct > 1:6802735/1‑146 (MQ=255)
gcCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgc < 2:3328557/151‑1 (MQ=255)
ccGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgcc < 1:1315631/151‑1 (MQ=255)
cGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccg > 1:6309105/1‑151 (MQ=255)
aGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgct > 2:4569204/1‑151 (MQ=255)
gTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgctg > 2:4321279/1‑151 (MQ=255)
gTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTcgctgccgctg > 1:8505209/1‑151 (MQ=255)
aCGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCgctgct < 2:6515501/151‑1 (MQ=255)
gCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCg < 2:8127145/151‑1 (MQ=255)
ccTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCgg > 2:5043665/1‑151 (MQ=255)
cTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGc > 1:4088496/1‑151 (MQ=255)
gggACCGCGCCGAGGTGTCGTTGATGTTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTTATCGACCGTTGGGGAGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCAGACCGCGGCACTGTCGATGCCGCTTCTCGGCCt > 2:1870030/1‑151 (MQ=255)
ccGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTggcg < 2:10251902/151‑1 (MQ=255)
gcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGcggcgg < 2:6845392/151‑1 (MQ=255)
gcCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGcggcgg > 2:2059698/1‑151 (MQ=255)
ccGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGt > 2:2967427/1‑151 (MQ=255)
cGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTg < 1:9694380/151‑1 (MQ=255)
cGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTg < 2:3859034/151‑1 (MQ=255)
gAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGa > 2:5961329/1‑151 (MQ=255)
ggTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGGGAAt > 1:8346671/1‑151 (MQ=255)
gtgtCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATg < 1:5963968/151‑1 (MQ=255)
tCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCg < 2:10367014/151‑1 (MQ=255)
cGTTGCCGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCCGCCCGCTCAAGGGATGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCCGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCACGCACTGGCGGCGGTGCAAGccct > 2:10147053/1‑149 (MQ=255)
gTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTc > 1:2720928/1‑151 (MQ=255)
ttGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCt < 2:2415623/151‑1 (MQ=255)
ttGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCt > 2:3192341/1‑151 (MQ=255)
cTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGc > 2:5623835/1‑151 (MQ=255)
cTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCACCTCGGCCTGGCGGCGGTGCATGCCGTCTGGc > 2:89745/1‑151 (MQ=255)
tGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCa > 2:7162195/1‑151 (MQ=255)
tGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAAct < 1:10911389/151‑1 (MQ=255)
gACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAActc < 1:10075932/151‑1 (MQ=255)
cGCTGTTCGGCCTGGCGGTCGCCATCACCCGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACCATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCGCGGCCTGGCGGCGGGGAATGCCGTCTGGCAACTCTa < 2:7808474/151‑1 (MQ=255)
cggTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAAAGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcg < 2:9314294/149‑1 (MQ=255)
cTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcg < 1:2979935/151‑1 (MQ=255)
cTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGACTGGCAACTCTAcg > 1:7780779/1‑151 (MQ=255)
tGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcgc > 2:8210143/1‑151 (MQ=255)
tGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcgc > 1:2439498/1‑151 (MQ=255)
gTTCGGACTGGCGTTCGCCATCACCAGCCCGCTCAATGGCTGGCAGATAGACCGTTGGTGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTAcgcg < 2:119835/151‑1 (MQ=255)
ttaggACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCAGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACgcgc > 1:6378853/4‑151 (MQ=255)
ttCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTTCgcgc > 1:7976961/1‑151 (MQ=255)
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cGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGCTCAAGGGCTGGCTGATCGACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTg < 1:209449/151‑1 (MQ=255)
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GTGGTGGCGATCATGCTCGGGCCCACCGGCATCCTGCTGAACACCTTCAGTCTGTTCATCGCACCGATGAGCGCCGAGTACGCCTGGGACCGCGCCGAGGTGTCGTTGCTGGTGACGCTGTTCGGACTGGCGGTCGCCATCACCAGCCCGTTCAAGGGCTGGCTGATCAACCGTTGGGGCGCGCGGCGGACAATGCTCGGGCTGACCGCGGCCCTGTCGCTGCCGCTGCTCGGCCTGGCGGCGGTGAATGCCGTCTGGCAACTCTACGCGCTGTTCCTGCTGATCGGCCTGCTGGCGCCAG > NC_008463/2651189‑2651489
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |