Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
260 |
537.2 |
23268138 |
99.2% |
23081992 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,281,477 |
G→C |
intergenic (‑25/+44) |
katE ← / ← PA14_RS14985 |
catalase HPII/general stress protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,281,477 | 0 | G | C | 99.7%
| 1385.7
/ NA
| 355 | intergenic (‑25/+44) | katE/PA14_RS14985 | catalase HPII/general stress protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base C (172/182); minor base A (1/0); total (173/182) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.87e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
TGGCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGGGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGC > NC_008463/3281329‑3281624
|
tGGCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGGGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCCTCCTGGGCATGAAATTggggcgg > 2:10723299/1‑151 (MQ=255)
ggCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGa < 1:4543277/151‑1 (MQ=255)
cGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATg < 2:10174811/151‑1 (MQ=255)
cGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATg > 1:1382242/1‑151 (MQ=255)
tCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGcc > 2:7137173/1‑151 (MQ=255)
ccTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCt < 2:11293103/151‑1 (MQ=255)
tCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTcc < 2:518484/151‑1 (MQ=255)
cgcgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTccc < 1:6836970/151‑1 (MQ=255)
gcgATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCt > 2:2053895/1‑151 (MQ=255)
gATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGc > 2:3295995/1‑151 (MQ=255)
gATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGc < 2:5976857/151‑1 (MQ=255)
ggCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCg > 2:2509074/1‑151 (MQ=255)
ccTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGcc < 1:1369556/151‑1 (MQ=255)
ccTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGcc > 2:3543429/1‑151 (MQ=255)
ccTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGcc < 2:6156961/151‑1 (MQ=255)
cTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGccc > 2:7303435/1‑151 (MQ=255)
gCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttc > 2:8720115/1‑151 (MQ=255)
tGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcac > 1:9816130/1‑151 (MQ=255)
tGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcac < 1:9241690/151‑1 (MQ=255)
tCCATCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcacttc < 2:9830496/151‑1 (MQ=255)
cAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCAttcacttcac > 2:1106529/1‑151 (MQ=255)
gCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTg < 1:3732041/151‑1 (MQ=255)
ttGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTgcg < 1:3235258/151‑1 (MQ=255)
ttGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTgcg > 2:11542681/1‑151 (MQ=255)
tGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTgcgc > 1:3914793/1‑151 (MQ=255)
tGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTgcgc > 1:5089793/1‑151 (MQ=255)
tGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCAATgcgc > 2:3197678/1‑151 (MQ=255)
ggCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGcgcg < 1:10728763/151‑1 (MQ=255)
gCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCgg < 2:55166/151‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTa > 2:9030286/1‑151 (MQ=255)
tggCTGGTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGGTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTa < 2:4913079/149‑1 (MQ=255)
tGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTAt < 2:1872465/151‑1 (MQ=255)
cTGTTGCCACGGTCGACTGTGTCTGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCa < 2:121849/151‑1 (MQ=255)
cTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCTCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATTGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCa > 1:417482/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGt < 2:5728727/151‑1 (MQ=255)
tGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTc < 1:4653973/151‑1 (MQ=255)
ccACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTccc < 2:3074885/151‑1 (MQ=255)
ccACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTccc < 2:4549556/151‑1 (MQ=255)
gACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGc < 2:7025128/151‑1 (MQ=255)
ggTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgc < 1:77436/151‑1 (MQ=255)
ggTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgc < 2:9352576/151‑1 (MQ=255)
gtgtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTgcg > 2:8541836/1‑151 (MQ=255)
gtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCCTCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCt < 1:4923392/151‑1 (MQ=255)
gtCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCt < 1:5304510/151‑1 (MQ=255)
tCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTg < 2:7885236/151‑1 (MQ=255)
ggTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGc > 1:9743568/1‑151 (MQ=255)
ggTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCAGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGc > 2:3714844/1‑151 (MQ=255)
ccggccgCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCAcc > 1:10320376/1‑151 (MQ=255)
ggccgCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCtt > 1:694106/1‑151 (MQ=255)
ggccgCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCtt < 1:8294594/151‑1 (MQ=255)
gccTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCtt > 1:7190779/1‑151 (MQ=255)
ccTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTg < 1:4280436/151‑1 (MQ=255)
cTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGc > 2:5468062/1‑151 (MQ=255)
cTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGc > 1:11185272/1‑151 (MQ=255)
tGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGcc > 1:2406103/1‑151 (MQ=255)
ggCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCa < 1:10974101/151‑1 (MQ=255)
gctgcgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAg > 2:10354739/1‑151 (MQ=255)
ctgcgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGc > 2:1013731/1‑151 (MQ=255)
cgctgcTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTc < 1:8725544/151‑1 (MQ=255)
gctgctCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCg > 2:2796067/1‑151 (MQ=255)
ctgctCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCgg > 1:10795470/1‑151 (MQ=255)
gctCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAg < 2:6858912/151‑1 (MQ=255)
tCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGc < 1:6553286/151‑1 (MQ=255)
gttgttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGccc < 1:8481864/151‑1 (MQ=255)
gttgttCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGccc > 2:8044019/1‑151 (MQ=255)
tCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCCTCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGc < 1:7984023/151‑1 (MQ=255)
tCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGc > 1:5773083/1‑151 (MQ=255)
tGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCgg < 2:3885889/151‑1 (MQ=255)
agctcgctcATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCACCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCgg < 1:7661248/150‑1 (MQ=255)
gctcgctcATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGa > 2:5328930/1‑151 (MQ=255)
gctcgctcATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGa > 2:2923156/1‑151 (MQ=255)
ctcATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGtt > 1:1987569/1‑151 (MQ=255)
aTCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCtt > 2:2262444/1‑151 (MQ=255)
gTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAg > 1:7870476/1‑151 (MQ=255)
gTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAg < 1:10022561/151‑1 (MQ=255)
tgtcctctcctcATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGt < 2:7256393/149‑1 (MQ=255)
tcctctcctcATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTg > 2:4753872/1‑151 (MQ=255)
cctctcctcATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTgc < 2:8247406/151‑1 (MQ=255)
ctctcctcATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTgcc < 1:1453848/151‑1 (MQ=255)
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GTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGT > SRR18135096.3292284/1‑151 (MQ=60)
TGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTC > SRR18135096.9775870/1‑151 (MQ=60)
TGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTC < SRR18135096.4675413/151‑1 (MQ=60)
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CTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTT > SRR18135096.1995067/1‑151 (MQ=60)
CTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGAGCGTT > SRR18135096.7836299/1‑151 (MQ=60)
TCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTC < SRR18135096.9185038/151‑1 (MQ=60)
TCATCGGTGTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTC < SRR18135096.9185039/151‑1 (MQ=60)
TCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTG > SRR18135096.909927/1‑151 (MQ=60)
GGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAA > SRR18135096.10151744/1‑151 (MQ=60)
GTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAG > SRR18135096.7905062/1‑151 (MQ=60)
GTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAG > SRR18135096.7905083/1‑151 (MQ=60)
GTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAG > SRR18135096.8337931/1‑151 (MQ=60)
GTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAG < SRR18135096.10065671/151‑1 (MQ=60)
GTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAG > SRR18135096.3893293/1‑151 (MQ=60)
TTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGT > SRR18135096.202719/1‑151 (MQ=60)
CTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCC < SRR18135096.1460700/151‑1 (MQ=60)
TCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCG > SRR18135096.7147690/1‑151 (MQ=60)
TCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCG < SRR18135096.215951/151‑1 (MQ=60)
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CCTCATCCTGTGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCG < SRR18135096.904342/151‑1 (MQ=60)
CTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGC > SRR18135096.11469428/1‑151 (MQ=60)
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ATCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCATTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGG > SRR18135096.7742328/1‑151 (MQ=60)
TCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGC < SRR18135096.8655344/151‑1 (MQ=60)
TCCTGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGC > SRR18135096.7191086/1‑151 (MQ=60)
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TGGGCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTG < SRR18135096.4210645/151‑1 (MQ=60)
GCATGAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCC > SRR18135096.387752/1‑151 (MQ=60)
ATGAACATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGC < SRR18135096.5537752/151‑1 (MQ=60)
GAAAATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCC > SRR18135096.4301661/1‑151 (MQ=60)
AATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTC > SRR18135096.10792354/1‑151 (MQ=60)
AATGGGGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTC > SRR18135096.2592302/1‑151 (MQ=60)
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GGCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGCC > SRR18135096.1332602/1‑151 (MQ=60)
GCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGCCG > SRR18135096.11587363/1‑151 (MQ=60)
GCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGCCG > SRR18135096.11162644/1‑151 (MQ=60)
GCGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGCCG > SRR18135096.1674684/1‑151 (MQ=60)
|
GGTGGCGTCCTCGCGATAGGCCTCCAGCTGTTCCAGCTTGGCGTTGCTGTTGCCACGGTCGACGGTGTCGGTGCCGGCCGCCTGGCTGCGCTGCTCGTTGTTCTGCTCGCTCATCGGTTTCCTCTCCTCATCCTGGGCATGAAAATGGGGGGGATGCCTCCCTGCTCCGCCCCATTCACTTCACTGCGCGGTTATCAGTTCCCGCCGTGGCTGCGCTGGCCACCTTTCTTGCCAGCCTCGGAGGCCCGCTGCGGATCGTTCTTGAAGTTGCCGCCGCTGGCCTGGCCGCCCTTCTTGCCG > NC_008463/3281327‑3281626
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
