Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
275 |
500.0 |
21685688 |
99.2% |
21512202 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,279,247 |
G→A |
intergenic (‑33/+64) |
PA14_RS31655 ← / ← katE |
hypothetical protein/catalase HPII |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,279,247 | 0 | G | A | 99.3%
| 2251.5
/ NA
| 545 | intergenic (‑33/+64) | PA14_RS31655/katE | hypothetical protein/catalase HPII |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (274/267); minor base C (2/2); total (276/269) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 546 total aligned reads displayed.
CTGTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCGCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAT > NC_008463/3279099‑3279393
|
gTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCt > 2:632240/1‑151 (MQ=255)
aGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCttt < 1:8763393/151‑1 (MQ=255)
gcgcAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTc < 1:10558308/151‑1 (MQ=255)
cACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCtgtg < 1:4835875/151‑1 (MQ=255)
aCCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGa > 2:8815570/1‑151 (MQ=255)
aCCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGa > 1:4052671/1‑151 (MQ=255)
cGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGAcc > 2:9210942/1‑151 (MQ=255)
gCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACcg > 2:8108183/1‑151 (MQ=255)
caggcagCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGGGACCgacgaga < 1:184365/151‑1 (MQ=255)
cagCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAgacgac > 2:2577088/1‑151 (MQ=255)
agCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGacgacg > 1:10042670/1‑151 (MQ=255)
agCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGacgacg < 1:7065333/151‑1 (MQ=255)
agCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGacgacg > 2:1017293/1‑151 (MQ=255)
agCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGacgacg > 2:6636504/1‑151 (MQ=255)
cgcTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACggg < 1:10011810/151‑1 (MQ=255)
cgcTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACggg < 1:4567907/151‑1 (MQ=255)
cTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGaa > 2:344459/1‑151 (MQ=255)
cTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGaa < 1:3553784/151‑1 (MQ=255)
tCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAg > 1:6611648/1‑151 (MQ=255)
cGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAgg < 2:330125/151‑1 (MQ=255)
gCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGt < 1:6872017/151‑1 (MQ=255)
cAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTg > 2:7331523/1‑151 (MQ=255)
cAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTg < 1:1464717/151‑1 (MQ=255)
cAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTg > 2:8276065/1‑151 (MQ=255)
aGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGc > 1:8989449/1‑151 (MQ=255)
tCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGa > 1:10620048/1‑151 (MQ=255)
tCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGa > 2:8408545/1‑151 (MQ=255)
gAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGACGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCAGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGACGGTGCGATc > 2:7984838/1‑151 (MQ=255)
ggTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGa > 1:4421737/1‑151 (MQ=255)
gTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGAt > 1:67057/1‑151 (MQ=255)
tttCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGAtt < 2:8601785/151‑1 (MQ=255)
ttCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCTACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTc > 1:7867894/1‑151 (MQ=255)
cTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGcc < 2:6437206/151‑1 (MQ=255)
tCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCa < 1:869880/151‑1 (MQ=255)
tCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCa > 1:6155338/1‑151 (MQ=255)
aCCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgc > 1:3651917/1‑151 (MQ=255)
aCCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgc > 2:7771023/1‑151 (MQ=255)
cccAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgcg < 1:64967/151‑1 (MQ=255)
ccgccGCACCGCCGGGTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGAACAGGCAACGCAAGGACATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGGGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgcggc < 2:5480283/147‑1 (MQ=255)
cAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgcggc < 1:8212177/151‑1 (MQ=255)
aGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGGGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgcggcg < 1:5076204/151‑1 (MQ=255)
gTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGgcgc > 2:9336842/1‑151 (MQ=255)
tCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGct < 1:7397590/151‑1 (MQ=255)
aaCGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGctcctc > 2:807210/1‑151 (MQ=255)
aCGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCa < 1:970834/151‑1 (MQ=255)
ccGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGc < 1:4183194/151‑1 (MQ=255)
ccGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCAAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGc < 2:1179923/151‑1 (MQ=255)
ggTTGCCGGCACCAGTCGCTACCGCCGAACAGGCAACGCAAGCTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCACGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGCCCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCgg < 2:4194958/151‑1 (MQ=255)
ggTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCgg > 2:1688530/1‑151 (MQ=255)
gTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCggg < 1:3260828/151‑1 (MQ=255)
ccGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATc < 2:10403722/151‑1 (MQ=255)
ggCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGc < 1:2150939/151‑1 (MQ=255)
aCCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCtt > 1:9889392/1‑151 (MQ=255)
ccAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTg < 2:9819876/151‑1 (MQ=255)
cAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTGTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTgg > 2:2413224/1‑151 (MQ=255)
gTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTc < 1:2504634/151‑1 (MQ=255)
gTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTc > 1:754988/1‑151 (MQ=255)
gTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTc < 1:2998841/151‑1 (MQ=255)
tCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcg < 1:1200400/151‑1 (MQ=255)
tCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcg > 2:1861188/1‑151 (MQ=255)
tCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCAACCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcg < 1:7688509/151‑1 (MQ=255)
cGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcgc < 1:5742363/151‑1 (MQ=255)
gCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcgcc > 2:279928/1‑151 (MQ=255)
cAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcgccg > 2:2248957/1‑151 (MQ=255)
cAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcgccg > 2:6854201/1‑151 (MQ=255)
ccgccgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCt < 1:10709325/151‑1 (MQ=255)
cgccgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCCGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTc < 2:4841993/151‑1 (MQ=255)
cgccgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTc < 2:4262818/151‑1 (MQ=255)
ccgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGGGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTcgc < 2:4663428/151‑1 (MQ=255)
cgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTcgcg > 2:5911158/1‑151 (MQ=255)
cAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGc < 1:10220477/151‑1 (MQ=255)
cAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGc < 1:4248628/151‑1 (MQ=255)
aaCGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGAt > 1:9969217/1‑151 (MQ=255)
aaCGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGAt < 1:6340009/151‑1 (MQ=255)
gCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCg > 1:1717245/1‑151 (MQ=255)
aaGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGt < 1:5446672/151‑1 (MQ=255)
aGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGtg < 1:8475512/151‑1 (MQ=255)
ggTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGACGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCTGGCGGGGCTCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGtgc > 2:9476177/1‑151 (MQ=255)
aTCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCa > 2:386843/1‑151 (MQ=255)
aTCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCa > 1:9355020/1‑151 (MQ=255)
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ccGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATc > 2:5641566/1‑151 (MQ=255)
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ACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATC > SRR18135068.5153513/1‑151 (MQ=60)
ACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATC < SRR18135068.8372744/151‑1 (MQ=60)
ACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATC < SRR18135068.7550860/151‑1 (MQ=60)
GCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCG > SRR18135068.1725916/1‑151 (MQ=60)
AAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGT < SRR18135068.6814120/151‑1 (MQ=60)
AGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTG < SRR18135068.8602590/151‑1 (MQ=60)
AGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTG < SRR18135068.8515794/151‑1 (MQ=60)
GGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGC > SRR18135068.365447/1‑151 (MQ=60)
TCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTG < SRR18135068.5269281/151‑1 (MQ=60)
CATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGC > SRR18135068.6569730/1‑151 (MQ=60)
CATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGC > SRR18135068.7789090/1‑151 (MQ=60)
ATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCA > SRR18135068.9399068/1‑151 (MQ=60)
TCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGCCGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCAT < SRR18135068.603370/151‑1 (MQ=60)
CCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATC < SRR18135068.6446374/151‑1 (MQ=60)
CCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATC < SRR18135068.6058494/151‑1 (MQ=60)
CGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCA < SRR18135068.10693152/151‑1 (MQ=60)
GGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAT < SRR18135068.4442897/151‑1 (MQ=60)
GGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAT < SRR18135068.635629/151‑1 (MQ=60)
GGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAT > SRR18135068.2193730/1‑151 (MQ=60)
GTCCTCCCGCCGACTCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCGGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATG < SRR18135068.9836842/151‑1 (MQ=60)
GTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATG < SRR18135068.2655466/151‑1 (MQ=60)
GTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATG > SRR18135068.6140855/1‑151 (MQ=60)
TCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGC < SRR18135068.3197801/151‑1 (MQ=60)
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AATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGC > SRR18135068.7196009/1‑151 (MQ=60)
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CACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACATCGG > SRR18135068.3172924/1‑151 (MQ=60)
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GCTGTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCGCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACATCGGT > NC_008463/3279098‑3279397
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |