Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
274 |
511.2 |
22276341 |
99.2% |
22098130 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,279,247 |
G→A |
intergenic (‑33/+64) |
PA14_RS31655 ← / ← katE |
hypothetical protein/catalase HPII |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,279,247 | 0 | G | A | 99.3%
| 2187.6
/ NA
| 543 | intergenic (‑33/+64) | PA14_RS31655/katE | hypothetical protein/catalase HPII |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (282/257); minor base C (2/2); total (284/259) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 557 total aligned reads displayed.
TGTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCGCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAT > NC_008463/3279100‑3279393
|
gTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCAccc > 1:983004/1‑150 (MQ=255)
gcgcAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCttt > 2:4785789/1‑150 (MQ=255)
gcgcAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCttt < 2:10697375/150‑1 (MQ=255)
cgcAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTc < 1:1357898/150‑1 (MQ=255)
gcAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTcc > 2:5949095/1‑150 (MQ=255)
aGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAg > 1:10614651/1‑150 (MQ=255)
gggCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGc < 2:1651250/150‑1 (MQ=255)
gggCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGc < 2:8775811/150‑1 (MQ=255)
ggCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCt > 1:7533749/1‑150 (MQ=255)
cGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGAc < 2:1706317/150‑1 (MQ=255)
cAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACcg > 1:6972995/1‑150 (MQ=255)
cagCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCgacgagacga > 1:8032184/1‑150 (MQ=255)
cagCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCgacgagacga < 1:10176467/150‑1 (MQ=255)
cagCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCgacgagacga < 1:47972/150‑1 (MQ=255)
cagCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCgacgagacga < 1:9450659/150‑1 (MQ=255)
agCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAgacgac < 1:6809327/150‑1 (MQ=255)
cgcTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCACGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGACTCGCTCGGCCAGCCACCCTGTCGAGCTGTGACCGACGAGACGACgg > 2:9485858/1‑150 (MQ=255)
gcTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACggg > 1:8540368/1‑150 (MQ=255)
cTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGa > 2:8985855/1‑150 (MQ=255)
gCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAgg > 2:10956732/1‑150 (MQ=255)
ccAGTCGAAGGGTTCCACCCCCCGACGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCACGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAgg < 2:5211931/149‑1 (MQ=255)
gTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGACGGTGc > 1:9571828/1‑150 (MQ=255)
gTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGACGGTGc > 2:4607346/1‑150 (MQ=255)
gTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGc > 1:3474823/1‑150 (MQ=255)
tCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCg > 1:10487217/1‑150 (MQ=255)
tCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCg < 1:1724974/150‑1 (MQ=255)
gAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGAt > 1:4998965/1‑150 (MQ=255)
gAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGAt < 1:1914188/150‑1 (MQ=255)
aaGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATc > 2:5597059/1‑150 (MQ=255)
aGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCg > 1:9296562/1‑150 (MQ=255)
ttCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGAtt < 1:2118708/150‑1 (MQ=255)
ccTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGGCGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCg > 2:5343903/1‑150 (MQ=255)
ccTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCg > 2:6260931/1‑150 (MQ=255)
tCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGcc < 1:9938869/150‑1 (MQ=255)
aCCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAg < 1:8271190/150‑1 (MQ=255)
cAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgcgg < 1:5454602/150‑1 (MQ=255)
aGTCGCACCGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGGCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCCGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgcggc < 2:4048011/150‑1 (MQ=255)
aGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGCCGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAgcggc > 2:1556860/1‑150 (MQ=255)
tCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGgcgc > 1:2670277/1‑150 (MQ=255)
cGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCCCCGATCAGGCAACGCAAGGACATCCGGGTCCTCCCGCCGAACCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGCCGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGct < 1:3786466/150‑1 (MQ=255)
gCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCCGGCACCGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGAGCGGATTCGCCAGCGGCGctc > 2:8423482/1‑150 (MQ=255)
cGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCa < 2:367048/150‑1 (MQ=255)
gCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAg < 2:3364151/150‑1 (MQ=255)
gCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGAGTCGCCAGCGGCGCTCCTCAg > 2:7362521/1‑150 (MQ=255)
ccGGTTGCCGGCACCCGTCGCAACCGCCGCTCAGGCAACGCATGGTCATCCGGGGCCGCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTGCCAGCTGGGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAgg < 2:9137227/150‑1 (MQ=255)
ccGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCTGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAgg > 2:2123450/1‑150 (MQ=255)
cGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGc < 1:770280/150‑1 (MQ=255)
cGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGc > 1:1423989/1‑150 (MQ=255)
cGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATc > 1:10916257/1‑150 (MQ=255)
gCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGc > 1:3886090/1‑150 (MQ=255)
ccAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCtt < 2:2915597/150‑1 (MQ=255)
gTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGt < 2:147658/150‑1 (MQ=255)
cGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcg < 1:4189890/150‑1 (MQ=255)
cAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcgcc < 1:5989770/150‑1 (MQ=255)
cAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcgcc > 2:4921503/1‑150 (MQ=255)
aaCCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcgccg > 1:7611721/1‑150 (MQ=255)
aCCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTcgccgc > 2:1036065/1‑150 (MQ=255)
ccgccgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCgccgcc > 2:2030522/1‑150 (MQ=255)
cgccgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCt < 1:1070611/150‑1 (MQ=255)
cgccgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCt < 2:2641779/150‑1 (MQ=255)
gccgATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTc < 1:11082566/150‑1 (MQ=255)
aTCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCgcgc > 2:7738545/1‑150 (MQ=255)
cAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGACCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTg > 2:9866803/1‑150 (MQ=255)
aGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCCGCTGGGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGc < 2:4221620/150‑1 (MQ=255)
aGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGc < 1:7366116/150‑1 (MQ=255)
ggCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGcc < 1:5249643/150‑1 (MQ=255)
aaCGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCGCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGa < 1:2969338/150‑1 (MQ=255)
aCGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGAt > 2:6346681/1‑150 (MQ=255)
cGCATGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCGGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATc < 2:8258066/150‑1 (MQ=255)
cGCACGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATc < 2:3939228/150‑1 (MQ=255)
cGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATc < 2:6865436/150‑1 (MQ=255)
cAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCg > 1:4531730/1‑150 (MQ=255)
cAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCg > 1:6493709/1‑150 (MQ=255)
aaGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCgg < 2:8176196/150‑1 (MQ=255)
aGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGt > 1:8856634/1‑150 (MQ=255)
aTCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGtgctgc > 2:3524866/1‑150 (MQ=255)
tCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCa > 1:1580375/1‑150 (MQ=255)
tCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCa > 2:8637291/1‑150 (MQ=255)
gggTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCa < 1:3258261/150‑1 (MQ=255)
gTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAt < 1:2350856/150‑1 (MQ=255)
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ATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCA > SRR18135098.2205583/1‑151 (MQ=60)
ATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCA > SRR18135098.1588155/1‑151 (MQ=60)
ATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCA < SRR18135098.9263202/151‑1 (MQ=60)
ATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCA > SRR18135098.1588404/1‑151 (MQ=60)
TCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCAT < SRR18135098.2053259/151‑1 (MQ=60)
CCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATC > SRR18135098.8320982/1‑151 (MQ=60)
CCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATC > SRR18135098.8321425/1‑151 (MQ=60)
CGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCA > SRR18135098.4613504/1‑151 (MQ=60)
GGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGTAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGTTCCGGTGCTGCATCAA < SRR18135098.3280567/151‑1 (MQ=60)
GGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAT < SRR18135098.5707467/151‑1 (MQ=60)
GGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAT > SRR18135098.4095999/1‑151 (MQ=60)
GGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAT > SRR18135098.4095953/1‑151 (MQ=60)
GGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAAT < SRR18135098.3078560/151‑1 (MQ=60)
GTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATG < SRR18135098.2362090/151‑1 (MQ=60)
GTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATG < SRR18135098.6931128/151‑1 (MQ=60)
TCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGC > SRR18135098.3739045/1‑151 (MQ=60)
TCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGC < SRR18135098.4791915/151‑1 (MQ=60)
CCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCC > SRR18135098.8996263/1‑151 (MQ=60)
CTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCT > SRR18135098.8541294/1‑151 (MQ=60)
CTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCT < SRR18135098.8819707/151‑1 (MQ=60)
TCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTG < SRR18135098.6985711/151‑1 (MQ=60)
CCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGG > SRR18135098.9019837/1‑151 (MQ=60)
GCCGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGC > SRR18135098.8594363/1‑151 (MQ=60)
CGAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAG > SRR18135098.6730527/1‑151 (MQ=60)
GAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGG > SRR18135098.5403344/1‑151 (MQ=60)
GAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGG > SRR18135098.5403237/1‑151 (MQ=60)
GAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGG < SRR18135098.1078687/151‑1 (MQ=60)
GAATCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGG > SRR18135098.5453232/1‑151 (MQ=60)
TCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCCGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCG < SRR18135098.9953608/151‑1 (MQ=60)
TCGCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCG < SRR18135098.10871498/151‑1 (MQ=60)
GCTCGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGCCCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGG < SRR18135098.3518145/151‑1 (MQ=60)
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CGGCCAGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAA > SRR18135098.10672098/1‑151 (MQ=60)
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AGCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACAT < SRR18135098.6164924/151‑1 (MQ=60)
GCCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACATC < SRR18135098.7300024/151‑1 (MQ=60)
CCACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACATCG > SRR18135098.641389/1‑151 (MQ=60)
CACCCTTTCCAGCTGTGACCGTCGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACATCGG > SRR18135098.8160045/1‑151 (MQ=60)
ACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACATCGGT < SRR18135098.9676035/151‑1 (MQ=60)
ACCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACATCGGT > SRR18135098.6548200/1‑151 (MQ=60)
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CGCTGTAGCGCAGGGCACCGCAACGCAGGCAGCGCTCGCAGTCGAAGGTTTCCTCACCCAGTCGCAACGCCGGTTGCCGGCACCAGTCGCAACCGCCGATCAGGCAACGCAAGGTCATCCGGGTCCTCCCGCCGAATCGCTCGGCCAGCCGCCCTTTCCAGCTGTGACCGACGAGACGACGGGAAGGTGCGATCGGATTCGCCAGCGGCGCTCCTCAGGCGGGGATCGCCTTGGTCGCCGCCTCGCGCTGCCAGATCCGGTGCTGCATCAATGCCTGGCGCAGGCCGGGGAAGACATCGGT > NC_008463/3279097‑3279397
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
