Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F1 I1 R1
|
256 |
520.0 |
22514234 |
99.3% |
22356634 |
151.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,515,863 |
T→C |
intergenic (+617/+267) |
PA14_RS16005 → / ← PA14_RS16010 |
AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,515,863 | 0 | T | C | 100.0%
| 1140.2
/ NA
| 306 | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005/PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (125/181); total (125/181) |
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
GTATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCTTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAA > NC_008463/3515715‑3516010
|
aGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCAAACCCCa > 2:286737/1‑151 (MQ=255)
gCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCaa < 1:9702178/151‑1 (MQ=255)
ccccTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCTCACCCCAAc > 2:383524/1‑151 (MQ=255)
ccccTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCAGACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAAc < 2:3074528/151‑1 (MQ=255)
tccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCctc < 1:1442404/151‑1 (MQ=255)
tccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTGTGGAATGTGGTGTTGGGCCTCACCCCAAcccac > 1:8326041/1‑149 (MQ=255)
aaGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCg < 2:8028026/151‑1 (MQ=255)
ccATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCAc < 2:7682980/151‑1 (MQ=255)
cATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCAcg < 1:5233334/151‑1 (MQ=255)
cATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCAcg < 2:7283510/151‑1 (MQ=255)
cATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTGGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCCCCCCAACCccc‑gcccgcccg > 1:7053963/1‑151 (MQ=255)
cATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTAGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAAACCTC‑TCCCGCAcc > 2:8336239/1‑150 (MQ=255)
aGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCgg < 1:1670803/151‑1 (MQ=255)
gCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TACCGCACGCggg > 2:469848/1‑151 (MQ=255)
gCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCCCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCggg < 2:1782461/151‑1 (MQ=255)
ccTTCCCCAGACCTGAACGGCACACCGATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCAGCGACCCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGgag < 2:5247468/151‑1 (MQ=255)
cccATACCTGCACGGCCCACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGAGCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCCCACCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAgtgg < 2:2270659/151‑1 (MQ=255)
cccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCAC‑ACCCGCAAGCCGGAGAgggg > 2:5943991/1‑151 (MQ=255)
aTACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGcc < 1:4411097/151‑1 (MQ=255)
cccacaccGGCACACCTAGTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCAGCTAACCCCCATAGCTGCGGCATGAGTGTCGCGGATCGGATTATGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCgg < 2:3313526/144‑1 (MQ=255)
ccTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGAGCGGTTTTTGGACTGTGGTGTTGGCCCGCAACCCAACCCTC‑TCCCGCCAGCGGGAGAGGGGGCCggg > 2:5061205/1‑151 (MQ=255)
cTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGc < 1:407589/151‑1 (MQ=255)
cTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGATTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGc < 1:8574805/151‑1 (MQ=255)
tGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCAAACCTC‑ACCCCCCCGCGGGGGGGGGGGGCggggg > 1:494796/1‑149 (MQ=255)
aaCGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCAC‑GACCGCACCCCGGAGAGGGGGGCGGGCGTg > 2:1255759/1‑151 (MQ=255)
cGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTGCCCGAAACCCCACCCAA‑ACCCCGCCCCGGGAGAGGGGGGGGGGCggggc > 1:2954842/1‑147 (MQ=255)
cGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTGTTTGGACTGTGGTGTTGGGCCGCAAACCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGGGGGGGGCGGGCGttac > 2:108907/1‑148 (MQ=255)
cacCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑ACCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCGtgtg > 2:5664201/1‑151 (MQ=255)
cacCAATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTtgtg < 1:5116610/151‑1 (MQ=255)
cTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGt < 2:10834511/151‑1 (MQ=255)
tATTGCCACCCTCAAAACCACAACATCCACCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGCGTGTCGAGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGATGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTc < 2:925384/151‑1 (MQ=255)
agtGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCg < 2:8702552/149‑1 (MQ=255)
aTTGCCACCCGCAAAACCACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCg < 1:689918/151‑1 (MQ=255)
cACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCAAACCCCAACCCAC‑TCCCGCACGCCGGCGAGGGGGGCGGGCGGGCCGGGGGGGGCGGgcgc > 2:3155591/1‑151 (MQ=255)
cACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCCCCCCCACCCGC‑TCCCGCCCGCCGGGGAGGGGGCCGGGCGTGCCGGGTGGGTCgcgggc > 2:7109469/1‑146 (MQ=255)
cACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAAACCTG‑TCCCGCGCGCGGGGGTGGGGGGCGGGGGGGCCTGGTGGGGCGTgcgc > 2:6861338/1‑151 (MQ=255)
aCCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGcc < 1:10731028/151‑1 (MQ=255)
cccGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCct < 1:3657443/151‑1 (MQ=255)
aaaaCCACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctcgctc < 1:8181764/151‑1 (MQ=255)
aaaaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGGGGGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCGCACCCCCACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGTGGGGGGGGGGGGTGGCGGGGGGGGCGGGGGCctggctc > 2:6901301/1‑151 (MQ=255)
aaaaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCCCACCCCAACCCGA‑TCCCGCCCCCGGGGGCGGGGGGCGGGCGTGCCGTGGGGGTGGAGCGCcacgcag > 1:4687766/1‑149 (MQ=255)
aaaCCACCACCTCCCCCGCTGCTACCCGCAAGAGCTGCGGCTTGAGGGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctcgctcg < 2:2524871/151‑1 (MQ=255)
aaaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCAAACCAC‑AACCCCCCCCCGGGGTGGGGGGCGGGCGGGGCCTGTGGGTCGAGCGccccccgcg > 1:5191212/1‑144 (MQ=255)
aaaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctcgctcg < 1:738625/151‑1 (MQ=255)
aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCgg < 1:6051474/151‑1 (MQ=255)
ccccaACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGgc < 2:9772785/148‑1 (MQ=255)
ccACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGgc < 1:7335251/151‑1 (MQ=255)
ccACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGgc < 1:10144994/151‑1 (MQ=255)
cacaACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCACCCCAACCCGC‑TACCGCCCCCGGGGGGGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGGGGAGCGCCACGCTCggggg > 1:8802463/1‑149 (MQ=255)
ccTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGcc < 1:6692099/151‑1 (MQ=255)
ccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGa < 2:1869477/151‑1 (MQ=255)
cccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGaa < 1:10510329/151‑1 (MQ=255)
ccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAAc < 1:1992433/151‑1 (MQ=255)
cGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGACTGTGGTGTTGGGCCGCCCCCCAACCCTA‑AACCCCCCGCGGGCGGAGGGGCCCGGGGTGGCGTGTGGGGCGCGCGCCCCGCGCGGGCGCCGCCGGGAACg > 1:6124778/1‑151 (MQ=255)
cGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCCACCCAC‑AACCGCACCCGGGAGAGGGGGGCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCGCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACg > 2:7870322/1‑151 (MQ=255)
ctgctAACCGCACGAGCTGCGGCGTGAGTGTCGCGGATCGGATTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGAt < 2:10983178/151‑1 (MQ=255)
tAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCTCACCCCAACCCACAACCCCCAC‑CGGGAGGGGGGGCCCGGCGTGCCCTTTTGGTGGATCGCCACGCGCGGGCGCAGCCAGGGACgcatgat > 1:7862239/1‑145 (MQ=255)
tAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGAACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCt < 1:11052583/151‑1 (MQ=255)
cGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAAACCTC‑AACCCCACGCCGGAGAGGGGGCCGGGCCTGCCATGTTGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCACCCAGGAACGAATTCAAccc > 2:7761331/1‑151 (MQ=255)
aaTAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCCCCCCAACACAC‑ACACCCACCCGGGGGAGGGGGGCCGGCGTGGCGTGTTGGGCGAGCGCCTCGCTCCGGCGCACCCAGGGACCATGTATAaccacc > 1:10842956/1‑151 (MQ=255)
tAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTcccc < 2:8851584/151‑1 (MQ=255)
aGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCt < 2:11215900/151‑1 (MQ=255)
aGCTGCGGCTTGAGTGACGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACTCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCt < 2:9523990/151‑1 (MQ=255)
gCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTa < 2:5843852/151‑1 (MQ=255)
gCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTa < 1:2854442/151‑1 (MQ=255)
cTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCCACCCTC‑TCCCCCACCCCGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCCTTTGGGTGGCGCGCCACCCACGGGCGCCGCCTGGGACCATGTCTAACCACCCCCAg > 1:1693918/1‑151 (MQ=255)
ggCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAAACCAC‑TCCCCCACGCGGGAGTGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTTGGTCGAGCGCCACCCGAGGGCGCAGGCGGGAACGATGGGTAACCGCCCCCAGGccc > 2:6755266/1‑151 (MQ=255)
cTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTCGGCCCCg < 2:9629887/151‑1 (MQ=255)
ttGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCgg < 1:314341/151‑1 (MQ=255)
tGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCggg < 2:6380849/151‑1 (MQ=255)
gAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGt < 1:8891714/151‑1 (MQ=255)
gAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGt < 1:2640327/151‑1 (MQ=255)
aGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCAACCCAA‑AACCGCCCGCGGGGGAGGGGGCCGGGGGTGCCTTGTTGGGGGAGCGCCACGCACGGGCGCCGCCCGGAACGATGTCTACCCACCCCGAGGCCCCgggga > 2:10469281/1‑149 (MQ=255)
aGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTa < 1:3807393/151‑1 (MQ=255)
gtgtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCCCACCCCAACCCAC‑ACCCCCCCCCGGGGGAGGGGGGCGGGCGGGGCGTGTGGGGCGAGCCCCACGCAACGGCGCACCCGGGGACCTAGTCTAACCACCCCCAAGCCCCCGGGAt > 1:9285787/1‑151 (MQ=255)
tgtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATc < 2:10180344/151‑1 (MQ=255)
gtCGCGGATCGGTTTTTGGATTGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGTGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCt < 1:1850828/151‑1 (MQ=255)
cgcgGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTgg < 2:2712689/151‑1 (MQ=255)
cgcgGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCCAACCAC‑TCCCGCACCCGGGATAGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGTAGAGCGCCGCGCTCGGGCGCAGCCAGGTACGATGTCTACCCACCCCAAGGGCCCCGGGATCTgg > 2:10636928/1‑151 (MQ=255)
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cgGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCAACCCAC‑AACCGCACGCGGGAGAGGGGGGCGGGGGTGGCTTGTGGGTCGGGCGCCTCCCGCGGGCGCAGCCGTGGACGATGTCTACCCACCCCGAGGCCCCCGGGATATGGaa > 2:6078983/1‑151 (MQ=255)
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AACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGG < SRR18135074.5247652/151‑1 (MQ=60)
AACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGG < SRR18135074.6075787/151‑1 (MQ=60)
CCACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGC < SRR18135074.3135408/151‑1 (MQ=60)
CCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGC < SRR18135074.10182783/151‑1 (MQ=60)
CCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGC < SRR18135074.7363613/151‑1 (MQ=60)
CCACAACCCCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGC < SRR18135074.9515974/151‑1 (MQ=60)
CACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCGCACCCCAACCCGCTACCGCCCCCGGGGGGGGGGGCCGGGCGTGCCGTGTGGGGGGAGCGCCACGCTCGGGGG > SRR18135074.8835810/1‑151 (MQ=60)
CACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCCCCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAG < SRR18135074.3185504/151‑1 (MQ=60)
CCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGC < SRR18135074.2324791/151‑1 (MQ=60)
ACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGC < SRR18135074.873161/151‑1 (MQ=60)
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CCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCC < SRR18135074.10396874/151‑1 (MQ=60)
CTCCCCCGCTGCTAACCGCAAGAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCT < SRR18135074.6880716/151‑1 (MQ=60)
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CCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGG < SRR18135074.5161774/151‑1 (MQ=60)
CCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCAACCCccaaccccaccccggggcggggggcgggcggggcgtgtgggtggagcgccccccgcgggcgccgcccgg > SRR18135074.10942121/1‑82 (MQ=60)
CCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAA < SRR18135074.10549382/151‑1 (MQ=60)
CCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAAC < SRR18135074.2000570/151‑1 (MQ=60)
CCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAAC < SRR18135074.3476849/151‑1 (MQ=60)
CGCTGCTAACCGCAAGAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCCCGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACG < SRR18135074.2931989/151‑1 (MQ=60)
TGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCAACCCACACCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGGCTTGTGGGTGGAGCGCCGCGCTCGGGGGCAGCCGGGAACGATG > SRR18135074.6336745/1‑151 (MQ=60)
TAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCTCACCCCAACCCacaacccccaccgggagggggggcccggcgtgcccttttggtggatcgccacgcgcgggcgcagccagggacgcatgat > SRR18135074.7892330/1‑72 (MQ=60)
TAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGAACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCT < SRR18135074.11093466/151‑1 (MQ=60)
TAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGAACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCT < SRR18135074.11094594/151‑1 (MQ=60)
TAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGAACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCT < SRR18135074.11094722/151‑1 (MQ=60)
GCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCT < SRR18135074.299081/151‑1 (MQ=60)
AATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCC < SRR18135074.3870000/151‑1 (MQ=60)
AGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCCCACCCCCACCCACACCCCCACCCGGGGGAGGGGGGCGGGCGTGCCCTGTGGGgcgtgcgccaagcgcgggcgccgccaggaacgaagtctaaccaacccc > SRR18135074.1770022/1‑103 (MQ=47)
GCTGCGGCTTGTGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCCACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA < SRR18135074.2865968/151‑1 (MQ=60)
GCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCAAACCTCTCCCGCACGCGGGGGAGGGGGgcggggggtgggtgtggggggagcggctagctagggcggtggcggggcgggtgtgttacaaaacctg > SRR18135074.1246547/1‑84 (MQ=60)
GCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA < SRR18135074.2866039/151‑1 (MQ=60)
CTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCACACCCCCACCCTCTCCCCCACCCCGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCctttgggtggcgcgccacccacgggcgccgcctgggaccatgtctaaccacccccag > SRR18135074.1700890/1‑94 (MQ=60)
CTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAG < SRR18135074.4058302/151‑1 (MQ=60)
TGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGGCCGCACCCCAACCCTCacccccccccgggggttgggggcgggcgtggctggtgggtggggcgcccaggacgggcgccgccaggctcgattgaataacaacccaagg > SRR18135074.3049246/1‑61 (MQ=60)
TGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGG < SRR18135074.7553258/151‑1 (MQ=60)
TGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGG < SRR18135074.1689580/151‑1 (MQ=60)
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CCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAAGC < SRR18135074.5275637/151‑1 (MQ=60)
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CCGTATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCTTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAAGC > NC_008463/3515713‑3516012
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |