Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
256 |
492.8 |
21425088 |
99.3% |
21275112 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_008463 |
3,515,863 |
T→C |
intergenic (+617/+267) |
PA14_RS16005 → / ← PA14_RS16010 |
AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_008463 | 3,515,863 | 0 | T | C | 99.6%
| 990.6
/ NA
| 266 | intergenic (+617/+267) | PA14_RS16005/PA14_RS16010 | AAA family ATPase/DUF4354 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (138/126); minor base A (1/0); total (140/126) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
TATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCTTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAA > NC_008463/3515716‑3516009
|
ataCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCa < 1:4131961/150‑1 (MQ=255)
ataCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCa < 2:5444341/150‑1 (MQ=255)
taCAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTG‑CCCTCAc > 1:3379305/1‑150 (MQ=255)
aGCCCCTCCCTACGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCAcccc < 1:6191980/150‑1 (MQ=255)
gCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTG‑CCCTCACCCCa > 2:3174103/1‑150 (MQ=255)
gCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTATTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCa > 2:386657/1‑150 (MQ=255)
ccccTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCTCACCCCaa > 2:184056/1‑150 (MQ=255)
ccctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAAc < 2:5482695/150‑1 (MQ=255)
ccctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCaaa > 1:5614066/1‑149 (MQ=255)
ctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACaacccaaccc > 1:9162744/1‑150 (MQ=255)
ctccctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAAccc > 2:2327183/1‑150 (MQ=255)
ctAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCtc‑tc < 1:10354059/150‑1 (MQ=255)
tAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACCCCCCAACCCAC‑Tcc > 2:7010899/1‑150 (MQ=255)
aTAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTG‑CCCACACCCCAAACCAC‑Acccccccg > 2:786792/1‑145 (MQ=255)
tAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCTCAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCACTAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCTCACCCCAACCCAC‑TCCCCCCcgc > 1:3532672/1‑150 (MQ=255)
cccTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTAACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCggg > 2:8642261/1‑150 (MQ=255)
ccTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGga < 1:10679095/150‑1 (MQ=255)
tCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACAACCCAACCCAC‑ACCCCCACGCggggggg > 2:5202757/1‑146 (MQ=255)
ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGCACCCCAACCCCC‑ACCCGCACGCgggggggg > 1:2074401/1‑145 (MQ=255)
ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACCCCCCAACCCAC‑ACCCGCCCGCGGGGGAgg > 1:8247193/1‑150 (MQ=255)
ccccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAgg < 2:9506935/150‑1 (MQ=255)
cccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACCCCCCAACCCAC‑TACCCCACGCGGGGGAggg > 2:278095/1‑150 (MQ=255)
cccATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACACCCCAAAACAC‑AACCGCACGCGGGTGAggg > 1:9764099/1‑150 (MQ=255)
aCCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCGCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAAGGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCTACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCg < 2:8799271/150‑1 (MQ=255)
ccTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCCCCCCCCAACCCGC‑TACCCCACCCGGGGGAGGGGGGCgg > 2:5242732/1‑150 (MQ=255)
tGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAACCCAC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGc > 2:1334481/1‑150 (MQ=255)
ggCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCGCACCCCCAACCTC‑TCCCCCACGCGGGCGAGGGGGGCGGGGGTggc > 1:95307/1‑148 (MQ=255)
gCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCAACCCCCCACCCAC‑ACCCCCACCCGGGGGAGGGGGCCggggggggcg > 1:6035374/1‑143 (MQ=255)
cacaCCTCTGGCCACCCGCAACACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCtt < 1:778969/150‑1 (MQ=255)
cacCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCAC‑TCCCCCACGCGGGGGTGGGGGCCGGGCGTGCCAtgt > 2:10158109/1‑150 (MQ=255)
acCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTtgtg < 1:3286091/150‑1 (MQ=255)
ccTATTGCCACCCGCACACCCCCACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAAGAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTgg < 1:6798476/150‑1 (MQ=255)
tATTGCCACCCGCAAAACCACACCCTCCCCCGCTGCTACCCGAATTAGCTGCGGCTTGTGTGTCGCGTTTCGGTTTTTGGATTGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGGGGTATTGGGGGCGGGGCGTGCCTTGTGGGt < 2:2685339/150‑1 (MQ=255)
cttGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTGTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCCTCCCTC‑GCCCGCACGCGGGGGCGGGGGCCGGGGGGGCCGGGTggggc > 2:197241/2‑148 (MQ=255)
agtGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCACCCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTc < 1:5578270/148‑1 (MQ=255)
aTTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCAACACCCAAACCC‑C‑ACCCCCACGCGGGAGAGGGGGGCCGGCGTGCCGTGTGGGTc > 2:10702755/1‑150 (MQ=255)
ttGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCg < 1:8120628/150‑1 (MQ=255)
gCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTA‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCgtg > 2:6859652/1‑148 (MQ=255)
aCCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAgcgc < 1:7458764/150‑1 (MQ=255)
cccGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCGCACCCCAACCCAC‑ACCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCATGTGGGTCGAGCGcc > 2:2219675/1‑150 (MQ=255)
ccGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCct < 2:3160220/150‑1 (MQ=255)
cGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCAC‑ACCCGCACGCGGGTGTGGGGGGCGGGCGTGCCATGTGGGTCGAGCGCctc > 1:7928827/1‑150 (MQ=255)
gCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCCACCCAC‑GCCCCCCCCCCGGCCAGGGGGGCGGGCGGGGCGTGGGGGTAGGGCGCctcg > 2:8309912/1‑150 (MQ=255)
aaCCCCAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctcgctcg < 1:2231980/150‑1 (MQ=255)
aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGCCCCCCAAACCACAACCCCCAC‑CGGGGGGGGGGGGCGGGCGGGGGGGGTGGGTGGGGCGCcccgcgcg > 1:3900178/1‑150 (MQ=255)
aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCCCACCCCAACCCAC‑ACCCCCACGCGGGGGAGGGGGGCGGGGGGGGCGTGTGGGGCGAGCGCcacgctcg > 1:10086398/1‑150 (MQ=255)
aaCCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCctcgctcg < 2:366470/150‑1 (MQ=255)
ccACACCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGATTGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCggg < 2:4489575/150‑1 (MQ=255)
ccACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCGC‑TACCGCACGCGGGTGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCGCggg > 2:7375522/1‑150 (MQ=255)
caACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGCACCCCCAACCTC‑TACCGCACGCCGGTGTGGGGGGCGGGCGTGGCGGGTGGGGCGAGCGCCGCGCGCGGgggc > 2:9811986/1‑150 (MQ=255)
caACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCCAACCCCAAACCAA‑ACCCCCGCCCGGGGGTGGGGGGGGGGGGTGGCGTGTTGGGGGGGCCCCACGCACGGgcgc > 1:8862919/1‑150 (MQ=255)
caACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCCCCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGgcgc < 1:2690406/150‑1 (MQ=255)
aaCCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCa < 1:6665572/150‑1 (MQ=255)
ccTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGCACCCCCAACCAC‑ACCCGCCCGCGGGAGAGGGGGGCGGGCGTGGCGTTTGGGGCGAGCGCCACGCGCGGGCGCAGc > 1:8502310/1‑150 (MQ=255)
cTCCCCCGCTGCTACCCGCAATAGATGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGTGCGCAGcc < 2:4970147/150‑1 (MQ=255)
cccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCGTGAGTGTCGCGGATCGGTTTGTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCGACCCCCAACCCTC‑TCCCCCCAGCGGGAGAGGGGGGCGGGCGGGGCGGGGGGGTCGGGCGCCTCGCTCGGGCCGAGccgg > 2:10424409/1‑148 (MQ=255)
ccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTgg < 1:3944883/150‑1 (MQ=255)
ccccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAAACCAC‑AACCCCACCCGGGGGAGGGGGCCGGGCGTGCCGAGTGGGTCGAGCGCCTCGCGCGGGCGCAGCCAgg > 2:8475309/1‑150 (MQ=255)
cccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGa < 2:4159472/150‑1 (MQ=255)
cccGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGa < 2:1641462/150‑1 (MQ=255)
ccGCTGCGAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGaa < 2:8072462/150‑1 (MQ=255)
ctgctAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACCCCCCAAAACGA‑ACCCGCACCCGGGCGAGGGGGGCGGGCGGGGCGGGTGGGTCGGGCGCCGCGCTCGGGCGCAACCGGGGACgg > 1:10417173/1‑149 (MQ=255)
tgctAACAGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGATTGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGAt < 1:7116710/150‑1 (MQ=255)
aaCCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCt < 2:8865181/150‑1 (MQ=255)
ccGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTAc < 1:4746368/150‑1 (MQ=255)
cAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCACACCCCCAACCAC‑AACCCCACCCCGGTGAGGGGGCCGGGCGTGCCCTTTGGGGGGAGCGCCCCCCGCCGGGGCACCCAGGGACCATTTCTAcccc > 1:8672563/1‑149 (MQ=255)
cAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCt < 2:5878125/150‑1 (MQ=255)
cagcgCTGCGGCCTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTTGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCCACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCGCGCTCGGGCGCAGCCGGGAACGATGACTACCCTc < 2:1787359/146‑1 (MQ=255)
aaTAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCAACCCAAACCAC‑TCCCCCAAGCGGGAGATGGGGCCGGGCGTTCCGTGTGGGTCGAGCGCCGAGCTAGGGCGCCGCCATGAACGATGTCTACCCTc > 2:7379000/1‑150 (MQ=255)
tAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTccc < 1:10241238/150‑1 (MQ=255)
tAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTccc < 2:1376480/150‑1 (MQ=255)
gCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCt < 1:8558634/150‑1 (MQ=255)
cGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCCCACCCCCACCCAA‑ACCCCCACCCGGGGGTGGGGGCCCGGCGTGCCGTGTGGGTCGAGCGCCACGCACGGGCGCAGCCGGGAACCATGTCAAACCACCCCAAGGc > 2:6284798/1‑150 (MQ=255)
cGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCAAACCCCAACCCAC‑ACCCCCAACCCGGTGAGGGGGGCGGGCGTGCCGTGTTGGTCGAGCGCCGCCCTCGGGCGCAGCCAGGAACGATTTCTACCCAccccaatgc > 2:2591216/1‑145 (MQ=255)
cTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑GCCTCACCCCAAACCTCAACCCCCCCACGGGTTGGGGGGCC‑GGCGTGGCATGTGGGTGGAGCGCCGCGCAAGGGCGCCGCCCGGGACAGTGTATAACCGCCCCAAGGcccc > 2:7276648/1‑150 (MQ=255)
ttGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCg < 2:9546680/150‑1 (MQ=255)
gtgtCGCGGCTCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTG‑CCCACACCCCAAACCTA‑AACCACCCCCGGGGGAGGGGGGCCGGCGTGGCATGGGGGGGGAGCGCCGCGCGAGGGCGCAGCCAGGAAAGATGTGTAACCACCCCAAGGCCCCCGGTa > 2:3002553/1‑150 (MQ=255)
gtgtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTCACCCCAACCCTC‑TCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTa < 2:901618/150‑1 (MQ=255)
gtCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCTAACCCCAACCCAC‑TCCCGCACCCGGGAGAGGGGGCCGGGGGTGCCGTGTGGGTAGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCGGGTACGATGTATACCCGCCCCAAGGCCCCCGGGATc > 2:6516566/1‑150 (MQ=255)
tCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGG‑CCCACACCCCAACCCGC‑TCCCCCACGCCGGGGAGGGGGGCCGGGGGGCCATGTGGGTGGAGCGCCACGCTAGGGCGCACACGGGAACCATGTCTAACCACCCCAAGGGCCCGGGTATCt > 2:4349592/1‑150 (MQ=255)
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CCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGA < SRR18135075.3961969/151‑1 (MQ=60)
CCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCACACCCCAAACCCCACCCCCACCCCGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCgtgttgggagagcgccacccaacggcgccgccagga > SRR18135075.7679804/1‑115 (MQ=60)
CGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACG < SRR18135075.5636782/151‑1 (MQ=60)
CGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACG < SRR18135075.7607758/151‑1 (MQ=60)
CTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGAT < SRR18135075.1016069/151‑1 (MQ=60)
TGCTAACAGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGATTGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATG < SRR18135075.7146116/151‑1 (MQ=60)
CCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACC < SRR18135075.3421142/151‑1 (MQ=60)
CCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACC < SRR18135075.4766955/151‑1 (MQ=60)
GCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTTGCCCACACCCCAACACAATCCCCCACGCGGGAGTGGGGGGCCGGCGTGGCTGGTTGGTCGCTGGCCACGCTCGGGCGCAGCCTGGAcaggtgtgaaaccg > SRR18135075.6512143/1‑137 (MQ=43)
TAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCC < SRR18135075.10282175/151‑1 (MQ=60)
GCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTA < SRR18135075.8593321/151‑1 (MQ=60)
CTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAG < SRR18135075.3626241/151‑1 (MQ=60)
CTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCG < SRR18135075.2137484/151‑1 (MQ=60)
TGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGG < SRR18135075.5004508/151‑1 (MQ=60)
CGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGG < SRR18135075.3943512/151‑1 (MQ=60)
GCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGA < SRR18135075.5975840/151‑1 (MQ=60)
ATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTC < SRR18135075.4264016/151‑1 (MQ=60)
ATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTC < SRR18135075.117186/151‑1 (MQ=60)
TCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCACCCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCG < SRR18135075.2895479/151‑1 (MQ=60)
GGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGC < SRR18135075.8259885/151‑1 (MQ=60)
TTTTTGGACTGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCC < SRR18135075.7628091/151‑1 (MQ=60)
TTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCC < SRR18135075.10437944/151‑1 (MQ=60)
TTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCA < SRR18135075.4458903/151‑1 (MQ=60)
TTGGAATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCA < SRR18135075.1754820/151‑1 (MQ=60)
AATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCC < SRR18135075.8531820/151‑1 (MQ=60)
ATGTGGTGTTGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCA < SRR18135075.8702465/151‑1 (MQ=60)
GTGTTGGCCCTCACCCCAACCCACTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGGATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAA > SRR18135075.7650224/1‑151 (MQ=60)
TTGGCCCTCACCCCCACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCA < SRR18135075.253937/151‑1 (MQ=60)
TGGCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAA < SRR18135075.6465557/151‑1 (MQ=60)
TGGCCCTCACCCCAACCCACTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAA < SRR18135075.4422369/151‑1 (MQ=60)
TGGCCCTCACCCCAACCCACTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCAAGGCCCCGGGTATCTGGAATTAGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAA > SRR18135075.2861356/1‑151 (MQ=60)
GCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGACTTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAA > SRR18135075.6154747/1‑151 (MQ=60)
GCCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAA > SRR18135075.5290641/1‑151 (MQ=60)
CCCTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAAG < SRR18135075.9904724/151‑1 (MQ=60)
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CCGTATACAGCCCCTCCCTAAGCCATAGCCCTTCCCCATACCTGAACGGCACACCTATTGCCACCCGCAAAACCACAACCTCCCCCGCTGCTAACCGCAATAGCTGCGGCTTGAGTGTCGCGGATCGGTTTTTGGAATGTGGTGTTGGCCTTCACCCCAACCCTCTCCCGCACGCGGGAGAGGGGGCCGGGCGTGCCTTGTGGGTCGAGCGCCTCGCTCGGGCGCAGCCTGGAACGATGTCTACCCTCCCCTAGGCCCCGGGTATCTGGAATTCGGCCCCCAGCCCAGGCAACCAAAAG > NC_008463/3515713‑3516011
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
