Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A2 F1 I1 R1
|
9 |
313.5 |
8459552 |
97.9% |
8281901 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
MC JC |
AP012306 |
3,395,364 |
Δ14 bp |
intergenic (+61/‑67) |
trxA → / → rhoL |
thioredoxin 1/rho operon leader peptide |
| | | seq id |
start |
end |
size |
←reads |
reads→ |
gene |
description |
* |
* |
÷ |
AP012306 |
3395364 |
3395377 |
14 |
363 [0] |
[0] 361 |
trxA/rhoL |
thioredoxin 1/rho operon leader peptide |
|
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
* |
? |
AP012306 |
= 3395363 | 0 (0.000) | 360 (1.160) |
196/298 |
0.1 |
100% |
intergenic (+60/‑81) |
trxA/rhoL |
thioredoxin 1/rho operon leader peptide |
? | AP012306 |
3395378 = |
0 (0.000) | intergenic (+75/‑66) |
trxA/rhoL |
thioredoxin 1/rho operon leader peptide |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGTTCAAAAACGGTGAAGTGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTC > AP012306/3395215‑3395510
|
TGTTCAAAAACGGTGAAGTGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTT < DRR075700.746510/150‑1 (MQ=60)
TGTTCAAAAACGGTGAAGTGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTT > DRR075700.1934392/1‑150 (MQ=60)
AAGTGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATAC > DRR075700.956272/1‑150 (MQ=60)
GTGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCT > DRR075700.2457636/1‑150 (MQ=60)
TGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTT < DRR075700.3479016/150‑1 (MQ=60)
GCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTAT < DRR075700.3494967/150‑1 (MQ=60)
GCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTAT < DRR075700.2470767/150‑1 (MQ=60)
CGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATT > DRR075700.2618174/1‑150 (MQ=60)
GGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTA < DRR075700.2896148/150‑1 (MQ=60)
GCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAA > DRR075700.1547381/1‑150 (MQ=60)
GCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAA < DRR075700.1606269/150‑1 (MQ=60)
ACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTT < DRR075700.3471163/150‑1 (MQ=60)
ACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTT < DRR075700.2900696/150‑1 (MQ=60)
CCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTT < DRR075700.2511658/150‑1 (MQ=60)
CCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTT < DRR075700.2313599/150‑1 (MQ=60)
CCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTT < DRR075700.4225950/150‑1 (MQ=60)
CAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTG > DRR075700.3579573/1‑150 (MQ=60)
AAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGA < DRR075700.1238243/150‑1 (MQ=60)
AGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAAT < DRR075700.514205/150‑1 (MQ=60)
AGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAAT < DRR075700.1990177/150‑1 (MQ=60)
AGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAAT < DRR075700.1066003/150‑1 (MQ=60)
GTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATC < DRR075700.2490759/150‑1 (MQ=60)
TGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCT < DRR075700.3833407/150‑1 (MQ=60)
TGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCT > DRR075700.2687701/1‑150 (MQ=60)
TGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCT > DRR075700.2629169/1‑150 (MQ=60)
TGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCT > DRR075700.1915534/1‑150 (MQ=60)
GGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTT < DRR075700.3876271/150‑1 (MQ=60)
GGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTG < DRR075700.2158604/150‑1 (MQ=60)
GTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGT > DRR075700.1865726/1‑150 (MQ=60)
GTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGT < DRR075700.2473354/150‑1 (MQ=60)
GTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGT > DRR075700.210725/1‑150 (MQ=60)
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GCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAA > DRR075700.1422366/1‑150 (MQ=60)
CACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAAT > DRR075700.1517087/1‑150 (MQ=60)
CACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAAT > DRR075700.298472/1‑150 (MQ=60)
CACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAAT > DRR075700.4201731/1‑150 (MQ=60)
CTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTT < DRR075700.4301608/150‑1 (MQ=60)
CTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTT < DRR075700.2439934/150‑1 (MQ=60)
CTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTT < DRR075700.3734342/150‑1 (MQ=60)
TGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTC > DRR075700.1358108/1‑150 (MQ=60)
TGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTC < DRR075700.1878005/150‑1 (MQ=60)
TGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTC < DRR075700.4107628/150‑1 (MQ=60)
GTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAGCCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCC < DRR075700.3210530/150‑1 (MQ=60)
TCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATCCCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCA < DRR075700.2097370/150‑1 (MQ=60)
TCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCA < DRR075700.3148139/150‑1 (MQ=60)
CTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAA < DRR075700.1816479/150‑1 (MQ=60)
CTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAA < DRR075700.2375425/150‑1 (MQ=60)
TAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAAC > DRR075700.1619591/1‑150 (MQ=60)
TAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAAC < DRR075700.451106/150‑1 (MQ=60)
AAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACG < DRR075700.906166/150‑1 (MQ=60)
AAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGC > DRR075700.341478/1‑150 (MQ=60)
AAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGC > DRR075700.4102311/1‑150 (MQ=60)
GGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTT < DRR075700.886325/150‑1 (MQ=60)
GTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTC < DRR075700.3233670/150‑1 (MQ=60)
AGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCG < DRR075700.4114643/150‑1 (MQ=60)
GTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGT < DRR075700.2268502/150‑1 (MQ=60)
GTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTCATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGT > DRR075700.874382/1‑150 (MQ=60)
TTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTT < DRR075700.3298965/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTT > DRR075700.1834280/1‑150 (MQ=60)
TTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTT < DRR075700.3156333/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTT < DRR075700.4226426/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTT < DRR075700.3887764/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGAGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTT < DRR075700.3631292/150‑1 (MQ=60)
GAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTT < DRR075700.3001218/150‑1 (MQ=60)
GAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTT < DRR075700.867102/150‑1 (MQ=60)
AAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTA < DRR075700.3279978/150‑1 (MQ=60)
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ACGCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTAC < DRR075700.4009730/150‑1 (MQ=60)
GCCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTC < DRR075700.2132554/150‑1 (MQ=60)
CCCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCT < DRR075700.615573/150‑1 (MQ=60)
CCGGCGTGAGTCATGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTC < DRR075700.1781660/150‑1 (MQ=60)
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TGTTCAAAAACGGTGAAGTGGCGGCAACCAAAGTGGGTGCACTGTCTAAAGGTCAGTTGAAAGAGTTCCTCGACGCTAACCTGGCGTAAGGGAATTTCATGTTCGGGTGCCCCGTCGCTAAAAACTGGACGCCCGGCGTGAGTCATGCTAACTTAGTGTTGACTTCGTATTAAACATACCTTATTAAGTTTGAATCTTGTAATTTCCAACGCTTCCCGTTTTATCTTAAATGCGAAGTGAACAGATTTCTGGCTCGTCACTCAATCCGTCTTGTCGTTTCAGTTCTGCGTACTCTC > AP012306/3395215‑3395510
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |