Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
149 |
26.7 |
2337422 |
87.5% |
2045244 |
105.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AM260479 |
342,407 |
T→C |
L180L (TTG→CTG) |
amtB → |
ammonium transporter |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AM260479 | 342,407 | 0 | T | C | 100.0%
| 141.0
/ NA
| 37 | L180L (TTG→CTG) | amtB | ammonium transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (18/19); total (18/19) |
TGGCTACAGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAATTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTTCT > AM260479/342283‑342530
|
tGGCTACAGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGc < 1:678556/130‑1 (MQ=255)
cTACAGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCg > 2:1096085/1‑134 (MQ=255)
gCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTc < 1:169379/134‑1 (MQ=255)
tttGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTc > 2:238276/1‑132 (MQ=255)
tttGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTc > 1:881351/1‑132 (MQ=255)
ttCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTgcgc > 2:282119/1‑134 (MQ=255)
cACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGcc < 1:815471/133‑1 (MQ=255)
gggCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCt < 2:881351/134‑1 (MQ=255)
aaCGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCAt > 2:32472/1‑134 (MQ=255)
aCGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCAt > 2:1118623/1‑133 (MQ=255)
cggcggCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGc < 1:1096085/133‑1 (MQ=255)
ccgGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGgcg > 2:1074121/1‑134 (MQ=255)
tCATGAAGGGGCGGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGcc > 1:366700/1‑134 (MQ=255)
gCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGaa < 1:887543/127‑1 (MQ=255)
gCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGaa > 2:887543/1‑127 (MQ=255)
cGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGcc < 1:7957/119‑1 (MQ=255)
cGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGcc > 2:7957/1‑119 (MQ=255)
cGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTtc > 1:396653/1‑134 (MQ=255)
cGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTtc < 2:366700/134‑1 (MQ=255)
gCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAAcg > 1:1089834/1‑116 (MQ=255)
gCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAAcg < 2:1089834/116‑1 (MQ=255)
ccgccACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGgtg > 1:70188/1‑134 (MQ=255)
ccTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCgtg < 1:282119/134‑1 (MQ=255)
gCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCtg < 1:238276/134‑1 (MQ=255)
gCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCtg < 2:218723/134‑1 (MQ=255)
cAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCtgt < 1:762090/134‑1 (MQ=255)
ggCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCt > 2:232174/1‑52 (MQ=255)
ggCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCt < 1:232174/52‑1 (MQ=255)
ggCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGtt < 2:978438/134‑1 (MQ=255)
gtggtggtgCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCaa > 1:919042/1‑95 (MQ=255)
gtggtggtgCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCaa < 2:919042/95‑1 (MQ=255)
ggtggtgCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCg < 2:253899/104‑1 (MQ=255)
ggtggtgCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCg > 1:253899/1‑104 (MQ=255)
ggtgCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCATCTGCGGCCTGatca < 2:237829/65‑1 (MQ=255)
ggtgCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCATCTGCGGCCTGatca > 1:237829/1‑65 (MQ=255)
ggtgCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTtct > 2:591232/1‑134 (MQ=255)
gtgCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTtct < 1:591232/133‑1 (MQ=255)
|
TGGCTACAGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAATTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTTCT > AM260479/342283‑342530
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGTGGCGCTGCTGTGGGCGATCTATGGCTACAGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAATTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTTCTCCTACATCCCGATGG > AM260479/342258‑342545
|
attagcgagtgtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAAC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1103:12388:78531/106‑1 (MQ=60)
ATCTATGGCTACAGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCC > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2201:16631:77128/1‑148 (MQ=60)
ATGGCTACAGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAG < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2106:16398:31158/146‑1 (MQ=60)
AGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1110:15747:14100/150‑1 (MQ=60)
TCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2115:20545:47771/149‑1 (MQ=60)
tcaagcagaagacggcatacgagattagcgagtgtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1115:2051:43059/82‑1 (MQ=60)
TCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2213:19692:76179/149‑1 (MQ=60)
GCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCGGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCG > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1207:8149:21576/1‑150 (MQ=60)
GTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1101:16559:52952/150‑1 (MQ=60)
TCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCT > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1206:12143:99179/1‑150 (MQ=60)
ATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCG < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2203:7089:16292/150‑1 (MQ=60)
GGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCtgt > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2213:3951:46682/1‑147 (MQ=60)
CGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGT > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1104:21076:47763/1‑150 (MQ=60)
ACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTctgtctcttatacacatctccgagc > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2204:9654:10503/1‑125 (MQ=60)
ACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1116:9291:89540/150‑1 (MQ=60)
CTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGctgtctcttatacac > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1114:5904:50522/1‑134 (MQ=60)
CAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCATCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacactcgctaatctcgtatgccg > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1115:4564:70674/1‑95 (MQ=60)
AGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTTCTCC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1115:2241:72707/150‑1 (MQ=60)
GCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTTCTCCT < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2110:18147:84920/150‑1 (MQ=60)
GGTGCCGGAACTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTTCTCCTACATCCCGATGG < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2103:7555:7575/149‑1 (MQ=60)
|
TGGTGGCGCTGCTGTGGGCGATCTATGGCTACAGCTTTGCCTTCACCGAGGGCAACGCCTTCTTCGGCGGCACCGACCGGCTCTTCATGAAGGGGCTGACGGTCGAGGCCGTGGCCGCCACCTTCAGCAAGGGCGTGGTGGTGCCGGAATTGGGCTACTTCGCCTTCCAGTGCGCCTTCGCCTGCATCACCTGCGGCCTGATCATCGGCGCCTTCGCCGAACGCGCCAAGTTCTCGGCCGTGCTGGTGTTCGTGGTGCTGTGGTTCACCTTCTCCTACATCCCGATGG > AM260479/342258‑342545
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |