Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
150 |
26.0 |
2053212 |
90.0% |
1847890 |
107.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AM260479 |
735,524 |
+G |
intergenic (‑409/+175) |
h16_A0685 ← / ← h16_A0686 |
hypothetical membrane spanning protein/Predictedpermease/CBS‑domain‑containing membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AM260479 | 735,521 | 1 | . | G | 100.0%
| 98.7
/ NA
| 30 | intergenic (‑406/+178) | h16_A0685/h16_A0686 | hypothetical membrane spanning protein/Predictedpermease/CBS‑domain‑containing membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (13/17); total (13/17) |
AGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTC > AM260479/735389‑735647
|
aGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑g > 2:854461/1‑134 (MQ=255)
aCAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑gggg > 2:706650/1‑132 (MQ=255)
aCAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑gggg > 1:729207/1‑132 (MQ=255)
cAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggca < 2:478999/134‑4 (MQ=255)
cAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggca < 1:706650/134‑4 (MQ=255)
gTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCt < 1:785493/134‑1 (MQ=255)
cAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 2:196846/134‑1 (MQ=255)
cAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 2:729207/134‑1 (MQ=255)
aaaaaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggcag > 1:195256/1‑119 (MQ=255)
aaaaaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑ggggcag < 2:195256/123‑5 (MQ=255)
aaaCGCGTCGCCTGAGGGGCTGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGc < 1:51161/127‑1 (MQ=255)
aaaCGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGc > 2:51161/1‑127 (MQ=255)
gCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGa < 2:376306/134‑1 (MQ=255)
ccggcAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCGGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCa < 1:329778/134‑1 (MQ=255)
gcAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 1:565989/108‑1 (MQ=255)
gcAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt > 2:565989/1‑108 (MQ=255)
tggtTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCt < 1:433793/81‑1 (MQ=255)
tggtTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCt > 2:433793/1‑81 (MQ=255)
aCGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCAt > 1:456747/1‑134 (MQ=255)
aCGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCAt > 1:446403/1‑134 (MQ=255)
ggtggtGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATcg < 2:446403/134‑1 (MQ=255)
gtggtgCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATcgc < 1:854461/134‑1 (MQ=255)
tGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 2:258483/67‑1 (MQ=255)
tGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt > 1:258483/1‑67 (MQ=255)
ccGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAtt > 1:86916/1‑71 (MQ=255)
ccGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAtt < 2:86916/71‑1 (MQ=255)
ccGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGgc > 2:888198/1‑134 (MQ=255)
ccGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGgc > 1:74532/1‑134 (MQ=255)
ggCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAtt > 2:513094/1‑69 (MQ=0)
ggCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAtt < 1:513094/69‑1 (MQ=0)
ggTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt > 2:412484/1‑53 (MQ=11)
ggTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGtt < 1:412484/53‑1 (MQ=11)
aCCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCctgctg > 1:880808/1‑86 (MQ=255)
aCCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCctgctg < 2:880808/86‑1 (MQ=255)
cccTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGc < 1:888198/134‑1 (MQ=255)
gCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGt > 1:325692/1‑134 (MQ=255)
tgAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTttcttc < 2:325692/134‑1 (MQ=255)
|
AGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTC > AM260479/735389‑735647
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTTTTGTCCGAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTCTGCGCTTGCGCGGGGCG > AM260479/735378‑735664
|
CTTTTTGTCCGAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGgc > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2115:6762:76773/1‑147 (MQ=60)
TGTCCGAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2113:16358:75401/149‑1 (MQ=60)
CGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTA > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1112:3937:52568/1‑149 (MQ=60)
ACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2112:19336:44524/150‑1 (MQ=60)
ACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGgcctgtctcttatacac > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1105:3723:89719/1‑132 (MQ=60)
gctccgtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAT < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1213:19413:45542/111‑1 (MQ=55)
AGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTAT < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2203:14206:33376/150‑1 (MQ=60)
GTAACC‑AAAAACGCGTCGCCTGAGGGGCTGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTG < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1102:4230:50903/150‑1 (MQ=60)
caagcagaagacggcatacgagatgtagctccgtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAAC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1210:15467:25199/83‑1 (MQ=31)
ataagagacaGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAAC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2105:4673:65226/139‑1 (MQ=60)
atacgagatgtagctccgtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1216:18758:94521/99‑1 (MQ=41)
GCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCGGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1207:17736:21161/150‑1 (MQ=60)
GTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATC > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1212:1925:75455/1‑150 (MQ=60)
GTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATC > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1212:10215:16018/1‑150 (MQ=60)
TCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggagctacatctcgtatgc > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1201:13496:42496/1‑97 (MQ=41)
GGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2209:21105:81941/150‑1 (MQ=60)
GTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggagctacatctcgt > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1107:17580:86797/1‑101 (MQ=45)
GTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCT > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1107:4195:8036/1‑150 (MQ=60)
GTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagac > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2207:18866:47862/1‑116 (MQ=59)
GTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTT > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1204:12458:92927/1‑150 (MQ=60)
ACCCTGCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTC < GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2207:10807:93028/150‑1 (MQ=60)
GCTACGCCATGTGAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacggagctacatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaaaaaaacggtg > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:1101:13332:16485/1‑63 (MQ=1)
GAGTCAGGGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTCTGCGCTTGCGCGGGGCG > GWNJ‑0478:712:GW2002102894th:2:2202:16958:40607/1‑150 (MQ=60)
|
CTTTTTGTCCGAGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCGTCGCCTGAGCGGCCGGCAATCAATTCCAGGGTGTTGGTGGTTCGCACGGTGGTGCTTGCCGTTCCGGCGTGGTTGCCCGTTCGACCCTGCTACGCCATGTGAGTCA‑GGGCAGTGCCTGCGTTAACCCACTATTGAACGATCCCCATGCAGGGCGCAGGCCGCCTGCTGCGAGCGGCATCGCGGGGACGCCTACGGCTGCTGCGCGGGCTCAAAGTGCATCGTCGGTTTCTTCTGCGCTTGCGCGGGGCG > AM260479/735378‑735664
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
