Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
6081 |
0.0 |
0 |
0.0% |
0 |
0.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAAAGGCAGGATGAAAAATTACGCCAAATAGGCAGGTTTTCAATATTAAAGAGTTAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACAGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTT‑AAAAAAAAAGTAATTTGACTGCACATGTAATTAGTTGTATCTTTTTTCTGTAATGGGGAAACGGCTAAAT > BK006934/381856‑382437
|
CAAAGGCAGGATGAAAAATTACGCCAAATAGGCAGGTTTTCAATATTAAAGAGTTAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCACAGTATAACTATACAAATATAATCAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTACTTGGGCCCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGACAACGGGCTTGGTTTGAC > SRR13385771.1880370/1‑301 (MQ=60)
GCAGGATGAAAAATTACGCCAAATAGGCAGGTTTTCAATATTAAAGAGTTAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCC > SRR13385771.693708/1‑301 (MQ=60)
GAAAAATTACGGCAAATAGGCAGGTTTTCAATATTAAAGAGTTAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCGTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATGGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAG < SRR13385771.529359/301‑1 (MQ=60)
TACGCCAAATAGGCAGGTTTTCAATATTAAAGAGTTAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCGCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTT < SRR13385771.1314190/300‑1 (MQ=60)
CGCCAAATAGGCAGGTTTTCAATATTAAAGAGTTAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCACAGTATACCTATAAAAATATAATCAAAAAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATATCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTAAAAACAACATTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAccacagattcattac > SRR13385771.1259932/1‑286 (MQ=60)
CAATATTAAAGAGTTAATGATGCAAAAGTTACAAAAAGTTAATGGTCAAAGGATAACTATAAAAATATAATAAAACAAGAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCATAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCTAATTCGAAGTGCTTACATCTCTGCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTTACACATTCCAATCGCAAAACAACCTTCTTGGTATTCTTAGCTTTCTTGTTGAAAACGTGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTAC < SRR13385771.1597909/300‑1 (MQ=60)
AGAGTTAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTATCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGA > SRR13385771.538028/1‑300 (MQ=60)
TAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAG < SRR13385771.1420053/300‑1 (MQ=60)
ACAAAAAGTTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTT < SRR13385771.1489451/301‑1 (MQ=60)
TTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTTGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCATGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCCCTTACCTTGAGCGAACAACGAAGCCTTAACAGCTTTGTATTGAT > SRR13385771.477571/1‑301 (MQ=60)
CAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTG > SRR13385771.1427665/1‑301 (MQ=60)
AACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCCTTGTATTGAGTAACCTggtgtggagg > SRR13385771.666810/1‑291 (MQ=60)
ATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCTAACAAGGAAGCCTTACCAGCTGTGTATTGAGTAACCTTGTGCTGAGTGTGCTTACGAC < SRR13385771.431675/300‑1 (MQ=60)
AAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCAAATTCGAAGTGCTTACATCTATTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTT > SRR13385771.1398958/1‑301 (MQ=60)
AATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCAACGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTTTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCC > SRR13385771.969817/1‑301 (MQ=60)
AACTCTCAGAATTGCAAAGCGTGACCCTTTTGCTTCGTGTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTGTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATGGAGTAACCGTGT > SRR13385771.878848/1‑259 (MQ=47)
CTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTCACCCTGAGCGAACAAGGAAGCCTCACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTT > SRR13385771.1532233/1‑301 (MQ=44)
CAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACGACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTG < SRR13385771.294082/300‑1 (MQ=41)
AAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTTAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGG > SRR13385771.1909529/1‑300 (MQ=42)
AAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGG > SRR13385771.881797/1‑299 (MQ=43)
TGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAAACAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGCCTTACCCTTAAAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTA > SRR13385771.629344/1‑300 (MQ=47)
TTTTGCTTCTTTTCACCACCCGATTCGGAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGT < SRR13385771.435674/300‑1 (MQ=53)
GCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCTAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACTAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACTTTGTGTTGAGTGTTCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGTGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGTAAATTTAGCATGAT > SRR13385771.476816/1‑301 (MQ=60)
ATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTG > SRR13385771.908297/1‑300 (MQ=60)
CTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATT < SRR13385771.1563084/299‑1 (MQ=60)
TCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTG < SRR13385771.819511/298‑1 (MQ=60)
AAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGT > SRR13385771.761598/1‑301 (MQ=60)
AGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTA < SRR13385771.223074/301‑1 (MQ=60)
CTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTATTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTT‑AAAAAAAAA > SRR13385771.1455331/1‑300 (MQ=60)
CATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAGATTTAGCATGATAGTTGATT < SRR13385771.580215/271‑1 (MQ=60)
TGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAACCGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTTAAAAAAAAAAGTAATTTG > SRR13385771.58442/1‑301 (MQ=60)
ACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTTAAAAAAAAAAGTAATTTGACTG < SRR13385771.1845503/301‑1 (MQ=60)
CATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTTAAAAAAAAAAGTAATTTAACTG > SRR13385771.1524049/1‑300 (MQ=60)
TCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGCTTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGCGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACACCAAATTAAGCATAATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTTAAAAAAAAAAGTAATTTGACTGCACAcata > SRR13385771.1556881/1‑296 (MQ=60)
CAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTG > SRR13385771.1626778/1‑262 (MQ=60)
GGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGATAGCTGGCTTGTTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCATCTTTGTATTTAGTAACCTTGTGTTGAGTGGGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATGACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTTAAAAAAAAAAGTAATTTGACTGCACATGTAATTAGTTGTATCTTTTTT < SRR13385771.281576/300‑1 (MQ=60)
AAAACGGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTTAAAAAAAAAAGTAATTTGACTGCACATGTAATTAGTTGTATCTTTTTTCTGTAATGGGGAAACGGCTAAAT < SRR13385771.1442850/301‑1 (MQ=60)
|
CAAAGGCAGGATGAAAAATTACGCCAAATAGGCAGGTTTTCAATATTAAAGAGTTAAGTATGCAAAATTTACAAAAAGTTAATGGTCAAAGTATAACTATAAAAATATAATAAAACAATAAACAATAACAACTCTCAGAATTGCAAAGCTTGACCCTTTTGCTTCTTTTCACCACCCAATTCGAAGTGCTTACATCTCTTCAAGGTTAATTGGGCTCTAGTCTTACATTTGACACATTCCAATCTCAAAACAACCTTCTTGGTAGTCTTAGCTTTCTTGTGGAAAACAGGCTTGGTTTGACCACCGAAACCAGATTGTTTACGGTCATAACGTCTCTTACCTTGAGCGAACAAGGAAGCCTTACCAGCTTTGTATTGAGTAACCTTGTGTTGAGTGTGCTTACGACAGGTCTTACCCTTACAGTAGGTCTTTCTGGTCTTTGGGACGTTAACTGGTTCAAAATGATATCACAGCAAATTTAGCATGATAGTTGATTGTTAGTAATTGATCTT‑AAAAAAAAAGTAATTTGACTGCACATGTAATTAGTTGTATCTTTTTTCTGTAATGGGGAAACGGCTAAAT > BK006934/381856‑382437
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
