Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
6081 |
0.0 |
0 |
0.0% |
0 |
0.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATTACTGGTATCCCTATTGGTAGTTCGAAACTTATGGGTCACAGGAGCTATCTTTTTGGGGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑TTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTCTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAAGTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGTCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCAT > BK006934/384203‑384796
|
ATTACTGGTATCCCTATTGGTAGTTCGAAACTTATGGGTCATAGGAGCTATCTTTTTGGGGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTT > SRR13385771.308662/1‑301 (MQ=60)
ACTGGTATCCCTATTGGTAGTTCGAAACTTATGGGTCATAGGAGCTATCTTTTTGGGGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTA < SRR13385771.295678/300‑1 (MQ=60)
GTATCCCTATTGGTAGTTCGAAACTTATGGGTCATAGGAGCTATCTTTTTGGGGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGAAGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTCTTACC > SRR13385771.1729878/1‑301 (MQ=60)
ggtaggttggatCTTATGTGTCATAGGAGCTATCGGTGTGGGGCTATTTTTCTTGGTAGCAGGTCAGGTAGTTGTTTATGTCTTCTCTACACAAATCTTGT‑AATGGTTCAAGCACTACTGAGATGGCCGCGTTTTGGGATGCATCTGTAATGTGTTCACATTAAGGATGGTTTACAAGACTGGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGTTTACGTTGTGTATGATAATGGAGTTATGTGAAATGCTTCTTTTTGTGATTACCATATATAGAA < SRR13385771.1268902/288‑1 (MQ=60)
CTTATGGGTCATAGGAGCTATCTTTTTGGGGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACAATATATAGAAAATAGGTGTATAT > SRR13385771.675147/1‑301 (MQ=60)
ATAGGAGCTATCTTTTTGGGGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTA < SRR13385771.337534/301‑1 (MQ=60)
gtattTTTTTGGGGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAACGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAAT < SRR13385771.208576/296‑1 (MQ=60)
ATCTTTTTGGTGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATA < SRR13385771.1840250/300‑1 (MQ=60)
TTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAACT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGCTGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGCATTTGGTGTAAGTGTTAGCACGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTCTGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGAATATGACAAACC > SRR13385771.1400047/1‑301 (MQ=60)
TTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTAGGAATTTGGTGTAGGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGCTTATGATAATGGATTTATGTGAACTGATTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTAAATGTAATAAGAAGGACTATGACAAACCCA > SRR13385771.1059581/1‑300 (MQ=60)
AGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGT < SRR13385771.1876703/300‑1 (MQ=60)
AGGACAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACTACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGTACTATGACAAACCAAAGAGTGAAA < SRR13385771.249/301‑1 (MQ=60)
GGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGAGTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTGGGTGTAAGCGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGGATGATATTGGATTTATGTGAATTGCTTCTTTTTTGTATTACCATATCTAGAACATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAAC > SRR13385771.437190/1‑301 (MQ=60)
TTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTACGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACG > SRR13385771.1743980/1‑301 (MQ=60)
TTATGCCTTCTCTACACAAAT‑CTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCAC < SRR13385771.885473/300‑1 (MQ=60)
GGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCG > SRR13385771.576754/1‑264 (MQ=60)
GCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGGCGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAG < SRR13385771.581506/301‑1 (MQ=60)
GCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTT < SRR13385771.1123302/301‑1 (MQ=60)
CTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTGTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTGCTGTT > SRR13385771.1854975/1‑301 (MQ=60)
TTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATC > SRR13385771.1248607/1‑300 (MQ=60)
TTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCG > SRR13385771.1569176/1‑301 (MQ=60)
GTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCA < SRR13385771.255918/300‑1 (MQ=60)
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AATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAACATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATCAAAGAAACGT > SRR13385771.224353/1‑301 (MQ=60)
ATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATG < SRR13385771.387925/301‑1 (MQ=60)
tgtcttccgacgacgactttggatttggtgtatttgtttgcaagctcgttttctTGGTGTATGATAATGGATTTGTGTGAAATTCTTCTTTTTGTTATTGCCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCTGGACTATTACGAACCAAAGAGTTAAACTCGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTTTACGCTTTAACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCTGTAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAA < SRR13385771.1546175/246‑1 (MQ=60)
TACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTA > SRR13385771.1574218/1‑299 (MQ=60)
CGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACA < SRR13385771.1387042/301‑1 (MQ=60)
GACGACTTGGAAGTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGCTAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACCTCTGTTATCAGCGGAAACAACCCGATCCATAAAAGAAACGTGATGGTAGTTCCCGTAGGTTAGTAAGTAAGATGACA > SRR13385771.1715578/1‑300 (MQ=60)
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TAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAAATATCCTTCTTTAGCCA > SRR13385771.368735/1‑300 (MQ=60)
GTTAGCAAGGACGGTTACGTTGTGTATGATAATGGATTTAAGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGA < SRR13385771.442819/300‑1 (MQ=60)
TAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAA > SRR13385771.237476/1‑300 (MQ=60)
GACGTTGACGTGTTTTATGATAATTGATTTTTGTGAGATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATAGAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCATGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACT < SRR13385771.55220/301‑1 (MQ=60)
GTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCT < SRR13385771.1266985/301‑1 (MQ=60)
ATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTCCACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTATTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGAAGTTTAATAAGTAAGATGAAAAATTATCCTTCTTTAGCAAATTGAAAACAAAAATTCTTAATCTGTTTCCAATT > SRR13385771.1681749/1‑301 (MQ=60)
GGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGCACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTT > SRR13385771.806731/1‑300 (MQ=60)
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ATGATTCTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATAT < SRR13385771.706042/301‑1 (MQ=60)
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CTTTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCAACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATACTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCAGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCAT > SRR13385771.640205/1‑301 (MQ=60)
TTTTTTTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGCCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCA < SRR13385771.1860357/298‑1 (MQ=60)
TTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAATCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAACTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACT < SRR13385771.1814111/140‑1 (MQ=60)
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ATTACTGGTATCCCTATTGGTAGTTCGAAACTTATGGGTCACAGGAGCTATCTTTTTGGGGCTATTTTTCTTTGTAGCAGGCCAGGTATTGGTTTATGCCTTCTCTACACAAAT‑TTGTGAAGGGTTCAAGCACTACTTAGATGGCCTCTTTTTTGGAAGCATCTGTAATGTGTTCACATTAATGATGGTTTACAAGACTTGGGATATGACTACCGACGACGACTTGGAATTTGGTGTAAGTGTTAGCAAGGACGGTGACGTGGTGTATGATAATGGATTTATGTGAAATGCTTCTTTTTTCTATTACCATATATAGAAAATAGGTGTATACTATTAGTTTAATGTAATAAGCAGGACTATGACAAACCAAAGAGTGAAAGTAGCCGTTTCCACGTTTTAACGGCTTGTGTACACTTTGACAGTCAATCAGCGTAGTGACTTCTTTTATCAGCGGAAACAACCATATCCATAAAAGAAACGTGATGGTCGTTCCCGTAGTTTATTAAGTAAGATGACAAATTATCCTTCTTTAGTCAATTGAAAACAAAACTTCTTAATCTGTTTCCAATGTTTTAAAGTCGCTCATATGTTCAT > BK006934/384203‑384796
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
