Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
6081 |
0.0 |
0 |
0.0% |
0 |
0.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTTGAGGCAATTAGGAAATAATGAAATAGCGAAGAGTGACAAGTGCCGTTACATTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAAAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAGGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATTTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAATAGTATCCACGGGAAATGAACTATCAGCAGAGTCTATTGCTAAAATTTCTGAGACCGCTAAAGAAAC > BK006942/326381‑326968
|
GTGGAGGCAATTAGGAAATAATGAAATAGCTAAGAGTGACAAGTGCCGTTACATTTGGTAAGTACTATACAAGATGGATGCCGACTGGTACAATGCGCAAACTGCAAAATTGTATAATGTTGATGGGGTAGATAACACGGTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGAGTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGGCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTGCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAATC < SRR13385771.1029336/300‑1 (MQ=60)
TTGAGGCAATTAGGAAATAATGAAATAGCTAAGAGTGACAAGTGCCGTTACATTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTACATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGACGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTG > SRR13385771.217311/1‑301 (MQ=60)
CAATTAGGAAATAATGAAATAGCTAAGAGTGACAAGTGCCGTTACATTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGT > SRR13385771.1729495/1‑301 (MQ=60)
TAGGAAATAATGAAATAGCTAAGAGTGACAAGTGCCGTTACATTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCC > SRR13385771.1314058/1‑301 (MQ=60)
AAATAGCTAAGAGTGACAAGTGCCGTTACATTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGA < SRR13385771.1454129/301‑1 (MQ=60)
AGCTAAGAGTGACAAGTGCCGTTACCTTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCACCCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGCAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGCCATG > SRR13385771.6923/1‑301 (MQ=60)
ACATTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGC < SRR13385771.1221290/301‑1 (MQ=60)
ACATTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCGATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGG < SRR13385771.1736409/300‑1 (MQ=60)
AGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACGGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCA < SRR13385771.1677034/260‑1 (MQ=60)
ATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCCAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATATTATGATTATTGATTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGCCAGTTCAGGCACCCGAGGTTGATATGGCATCAT > SRR13385771.1500611/1‑301 (MQ=60)
GATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTACATCCTCATGATTTGCAACACAGAATGTTTCCCTTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGCCATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGCGGTTGATATGGAATCATCA > SRR13385771.597416/1‑300 (MQ=60)
AATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACT > SRR13385771.874153/1‑301 (MQ=60)
GCGCAAACTGCAAAAGTTGATTATGTTGATGGTGTGGAGAACACGTTGGTGTGATTGTTAGGGGAGAGATTAAGTTCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAGTCTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTT < SRR13385771.210963/300‑1 (MQ=60)
AAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGAGAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTC > SRR13385771.1826656/1‑301 (MQ=60)
ACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCC > SRR13385771.1363709/1‑300 (MQ=60)
GCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAA < SRR13385771.1172432/299‑1 (MQ=60)
AAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGG < SRR13385771.1574003/301‑1 (MQ=60)
AATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGA > SRR13385771.374477/1‑300 (MQ=60)
GTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAG > SRR13385771.1481027/1‑299 (MQ=60)
ACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAGAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTT > SRR13385771.1758206/1‑301 (MQ=60)
GGAGAGATTAAGATCTTATGAGTATTGCTTTTGATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGGTTCCATTTCGGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCTTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGTAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGAT < SRR13385771.1727035/301‑1 (MQ=60)
TATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTG < SRR13385771.1092603/300‑1 (MQ=60)
ATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTACTGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGA > SRR13385771.159984/1‑300 (MQ=60)
ATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAAGTCAACCGTAAATCCGCATGATGTGCAAAACAGAATGTTTCCATGTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTGGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACA < SRR13385771.610846/301‑1 (MQ=60)
ATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAAGAGTTGCAAATGCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATGTCTGAAGAAAATGAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACAGGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTGGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATGGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACA < SRR13385771.115122/301‑1 (MQ=60)
ATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTT < SRR13385771.1494543/301‑1 (MQ=60)
GGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGCGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAAT > SRR13385771.510564/1‑301 (MQ=60)
TAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGG > SRR13385771.1662260/1‑206 (MQ=60)
ACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAACAAACGCAT > SRR13385771.1076642/1‑301 (MQ=60)
AATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACC > SRR13385771.1482775/1‑300 (MQ=60)
TTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAAC < SRR13385771.1633320/258‑1 (MQ=60)
CAAATTCAAACGTAAATCCTAATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGACGCAAATTAACGAAGAATCAAAAACTGTAAAGAGCCCTATTATCACAGACATGACAACTGAAGAGGAAGTTCAGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATAAAACTTTAATGGTAAATATTGGTCCAACTGGAAAAGGATGAGCAAAGGAAGAGGAATTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCATTTATTTTTGAAACAGTAGAAAGTGATGGAATCTTCACAAAACGACTTACCATTCCAAA > SRR13385771.668371/1‑300 (MQ=60)
AAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACTGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGTACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGTTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCAGTCCAAAT < SRR13385771.330326/301‑1 (MQ=60)
CAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGG > SRR13385771.653171/1‑160 (MQ=60)
CATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAATAGTATCCACGGGAAATGAA > SRR13385771.618078/1‑300 (MQ=60)
AACAGAATGTTTCAATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGAACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAACGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGCTGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAATAGTATCCAAGGGAAATGAACTATAAGCAGAGT > SRR13385771.1266136/1‑301 (MQ=60)
TCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGATCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTCTTGTTTTAACTATTGCTGAACAGAATGTTCCTTTCTTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAACTAGTACCCACGGTAAATCAACTATCAGCAGCGCCTATTGCTAA > SRR13385771.1278681/1‑300 (MQ=60)
CCATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAATAGTATCCACGGGAAATGAACTATCAGCAGAGTCTATTGCTAAAA < SRR13385771.1547050/301‑1 (MQ=60)
ATTTCTGAAGAAAATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGCAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAACCAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAATAGTATCCACGGGAAATGAACTATCAGCAGAGTCTATTGCTAAAATT > SRR13385771.333779/1‑301 (MQ=60)
AATTAACGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAATAGTATCCACGGGAAATGAACTATCAGCAGAGTCTATTGCTAAAATTTCTGAGACCGC > SRR13385771.848273/1‑300 (MQ=60)
CGAAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAAT < SRR13385771.472020/237‑1 (MQ=60)
AAGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATCTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAATAGTATCCACGGGAAATGAACTATCAGCAGAGTCTATTGCTAAAATTTCTGAGACCGCTAAAGAAAC < SRR13385771.1760424/301‑1 (MQ=60)
|
GTTGAGGCAATTAGGAAATAATGAAATAGCGAAGAGTGACAAGTGCCGTTACATTTTTGAAGTACTATACAAGATTGATCCCGACTGGGACAATGCGCAAACTGCAAAATTTTATAATGTTGATGGTGTAGATAACACGTTGGCCTCATTGTTAGGGGAAAGATTAAGATCTTATGATTATTGCTTTTTATCTGGTCAATTAGATCCTACTGCAATATTTGCAAATTCAACCGTAAATCCTCATGATTTGCAAAACAGAATGTTTCCATTTCTGAAGAAAATTAACGAGGAATCCAAAACTGTAATGTGGCCTATTATCACAGACATGACAACTGGAGAGGCAGTTCCGGCACCCGAGGTTGATATGGAATCATCAAACTTTAATGGTAACTTTTGGTCCAACTGGAATAGGTTGAGCAAAGGAAGAGGTTTTGTTTTAACTATTGCTGAAAAGGATGTTCCTTTATTTTTGAAACAGTTGAAAGTGATGGAATTTTCAAAAAACGAATTACCATTCCAAATAGTATCCACGGGAAATGAACTATCAGCAGAGTCTATTGCTAAAATTTCTGAGACCGCTAAAGAAAC > BK006942/326381‑326968
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
