Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
6054 |
0.0 |
0 |
0.0% |
0 |
0.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TGGTGGAAAGCCTTCCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGGACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCAGTCTGGCCGCATTTTTGACAGCGATCTTTTTTTGTATCAAGACTTCTTCCAATGTCAGGATTT‑A‑T‑TTTCATGATGTATGGGTGTATCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAGAGAATGCTATGGAAAATAATA‑‑TGT‑‑AGCAACATAGCCAACTAATTGCCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAAGTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGG > BK006934/382888‑383466
|
TGGTGGAAAGCCTTCCCCCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAACCCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATA‑‑TGT‑‑G < SRR13385772.382294/299‑1 (MQ=60)
CCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTTTTGGTACGATGCAGCGTCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCTAGACTTCTACCAATGTCATGATTT‑ATT‑TTTCATGAGTTATGGGTGTTTCTGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAA > SRR13385772.314700/1‑300 (MQ=60)
CGCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCTTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCA < SRR13385772.475384/285‑1 (MQ=60)
ATACCGTCGACCAACTCAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTATGCACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACCGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTT < SRR13385772.263075/301‑1 (MQ=60)
gggggggggggggggggggggggggggggggggggcgcgggagggggcggggcgccggctgagcatacgcgcgggTGGTACGGTGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATAGTGTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTCT‑T‑TTTCATGACGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTCTTTTGCCGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGCAACTAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCCTTGCATTACATTTTGGCCGTACTATT > SRR13385772.90668/76‑301 (MQ=60)
AACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATT > SRR13385772.90686/1‑301 (MQ=60)
CTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGCTGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTT > SRR13385772.197390/1‑300 (MQ=60)
GCGTTGCCGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGT > SRR13385772.487172/1‑301 (MQ=60)
CGCACCGACGAACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCCGTACTATTTACAATGCCATGTTTTATGT > SRR13385772.230780/1‑301 (MQ=60)
TCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCTGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGT > SRR13385772.444493/1‑301 (MQ=60)
GAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCC < SRR13385772.1005386/299‑1 (MQ=60)
AACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTGACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGTTGTTGCCCGCT > SRR13385772.247823/1‑301 (MQ=60)
ACGCACTGGTGGTACGATGCAGCGGCGGTCGGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCGACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCT < SRR13385772.1258953/301‑1 (MQ=60)
CCTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCT < SRR13385772.852437/301‑1 (MQ=60)
GGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCTTGTGTGACAGGTATATTTGTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑A‑TGTGTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGTATGTCACTGTCTTTTATGTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACAGAACCAATTAATTATCATGGCATTAAATTGTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTAGTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAA < SRR13385772.1212270/300‑1 (MQ=60)
GCCGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTTACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAAT < SRR13385772.62339/301‑1 (MQ=60)
GCGGCTGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATT < SRR13385772.787621/301‑1 (MQ=60)
actGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTC > SRR13385772.1105420/4‑301 (MQ=60)
CATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACA > SRR13385772.788077/1‑300 (MQ=60)
TTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGA < SRR13385772.1123672/300‑1 (MQ=60)
TCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACT > SRR13385772.499474/1‑169 (MQ=60)
ACTTCTACCAATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAACTTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTGTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGAATCCATTTTGGTAT > SRR13385772.1076368/1‑301 (MQ=60)
ATGTCAGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGC > SRR13385772.1004764/1‑300 (MQ=60)
AGGATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTTGCAGTACTATTTAAAATGTCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAATTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTT > SRR13385772.203368/1‑301 (MQ=60)
ATTT‑ATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCAT < SRR13385772.1040294/301‑1 (MQ=60)
TGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAA > SRR13385772.73706/1‑300 (MQ=60)
GGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTC > SRR13385772.840424/1‑300 (MQ=60)
TTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTG > SRR13385772.847964/1‑301 (MQ=60)
TTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTG < SRR13385772.784674/300‑1 (MQ=60)
GGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGC < SRR13385772.635325/301‑1 (MQ=60)
TATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTACAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAACAAGTCAAAGCTACACTGGCATCCTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGG > SRR13385772.166611/1‑301 (MQ=60)
TATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGG > SRR13385772.713745/1‑301 (MQ=60)
TATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGG > SRR13385772.65103/1‑301 (MQ=60)
TAAAATAATA‑‑TGTGGAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCT < SRR13385772.298479/289‑1 (MQ=60)
T‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTACAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAACAGGATCCATTTTGGTATACAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAACAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCA > SRR13385772.893148/1‑278 (MQ=60)
|
TGGTGGAAAGCCTTCCCTCCCCCTGGCGGAACCCATCATCCCGTCGAACAACTAAACCGTCAGCGTTGCCGCACCGACGGACGTCTCTCTAGAGGTCGTCTCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCAGTCTGGCCGCATTTTTGACAGCGATCTTTTTTTGTATCAAGACTTCTTCCAATGTCAGGATTT‑A‑T‑TTTCATGATGTATGGGTGTATCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAGAGAATGCTATGGAAAATAATA‑‑TGT‑‑AGCAACATAGCCAACTAATTGCCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAAGTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGG > BK006934/382888‑383466
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
