Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
6054 |
0.0 |
0 |
0.0% |
0 |
0.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCAGTCTGGCCGCATTTTTGACAGCGATCTTTTTTTGTATCAAGACTTCTTCCAATGTCAGGATTTA‑T‑TTTCATGATGTATGGGTGTATCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAGAGAATGCTATGGAAAATAATA‑‑TGT‑‑AGCAACATAGCCAACTAATTGCCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAAGTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTTAGTGATTTTGCT > BK006934/382988‑383558
|
TCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCTGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGT > SRR13385772.444493/1‑301 (MQ=60)
GAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCC < SRR13385772.1005386/299‑1 (MQ=60)
AACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTGACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGTTGTTGCCCGCT > SRR13385772.247823/1‑301 (MQ=60)
ACGCACTGGTGGTACGATGCAGCGGCGGTCGGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCGACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCT < SRR13385772.1258953/301‑1 (MQ=60)
CCTGTTGGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCT < SRR13385772.852437/301‑1 (MQ=60)
GGTACGATGCAGCGGCGGTCTGACTGCTTGTGTGACAGGTATATTTGTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTA‑TGTGTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGTATGTCACTGTCTTTTATGTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACAGAACCAATTAATTATCATGGCATTAAATTGTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTAGTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAA < SRR13385772.1212270/300‑1 (MQ=60)
GCCGCGGCGGTCTGACTGCATTTTTTACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAAT < SRR13385772.62339/301‑1 (MQ=60)
GCGGCTGTCTGACTGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATT < SRR13385772.787621/301‑1 (MQ=60)
actGCATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTC > SRR13385772.1105420/4‑301 (MQ=60)
CATTTTTGACAGCGATATTTTTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACA > SRR13385772.788077/1‑300 (MQ=60)
TTTTGTATCAAGACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGA < SRR13385772.1123672/300‑1 (MQ=60)
ACTTCTACCAATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAACTTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTGTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGAATCCATTTTGGTAT > SRR13385772.1076368/1‑301 (MQ=60)
ATGTCAGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGC > SRR13385772.1004764/1‑300 (MQ=60)
AGGATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTTGCAGTACTATTTAAAATGTCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAATTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTT > SRR13385772.203368/1‑301 (MQ=60)
ATTTATT‑TTTCATGATGTATGGGTGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCAT < SRR13385772.1040294/301‑1 (MQ=60)
TGTCTCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAA > SRR13385772.73706/1‑300 (MQ=60)
GGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTC > SRR13385772.840424/1‑300 (MQ=60)
TTTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTG > SRR13385772.847964/1‑301 (MQ=60)
TTTATTTTGAAGTTTGTGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTG < SRR13385772.784674/300‑1 (MQ=60)
GGACAAAGAATGCTATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGC < SRR13385772.635325/301‑1 (MQ=60)
TATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTACAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAACAAGTCAAAGCTACACTGGCATCCTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGG > SRR13385772.166611/1‑301 (MQ=60)
TATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGG > SRR13385772.65103/1‑301 (MQ=60)
TATGGAAAATAATATGTGT‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGG > SRR13385772.713745/1‑301 (MQ=60)
TAAAATAATA‑‑TGTGGAGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCT < SRR13385772.298479/289‑1 (MQ=60)
T‑‑AGCAACATAACCAATTAATTATCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTACAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAACAGGATCCATTTTGGTATACAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAACAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCA > SRR13385772.893148/1‑278 (MQ=60)
accaattaattatCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATC > SRR13385772.269465/14‑300 (MQ=60)
agggtgtatacattCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATT < SRR13385772.45208/171‑1 (MQ=60)
attatCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGT > SRR13385772.762260/6‑301 (MQ=60)
CAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTG > SRR13385772.747468/1‑300 (MQ=60)
GTACTATTTTAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTAACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATA < SRR13385772.38101/301‑1 (MQ=60)
CTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTCCCGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCCCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCCCAAGACACGCAATCAAAAAGGATCCCTTTTGGTATAAAAATAGCCTATTGCATAAATTAACTAAAAAAATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACCGTTTTTTCAAAGCTCTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATTCAAACTATTATCAAAAATTGTTGTTTTGTTAATACCAAAGCTGCTATA > SRR13385772.802617/1‑300 (MQ=60)
AAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAA < SRR13385772.649061/301‑1 (MQ=60)
TTTATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTTGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTT > SRR13385772.208217/1‑299 (MQ=60)
TATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCCAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTTAGTG > SRR13385772.1255359/1‑301 (MQ=60)
ATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTATCTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTTAGTG < SRR13385772.234692/300‑1 (MQ=60)
ATGTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTTAGTGA < SRR13385772.298480/301‑1 (MQ=60)
GTTGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTTAGTGATT < SRR13385772.948993/301‑1 (MQ=60)
TGTTACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTTAGTGATTTT > SRR13385772.368337/1‑301 (MQ=60)
ACAGTAGTTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTTAGTGATTTTGCT < SRR13385772.337199/300‑1 (MQ=60)
|
TCTCCGTCTGAACATACGCACTGTTGGTACGATGCAGCGGCAGTCTGGCCGCATTTTTGACAGCGATCTTTTTTTGTATCAAGACTTCTTCCAATGTCAGGATTTA‑T‑TTTCATGATGTATGGGTGTATCGGATGTTCGGATGTCACTGTCTTTTATTTTGAAGTTTGTGACAGAGAATGCTATGGAAAATAATA‑‑TGT‑‑AGCAACATAGCCAACTAATTGCCATTGCATTAAATTTTGGCAGTACTATTTAAAATGCCATGTTTTATGTTGTTACAGTAAGTTATTGACATTCTTCTGGTGTTGCCCGCTTCGCTTTCTTAAAACGGTTAAATATTGAAAAAGTTTCACAAGACACGAAATCAAAAAGGATCCATTTTGGTATAAAAATAGCATATTGCATAACTTAACTAAAAAGATTAAAAAAAGTCAAAGCTACACTGGCATACTTTGAACTGTTTTTTCAAAGCTGTCTCCACGTGGAAAGTTTATTTCATCAAAACTATTATCAAAAATTGTGGTTTTGTTAATACAAAAGCTGATATATATATAATATGGCATTTAGTGATTTTGCT > BK006934/382988‑383558
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
