| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 1,886,669 | IS1 (–) +9 bp | intergenic (‑499/+162) | yobF ← / ← yebO | hypothetical protein/hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1886669 = | 9 (0.210) | 91 (1.870) | 64/150 | 0.0 | 89.9% | intergenic (‑499/+170) | yobF/yebO | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 2035093 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
| * | ? | REL606 | = 1886677 | 9 (0.210) | 60 (1.240) | 45/150 | 0.1 | 85.4% | intergenic (‑507/+162) | yobF/yebO | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 1974039 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
GAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/1886603‑1886677‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < REL606/1974039‑1973965 GAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAG > 1:1246450/1‑76 AAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGG > 2:607354/1‑76 AAACGTTTCGCTAANAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGG > 1:835923/1‑76 AACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGT > 2:1295697/1‑76 GTTTCGCTAATAAANAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAAT > 1:838709/1‑76 TTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATG < 1:1302629/76‑1 TTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGA < 2:719277/76‑1 CGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACT > 1:1104341/1‑76 GCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTC < 1:781868/76‑1 GCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTC > 1:1417402/1‑76 CTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCC < 2:79160/76‑1 AATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAA < 2:853460/76‑1 AATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAA < 1:1280326/76‑1 ATAAATAATACCACGCTTAATCACAGATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAAC > 1:103159/1‑76 ATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAAC < 1:508574/76‑1 AAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTT < 1:1491979/76‑1 AAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTT > 2:544550/1‑76 AATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTA > 1:438823/1‑76 AATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTA > 1:43989/1‑76 AATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTA > 2:264074/1‑76 AATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTG > 1:84374/1‑76 ACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:1000545/1‑76 CCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 1:567946/1‑76 ACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 2:1506748/1‑76 CGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 2:344512/76‑1 CGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT > 2:642532/1‑76 TTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:284037/1‑76 TAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 2:1530263/76‑1 ATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG > 2:1073857/1‑76 CACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 2:888919/76‑1 CAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 2:969454/76‑1 AAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 1:1014517/76‑1 ATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 1:736974/1‑76 TCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 1:703954/76‑1 CCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 2:666337/76‑1 CGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:866040/1‑76 CGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT < 2:217603/76‑1 ATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC < 1:960421/76‑1 ATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTCTATGTTCAGATAATGC > 1:524950/1‑76 ACATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 1:933871/76‑1 CATCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 2:421344/76‑1 TCCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACT > 2:748069/1‑76 CCTGATAAATTAATGAGGAAGGTAATGGCTGCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT < 2:816606/76‑1 CCTAATAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTT < 2:170308/76‑1 AATAAATGAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCACGATGACTTTGT < 2:1099184/76‑1 TAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 1:471712/76‑1 TAAATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 2:794510/76‑1 ATTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC < 1:1029534/76‑1 TTAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 2:296320/76‑1 TAATGAGGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG > 1:1500101/1‑76 GGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC < 1:876519/76‑1 GGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC < 2:1106184/76‑1 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATTACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 2:771402/1‑76 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:34387/1‑76 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:1170881/1‑76 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:1539597/1‑76 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 2:627668/1‑76 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < 1:727592/76‑1 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:867561/1‑76 AGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATAACTTTGTCATGCAGCTCCACCGc > 2:771403/1‑75 GAAACGTTTCGCTAATAAATAATACCACGCTTAATCACAAATCCGATGTAAACATCCTAATAAATTAATGAGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/1886603‑1886677‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < REL606/1974039‑1973965 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |