Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F13 I0 R1
|
213 |
60.4 |
2554362 |
98.6% |
2518600 |
147.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_002947_CJ‑RC |
4,768,243 |
C→A |
59.9% |
L57M (CTG→ATG) |
tpaK → |
probable terephthalate transporter, MFS superfamily protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_002947_CJ‑RC | 4,768,243 | 0 | C | A | 59.9%
| 23.9
/ 70.4
| 50 | L57M (CTG→ATG) | tpaK | probable terephthalate transporter, MFS superfamily protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/9); new base A (19/11); total (30/20) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.72e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
TGCCGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGT > NC_002947_CJ‑RC/4768103‑4768387
|
tGCCGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGaaa > 5:294228/1‑149 (MQ=255)
ccGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGaaa > 3:275022/1‑147 (MQ=255)
cGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAg < 7:47165/149‑1 (MQ=255)
tCATCCATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTAAATCGTGATCGCCCTGTGTGTGGTGTTCATGTTCATCGACGGCTTCTACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCACACATCGCCTAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCt < 1:261792/148‑1 (MQ=255)
cATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTc < 8:318993/148‑1 (MQ=255)
cATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTc < 7:24965/148‑1 (MQ=255)
aTCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCgg > 5:47851/1‑149 (MQ=255)
aTCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCgg > 6:137237/1‑149 (MQ=255)
tCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCggg < 4:25329/149‑1 (MQ=255)
gcgGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTg > 1:7510/1‑136 (MQ=255)
gcgGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTg < 2:7510/136‑1 (MQ=255)
gAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTccgccg > 8:199572/1‑149 (MQ=255)
tCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATg < 5:278487/149‑1 (MQ=255)
tCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATg < 4:21095/149‑1 (MQ=255)
tCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATg > 3:138541/1‑149 (MQ=255)
gTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATgg > 4:172036/1‑148 (MQ=255)
tGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTc < 6:206577/149‑1 (MQ=255)
gATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCg > 1:272955/1‑149 (MQ=255)
aTCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCgg > 6:148821/1‑149 (MQ=255)
cccTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTAt > 2:147765/1‑149 (MQ=255)
cTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCt < 4:138541/149‑1 (MQ=255)
gtgtgGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACCCCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTgg > 5:242736/1‑149 (MQ=255)
tgtgGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTgg < 2:4639/148‑1 (MQ=255)
gggTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGctc > 4:89055/1‑149 (MQ=255)
tggtCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTcg > 2:262453/1‑149 (MQ=255)
gTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGt > 5:106500/1‑149 (MQ=255)
cATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTcc > 5:244935/1‑148 (MQ=255)
aTCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGa < 4:308808/149‑1 (MQ=255)
ggCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGtt > 8:201358/1‑149 (MQ=255)
ttCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCgg > 1:247428/1‑149 (MQ=255)
gACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCa > 2:41642/1‑149 (MQ=255)
acCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCAccg > 2:312863/1‑149 (MQ=255)
cAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCAccgccg < 6:294228/149‑1 (MQ=255)
agagCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCAccgccg > 5:320111/1‑148 (MQ=255)
agagCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCAccgccg > 4:160723/1‑148 (MQ=255)
agagCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCAccgccg > 7:252146/1‑148 (MQ=255)
gagCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGga > 3:56031/1‑149 (MQ=255)
tCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATc > 5:245294/1‑149 (MQ=255)
cTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCa > 5:98559/1‑149 (MQ=255)
cTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCa > 5:153088/1‑149 (MQ=255)
cTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCa < 6:46954/149‑1 (MQ=255)
cgcCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACg < 2:272955/149‑1 (MQ=255)
cgcCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACg < 1:262453/149‑1 (MQ=255)
tCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCTCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTc < 7:129876/149‑1 (MQ=255)
tCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTc < 5:137237/149‑1 (MQ=255)
cGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCgcgc > 1:192883/1‑149 (MQ=255)
aggagTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTc < 7:201358/149‑1 (MQ=255)
aggagTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTc < 6:106500/149‑1 (MQ=255)
gggCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCAGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGt > 5:296935/1‑149 (MQ=255)
gggCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGt > 5:415/1‑149 (MQ=255)
|
TGCCGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGT > NC_002947_CJ‑RC/4768103‑4768387
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTGCCGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTT > NC_002947_CJ‑RC/4768102‑4768388
|
CTGCCGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAAC > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21606:7642:16684/1‑151 (MQ=60)
GCCGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAAC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21305:3562:14856/1‑149 (MQ=60)
CCGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGG < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11410:11039:20388/151‑1 (MQ=60)
TTCATCCATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTAAATCGTGATCGCCCTGTGTGTGGTGTTCATGTTCATCGACGGCTTCTACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCACACATCGCCTAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTC < NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21210:11925:13291/150‑1 (MQ=60)
TCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11406:5309:8459/150‑1 (MQ=60)
CATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGG > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11412:17580:1037/1‑151 (MQ=60)
CGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:11102:19113:11849/1‑138 (MQ=60)
ATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21603:2040:11073/151‑1 (MQ=60)
ATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGG > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11307:20651:19476/1‑151 (MQ=60)
TGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGG > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21301:20543:3739/1‑151 (MQ=60)
TGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACCCCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21507:10904:12454/1‑151 (MQ=60)
TGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTC > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11512:12356:14616/1‑151 (MQ=60)
TCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCG > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21508:7706:3215/1‑150 (MQ=60)
CTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGC > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21207:3346:9664/1‑151 (MQ=60)
CAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGG > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21612:9631:16474/1‑150 (MQ=60)
CAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGG > NB501016:282:H2V7GAFX2:4:21508:16293:1679/1‑150 (MQ=60)
AGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGAT > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:11201:19578:17727/1‑151 (MQ=60)
ATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCC > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21508:6220:4750/1‑151 (MQ=60)
GCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCAC > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11510:16188:19640/1‑151 (MQ=60)
GCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCAC > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11610:1231:9907/1‑151 (MQ=60)
GCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGG < NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21210:8125:15933/151‑1 (MQ=60)
ATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCTCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:11605:8816:4624/151‑1 (MQ=60)
ATCGCCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11607:24155:2863/151‑1 (MQ=60)
CCGAGGAGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCT > NB501016:282:H2V7GAFX2:1:21107:20792:1663/1‑151 (MQ=60)
GAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCG < NB501016:282:H2V7GAFX2:4:21409:25959:3199/151‑1 (MQ=60)
AGTGGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCAACCTCATCTTCGCGCTCGGCAC > NB501016:282:H2V7GAFX2:2:21205:25383:2657/1‑151 (MQ=60)
GGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCAGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTT > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:21607:7983:8354/1‑151 (MQ=60)
GGGGCATGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTT > NB501016:282:H2V7GAFX2:3:11401:25558:3040/1‑151 (MQ=60)
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CTGCCGGATTTCATCGATTCGCGGCCAGTGAGTCGATACCAGTACATCGTGATCGCCCTGTGTGGGGTGGTCATGTTCATCGACGGCTTCGACACCCAGAGCATCAGCTACATGGCGCCCCACATCGCCGAGGAGTGGGGCCTGTCGAAACAGGTGCTCGGGCCCATCTTCTCCGCCGCTCTCGCCGGTCTCATGGTCGGCTATCTGGCGCTCTCGCCGCTGTCCGAGCGGTTCGGCCACCGCCGGATGATCCTCACGAGCACGGTCATCTTCGCGCTCGGCACGTT > NC_002947_CJ‑RC/4768102‑4768388
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
